Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBP4

DKK3, Dickkopf-related protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 350 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DKK3Q9UBP4 MUTYH-202ENST00000355498 1776 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
DKK3Q9UBP4 AC060780.1-201ENST00000635600 1782 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
DKK3Q9UBP4 NOL3-201ENST00000268605 1394 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.32■□□□□ 0.52
DKK3Q9UBP4 SH2B3-201ENST00000341259 5406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
DKK3Q9UBP4 DDT-202ENST00000398344 713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
DKK3Q9UBP4 DDT-203ENST00000403754 569 ntTSL 3 BASIC18.32■□□□□ 0.52
DKK3Q9UBP4 DDT-206ENST00000430101 573 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
DKK3Q9UBP4 AL162258.2-202ENST00000469931 831 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
DKK3Q9UBP4 GPHA2-202ENST00000532246 466 ntTSL 3 BASIC18.32■□□□□ 0.52
DKK3Q9UBP4 AL449423.1-201ENST00000578935 435 ntTSL 3 BASIC18.32■□□□□ 0.52
DKK3Q9UBP4 ABHD13-201ENST00000375898 5338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
DKK3Q9UBP4 FDXR-214ENST00000581530 1827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
DKK3Q9UBP4 AC126763.1-201ENST00000552015 2118 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
DKK3Q9UBP4 SPHK2-211ENST00000600537 2136 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
DKK3Q9UBP4 ZNF839-202ENST00000442396 2987 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
DKK3Q9UBP4 PKMYT1-203ENST00000431515 2308 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
DKK3Q9UBP4 AC098818.2-201ENST00000564925 2320 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
DKK3Q9UBP4 GRK2-201ENST00000308595 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
DKK3Q9UBP4 TNXA-203ENST00000507684 2038 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
DKK3Q9UBP4 RNF167-205ENST00000571816 1728 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
DKK3Q9UBP4 RARRES1-201ENST00000237696 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
DKK3Q9UBP4 TIMM8A-201ENST00000372902 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
DKK3Q9UBP4 ADK-206ENST00000541550 2222 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
DKK3Q9UBP4 ACHE-205ENST00000419336 1906 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
DKK3Q9UBP4 ING5-201ENST00000313552 5196 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
DKK3Q9UBP4 FIP1L1-202ENST00000337488 2198 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
DKK3Q9UBP4 FIP1L1-203ENST00000358575 2180 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
DKK3Q9UBP4 SEPT11-201ENST00000264893 5593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
DKK3Q9UBP4 DNASE1L2-201ENST00000320700 1326 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
DKK3Q9UBP4 ABCB9-202ENST00000344275 2394 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
DKK3Q9UBP4 SIGIRR-202ENST00000397632 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
DKK3Q9UBP4 TRA2A-201ENST00000297071 1845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
DKK3Q9UBP4 SPERT-202ENST00000378966 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
DKK3Q9UBP4 ELANE-201ENST00000263621 920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
DKK3Q9UBP4 RPS14-203ENST00000407193 784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
DKK3Q9UBP4 SSR4P1-202ENST00000429427 967 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
DKK3Q9UBP4 HCG4P8-203ENST00000443049 980 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
DKK3Q9UBP4 LBX1-AS1-204ENST00000456391 421 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
DKK3Q9UBP4 MTG1-205ENST00000477902 1283 ntTSL 3 BASIC18.31■□□□□ 0.52
DKK3Q9UBP4 VEGFA-222ENST00000520948 1199 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
DKK3Q9UBP4 CHRNB1-207ENST00000575379 1095 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
DKK3Q9UBP4 HOXB8-203ENST00000576562 743 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
DKK3Q9UBP4 MIR3180-1-201ENST00000580374 94 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
DKK3Q9UBP4 MIR3180-3-201ENST00000584616 94 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
DKK3Q9UBP4 GPX4-210ENST00000611653 793 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
DKK3Q9UBP4 AC004263.2-201ENST00000617183 678 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
DKK3Q9UBP4 PHYKPL-201ENST00000308158 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
DKK3Q9UBP4 ANKRD24-201ENST00000262970 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
DKK3Q9UBP4 TMEM128-201ENST00000254742 1737 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
DKK3Q9UBP4 COQ9-210ENST00000567072 1482 ntTSL 3 BASIC18.31■□□□□ 0.52
DKK3Q9UBP4 NECTIN3-206ENST00000485303 3664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
DKK3Q9UBP4 PSMD11-202ENST00000457654 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
DKK3Q9UBP4 SIKE1-201ENST00000060969 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
DKK3Q9UBP4 C21orf59-201ENST00000290155 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
DKK3Q9UBP4 PRELID3A-203ENST00000587735 1694 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
DKK3Q9UBP4 LRRC36-201ENST00000329956 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
DKK3Q9UBP4 KCNH2-202ENST00000330883 3267 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
DKK3Q9UBP4 LINC01126-201ENST00000623515 1646 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
DKK3Q9UBP4 KCTD20-210ENST00000536244 5345 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
DKK3Q9UBP4 SNAI3-AS1-202ENST00000563475 2081 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
DKK3Q9UBP4 GLYCTK-201ENST00000305690 1371 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
DKK3Q9UBP4 RBFADN-201ENST00000562391 1350 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
DKK3Q9UBP4 LRRC27-201ENST00000344079 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
DKK3Q9UBP4 KSR1-205ENST00000509603 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
DKK3Q9UBP4 CRYL1-202ENST00000382812 1581 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
DKK3Q9UBP4 GMCL1P1-201ENST00000463439 1581 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
DKK3Q9UBP4 NFATC4-228ENST00000556759 2025 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
DKK3Q9UBP4 TRIM41-202ENST00000351937 2696 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
DKK3Q9UBP4 ULK1-201ENST00000321867 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
DKK3Q9UBP4 SHBG-201ENST00000340624 1311 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
DKK3Q9UBP4 TINCR-201ENST00000448587 3733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
DKK3Q9UBP4 BCL11A-209ENST00000489516 1508 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
DKK3Q9UBP4 KLF6-204ENST00000469435 2169 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
DKK3Q9UBP4 MAGEA6-201ENST00000329342 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
DKK3Q9UBP4 MAGEA3-201ENST00000370278 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
DKK3Q9UBP4 NEURL2-201ENST00000372518 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
DKK3Q9UBP4 DRAXINP1-201ENST00000437611 948 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
DKK3Q9UBP4 LAMTOR4-205ENST00000468582 621 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
DKK3Q9UBP4 AC011511.2-201ENST00000592893 918 ntTSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
DKK3Q9UBP4 LCE1C-202ENST00000607093 644 ntAPPRIS P2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
DKK3Q9UBP4 TXNDC12-205ENST00000610127 806 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
DKK3Q9UBP4 RHOU-201ENST00000366691 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
DKK3Q9UBP4 C4orf32-201ENST00000309733 8901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
DKK3Q9UBP4 HCK-202ENST00000375852 2082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
DKK3Q9UBP4 IFRD2-204ENST00000436390 2275 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
DKK3Q9UBP4 JMJD7-201ENST00000397299 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
DKK3Q9UBP4 TRAM1L1-201ENST00000310754 2023 ntAPPRIS P1 BASIC18.3■□□□□ 0.52
DKK3Q9UBP4 PRSS23-209ENST00000533902 2043 ntTSL 4 BASIC18.3■□□□□ 0.52
DKK3Q9UBP4 PLPPR2-208ENST00000591608 2552 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
DKK3Q9UBP4 C5orf47-201ENST00000340147 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
DKK3Q9UBP4 LANCL3-201ENST00000378619 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
DKK3Q9UBP4 RGS3-202ENST00000342620 1714 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
DKK3Q9UBP4 PSTK-201ENST00000368887 1705 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
DKK3Q9UBP4 SERPINE2-206ENST00000447280 1716 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
DKK3Q9UBP4 TEPSIN-201ENST00000300714 2287 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
DKK3Q9UBP4 ISL2-201ENST00000290759 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
DKK3Q9UBP4 IRAK3-202ENST00000457197 1853 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
DKK3Q9UBP4 FBXL22-202ENST00000534939 2443 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
DKK3Q9UBP4 ZCCHC17-205ENST00000615916 1652 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
DKK3Q9UBP4 PNOC-201ENST00000301908 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26 ms