Protein–RNA interactions for Protein: Q9P2K6

KLHL42, Kelch-like protein 42, humanhuman

Predictions only

Length 505 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLHL42Q9P2K6 YIPF2-209ENST00000590329 958 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
KLHL42Q9P2K6 ASF1B-205ENST00000592798 769 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
KLHL42Q9P2K6 USF2-205ENST00000594064 1179 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
KLHL42Q9P2K6 C16orf74-203ENST00000602675 744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
KLHL42Q9P2K6 GXYLT1P4-201ENST00000613576 1192 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
KLHL42Q9P2K6 PCCA-203ENST00000376286 2481 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
KLHL42Q9P2K6 PSMD11-202ENST00000457654 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
KLHL42Q9P2K6 USP48-204ENST00000400301 4309 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
KLHL42Q9P2K6 CCDC7-203ENST00000362006 2133 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
KLHL42Q9P2K6 ZNF385A-202ENST00000352268 2076 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
KLHL42Q9P2K6 THUMPD2-204ENST00000505747 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
KLHL42Q9P2K6 SLC2A8-202ENST00000373360 1937 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
KLHL42Q9P2K6 SP100-208ENST00000427101 1922 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
KLHL42Q9P2K6 GATB-213ENST00000515812 1893 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
KLHL42Q9P2K6 CYP4F8-210ENST00000612078 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
KLHL42Q9P2K6 ZNF696-201ENST00000330143 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
KLHL42Q9P2K6 CCNJ-203ENST00000465148 2677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
KLHL42Q9P2K6 ZIC4-212ENST00000484399 1774 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
KLHL42Q9P2K6 CD40-202ENST00000372285 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
KLHL42Q9P2K6 ZZZ3-201ENST00000370798 2468 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
KLHL42Q9P2K6 BTNL9-202ENST00000376841 1626 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
KLHL42Q9P2K6 CRYL1-202ENST00000382812 1581 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
KLHL42Q9P2K6 RAI2-201ENST00000331511 2317 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.45
KLHL42Q9P2K6 PAX1-205ENST00000613128 5352 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
KLHL42Q9P2K6 POC1B-GALNT4-201ENST00000547474 2207 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.45
KLHL42Q9P2K6 SPAG4-201ENST00000374273 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
KLHL42Q9P2K6 PTX4-201ENST00000293922 1422 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
KLHL42Q9P2K6 ARSA-201ENST00000216124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
KLHL42Q9P2K6 PPP2R2B-203ENST00000394411 2071 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.45
KLHL42Q9P2K6 WDTC1-201ENST00000319394 4819 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
KLHL42Q9P2K6 NOL3-201ENST00000268605 1394 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.45
KLHL42Q9P2K6 NOL3-211ENST00000568146 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
KLHL42Q9P2K6 RSPO4-201ENST00000217260 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
KLHL42Q9P2K6 BPHL-203ENST00000380379 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
KLHL42Q9P2K6 MFSD2A-203ENST00000420632 1914 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
KLHL42Q9P2K6 ALDH3A1-206ENST00000457500 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
KLHL42Q9P2K6 OSTM1-201ENST00000193322 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
KLHL42Q9P2K6 SLX1A-201ENST00000251303 1091 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
KLHL42Q9P2K6 METTL5-201ENST00000260953 1010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
KLHL42Q9P2K6 GGCT-202ENST00000275428 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
KLHL42Q9P2K6 SLX1B-201ENST00000330181 1165 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
KLHL42Q9P2K6 LCE3C-201ENST00000333881 425 ntAPPRIS P1 BASIC17.83■□□□□ 0.44
KLHL42Q9P2K6 PARK7-201ENST00000338639 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
KLHL42Q9P2K6 CAPN10-203ENST00000352879 862 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
KLHL42Q9P2K6 AK4P3-201ENST00000418260 669 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
KLHL42Q9P2K6 TMA7-201ENST00000438607 561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
KLHL42Q9P2K6 PTX4-202ENST00000440447 1117 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
KLHL42Q9P2K6 KRT18P57-201ENST00000443599 1254 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
KLHL42Q9P2K6 HELT-202ENST00000505610 846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
KLHL42Q9P2K6 AZIN1-AS1-214ENST00000522850 473 ntTSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.44
KLHL42Q9P2K6 MRPL52-210ENST00000555345 895 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
KLHL42Q9P2K6 IFNL4-202ENST00000616270 1132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
KLHL42Q9P2K6 C10orf142-201ENST00000619243 1110 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
KLHL42Q9P2K6 ZNF274-212ENST00000617501 2538 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
KLHL42Q9P2K6 PSRC1-205ENST00000409138 1826 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
KLHL42Q9P2K6 RNPS1-205ENST00000561718 1806 ntTSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.44
KLHL42Q9P2K6 ZNF280B-203ENST00000626650 5721 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
KLHL42Q9P2K6 OLFM2-203ENST00000590841 1665 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
KLHL42Q9P2K6 MRPL10-203ENST00000414011 1622 ntTSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.44
KLHL42Q9P2K6 AC127496.1-202ENST00000573602 2091 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
KLHL42Q9P2K6 KRT18P55-202ENST00000578578 1546 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
KLHL42Q9P2K6 PHYKPL-201ENST00000308158 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
KLHL42Q9P2K6 MID1IP1-201ENST00000336949 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
KLHL42Q9P2K6 FIBIN-201ENST00000318627 1938 ntAPPRIS P1 BASIC17.82■□□□□ 0.44
KLHL42Q9P2K6 LINC00167-201ENST00000530583 1419 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
KLHL42Q9P2K6 STMN3-202ENST00000540534 2351 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
KLHL42Q9P2K6 FOXI3-201ENST00000428390 2804 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
KLHL42Q9P2K6 RAPH1-201ENST00000308091 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
KLHL42Q9P2K6 CHRFAM7A-202ENST00000397827 2794 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
KLHL42Q9P2K6 TLK2-202ENST00000343388 3227 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
KLHL42Q9P2K6 COPS7A-210ENST00000539735 1832 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
KLHL42Q9P2K6 ACSM2B-208ENST00000565322 1834 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
KLHL42Q9P2K6 PPT2-247ENST00000375143 1754 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
KLHL42Q9P2K6 MRI1-201ENST00000040663 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
KLHL42Q9P2K6 FDXR-203ENST00000420580 1705 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
KLHL42Q9P2K6 FBXL20-205ENST00000583610 1739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
KLHL42Q9P2K6 RASA4B-201ENST00000306682 2589 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
KLHL42Q9P2K6 KLK14-201ENST00000156499 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
KLHL42Q9P2K6 HOPX-201ENST00000317745 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
KLHL42Q9P2K6 EDARADD-201ENST00000334232 858 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
KLHL42Q9P2K6 CARMIL2-201ENST00000334583 4687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
KLHL42Q9P2K6 MRPL24-202ENST00000368211 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
KLHL42Q9P2K6 SELENOF-202ENST00000370554 1220 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
KLHL42Q9P2K6 DUSP15-203ENST00000375966 1077 ntTSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
KLHL42Q9P2K6 DUSP15-204ENST00000398083 1212 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
KLHL42Q9P2K6 LEF1-AS1-201ENST00000436413 1045 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
KLHL42Q9P2K6 TMEM64-204ENST00000519519 873 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
KLHL42Q9P2K6 IFI27L2-206ENST00000556727 556 ntTSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
KLHL42Q9P2K6 AC026471.3-201ENST00000565137 578 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
KLHL42Q9P2K6 ULK4P3-205ENST00000568486 1158 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
KLHL42Q9P2K6 AC126696.3-202ENST00000570159 553 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
KLHL42Q9P2K6 PSMD8-202ENST00000585598 541 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
KLHL42Q9P2K6 RBM42-202ENST00000586618 771 ntTSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
KLHL42Q9P2K6 CD24-206ENST00000620405 586 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
KLHL42Q9P2K6 AC099343.3-201ENST00000605834 2503 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
KLHL42Q9P2K6 AC008764.6-201ENST00000595909 2069 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
KLHL42Q9P2K6 SLC23A3-203ENST00000409878 2010 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
KLHL42Q9P2K6 ZDHHC4-205ENST00000396713 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
KLHL42Q9P2K6 PKD2-201ENST00000237596 5056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
KLHL42Q9P2K6 ADCK5-201ENST00000308860 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.6 ms