Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBY8

CLN8, Protein CLN8, humanhuman

Predictions only

Length 286 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLN8Q9UBY8 L3HYPDH-201ENST00000247194 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CLN8Q9UBY8 GAS7-210ENST00000579158 1528 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CLN8Q9UBY8 LRCH2-202ENST00000538422 4868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CLN8Q9UBY8 MAGED2-213ENST00000627068 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CLN8Q9UBY8 WNT8B-201ENST00000343737 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CLN8Q9UBY8 KRT8-216ENST00000552551 2126 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CLN8Q9UBY8 HEBP2-204ENST00000607197 10014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CLN8Q9UBY8 PTN-201ENST00000348225 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CLN8Q9UBY8 CGRRF1-201ENST00000216420 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CLN8Q9UBY8 PTPDC1-202ENST00000375360 4517 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CLN8Q9UBY8 OSM-201ENST00000215781 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CLN8Q9UBY8 PYDC1-201ENST00000302964 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CLN8Q9UBY8 AGTRAP-201ENST00000314340 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CLN8Q9UBY8 ARID3C-201ENST00000378909 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CLN8Q9UBY8 AL162457.2-201ENST00000447909 937 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CLN8Q9UBY8 AC008825.1-201ENST00000504398 452 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CLN8Q9UBY8 DRAP1-205ENST00000527119 581 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CLN8Q9UBY8 YIPF2-209ENST00000590329 958 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CLN8Q9UBY8 AC239803.1-201ENST00000594189 1278 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CLN8Q9UBY8 RPARP-AS1-206ENST00000596366 631 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CLN8Q9UBY8 C16orf74-207ENST00000602914 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CLN8Q9UBY8 ZNF534-205ENST00000617900 1085 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CLN8Q9UBY8 MZF1-206ENST00000599369 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CLN8Q9UBY8 IGSF9B-206ENST00000533871 5050 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CLN8Q9UBY8 KLC1-217ENST00000554280 2426 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CLN8Q9UBY8 PDE6B-202ENST00000429163 2120 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CLN8Q9UBY8 CCK-202ENST00000396169 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CLN8Q9UBY8 DACT2-201ENST00000366795 2942 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CLN8Q9UBY8 ZNF696-201ENST00000330143 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CLN8Q9UBY8 RASSF1-201ENST00000327761 1757 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CLN8Q9UBY8 NAP1L5-201ENST00000323061 2321 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CLN8Q9UBY8 DISP3-202ENST00000304391 1495 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CLN8Q9UBY8 MYOZ3-203ENST00000517768 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CLN8Q9UBY8 PDE1C-206ENST00000396193 5109 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CLN8Q9UBY8 ARRB1-201ENST00000360025 1895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CLN8Q9UBY8 LRRC25-201ENST00000339007 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CLN8Q9UBY8 P2RY6-201ENST00000349767 1700 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CLN8Q9UBY8 IFRD2-204ENST00000436390 2275 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CLN8Q9UBY8 PHKA2-201ENST00000379942 5559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CLN8Q9UBY8 C19orf25-207ENST00000588871 2128 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CLN8Q9UBY8 BSG-201ENST00000333511 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CLN8Q9UBY8 KLHDC4-227ENST00000622456 1422 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CLN8Q9UBY8 OSR2-201ENST00000297565 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CLN8Q9UBY8 VASH1-201ENST00000167106 5728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CLN8Q9UBY8 HDAC11-AS1-201ENST00000424112 515 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CLN8Q9UBY8 DMKN-208ENST00000424570 1293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CLN8Q9UBY8 LINC01534-202ENST00000433232 554 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CLN8Q9UBY8 RNF146-204ENST00000476956 884 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CLN8Q9UBY8 GEMIN7-203ENST00000591607 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CLN8Q9UBY8 AC243829.1-201ENST00000615128 1059 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CLN8Q9UBY8 DNAJB6-218ENST00000634080 1005 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CLN8Q9UBY8 ZNF395-211ENST00000523202 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CLN8Q9UBY8 BDKRB1-202ENST00000553356 1526 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CLN8Q9UBY8 SMPD1-203ENST00000527275 2188 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CLN8Q9UBY8 CARD10-202ENST00000403299 4113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CLN8Q9UBY8 DDX51-202ENST00000397333 4718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
CLN8Q9UBY8 ASIC3-202ENST00000349064 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
CLN8Q9UBY8 DCHS2-201ENST00000339452 5064 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
CLN8Q9UBY8 LRRC36-201ENST00000329956 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
CLN8Q9UBY8 ETV7-202ENST00000340181 1719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
CLN8Q9UBY8 FARSA-202ENST00000423140 1720 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.06
CLN8Q9UBY8 TBX18-202ENST00000369663 6245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CLN8Q9UBY8 SEMA6D-205ENST00000389425 2318 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CLN8Q9UBY8 SH3BP2-202ENST00000435136 2318 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CLN8Q9UBY8 TMC6-203ENST00000392467 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CLN8Q9UBY8 KMT5A-201ENST00000330479 3069 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CLN8Q9UBY8 TBX2-201ENST00000240328 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CLN8Q9UBY8 PIF1-205ENST00000559239 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CLN8Q9UBY8 CD55-206ENST00000391921 2433 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CLN8Q9UBY8 GTF2H4-202ENST00000376316 1673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CLN8Q9UBY8 FBXW11-202ENST00000296933 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CLN8Q9UBY8 RAB29-205ENST00000446390 1441 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CLN8Q9UBY8 HOXB1-202ENST00000577092 1414 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
CLN8Q9UBY8 VPS37B-201ENST00000267202 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CLN8Q9UBY8 SLC35F3-201ENST00000366617 2762 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CLN8Q9UBY8 SERPINF2-202ENST00000382061 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CLN8Q9UBY8 STIM2-202ENST00000465503 3613 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CLN8Q9UBY8 HEXIM2-201ENST00000307275 1528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CLN8Q9UBY8 GUK1-204ENST00000366721 689 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CLN8Q9UBY8 ABCD1-202ENST00000370129 1016 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CLN8Q9UBY8 STARP1-201ENST00000397973 869 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
CLN8Q9UBY8 AL109797.1-201ENST00000452501 835 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CLN8Q9UBY8 SNX5-210ENST00000481323 562 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CLN8Q9UBY8 AP003396.1-201ENST00000501918 507 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CLN8Q9UBY8 CD81-212ENST00000526072 1172 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CLN8Q9UBY8 GOLGA2P10-205ENST00000618267 983 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CLN8Q9UBY8 C10orf142-201ENST00000619243 1110 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CLN8Q9UBY8 MYC-208ENST00000641036 567 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
CLN8Q9UBY8 ANKRD10-201ENST00000267339 2495 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CLN8Q9UBY8 SCD5-201ENST00000273908 1995 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CLN8Q9UBY8 GLYCTK-202ENST00000436784 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CLN8Q9UBY8 CLN3-204ENST00000357857 1720 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CLN8Q9UBY8 MAPKAP1-205ENST00000373503 3045 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CLN8Q9UBY8 FBXL18-205ENST00000620087 2076 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CLN8Q9UBY8 ZNRF2-201ENST00000323037 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CLN8Q9UBY8 EXOSC3-201ENST00000327304 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CLN8Q9UBY8 CHTOP-207ENST00000614256 1840 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CLN8Q9UBY8 AL357033.4-201ENST00000617703 1807 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
CLN8Q9UBY8 IVNS1ABP-202ENST00000367498 4199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CLN8Q9UBY8 ARHGAP8-202ENST00000356099 1584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.1 ms