Protein–RNA interactions for Protein: Q9NTI2

ATP8A2, Phospholipid-transporting ATPase IB, humanhuman

Predictions only

Length 1,148 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP8A2Q9NTI2 FASTK-202ENST00000353841 1402 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
ATP8A2Q9NTI2 ZBTB48-202ENST00000377674 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
ATP8A2Q9NTI2 PLEKHB2-204ENST00000409158 2277 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
ATP8A2Q9NTI2 PRDM8-202ENST00000415738 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
ATP8A2Q9NTI2 SDC1-203ENST00000403076 1523 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
ATP8A2Q9NTI2 ALKBH4-201ENST00000292566 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
ATP8A2Q9NTI2 STX8-201ENST00000306357 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
ATP8A2Q9NTI2 RPP14-206ENST00000466547 805 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.57■■□□□ 1.04
ATP8A2Q9NTI2 CCDC61-201ENST00000536603 1282 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
ATP8A2Q9NTI2 ABR-204ENST00000543210 1049 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
ATP8A2Q9NTI2 VASH1-204ENST00000554743 1096 ntTSL 3 BASIC21.57■■□□□ 1.04
ATP8A2Q9NTI2 ABR-217ENST00000572441 563 ntTSL 4 BASIC21.57■■□□□ 1.04
ATP8A2Q9NTI2 AL513523.2-201ENST00000633218 660 ntTSL 3 BASIC21.57■■□□□ 1.04
ATP8A2Q9NTI2 CSF3-206ENST00000577675 1360 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
ATP8A2Q9NTI2 TEX13A-201ENST00000600991 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
ATP8A2Q9NTI2 TWF1-201ENST00000395510 3045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
ATP8A2Q9NTI2 SALRNA1-201ENST00000555871 2086 ntTSL 4 BASIC21.57■■□□□ 1.04
ATP8A2Q9NTI2 RABL2B-205ENST00000395595 2428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
ATP8A2Q9NTI2 POLD4-205ENST00000529704 1486 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
ATP8A2Q9NTI2 AP001476.1-201ENST00000451618 2198 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
ATP8A2Q9NTI2 ADCK5-201ENST00000308860 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
ATP8A2Q9NTI2 ZNF623-203ENST00000526926 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
ATP8A2Q9NTI2 AK3-202ENST00000381809 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
ATP8A2Q9NTI2 ZNF394-203ENST00000426306 2017 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
ATP8A2Q9NTI2 PLK5-201ENST00000334770 2106 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
ATP8A2Q9NTI2 TMEM109-201ENST00000227525 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
ATP8A2Q9NTI2 RIMBP3-201ENST00000619918 6105 ntAPPRIS P1 BASIC21.56■■□□□ 1.04
ATP8A2Q9NTI2 GNB1L-203ENST00000405009 1076 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
ATP8A2Q9NTI2 MEF2B-202ENST00000409447 1297 ntTSL 3 BASIC21.56■■□□□ 1.04
ATP8A2Q9NTI2 AL645608.6-201ENST00000418300 402 ntTSL 3 BASIC21.56■■□□□ 1.04
ATP8A2Q9NTI2 AC234772.2-201ENST00000456532 375 ntTSL 3 BASIC21.56■■□□□ 1.04
ATP8A2Q9NTI2 AC091607.1-201ENST00000490318 1060 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
ATP8A2Q9NTI2 AC105202.1-201ENST00000517833 995 ntTSL 3 BASIC21.56■■□□□ 1.04
ATP8A2Q9NTI2 AC092338.2-202ENST00000567158 611 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
ATP8A2Q9NTI2 AC007220.1-201ENST00000572466 1055 ntTSL 3 BASIC21.56■■□□□ 1.04
ATP8A2Q9NTI2 SRSF1-209ENST00000585096 568 ntTSL 4 BASIC21.56■■□□□ 1.04
ATP8A2Q9NTI2 TBCB-205ENST00000585746 875 ntTSL 3 BASIC21.56■■□□□ 1.04
ATP8A2Q9NTI2 AGAP1-205ENST00000409538 6138 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
ATP8A2Q9NTI2 ITPKB-202ENST00000366784 3146 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
ATP8A2Q9NTI2 ERI1-203ENST00000519292 2107 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
ATP8A2Q9NTI2 MBD3-207ENST00000590550 2782 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
ATP8A2Q9NTI2 CRB2-202ENST00000373631 5550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
ATP8A2Q9NTI2 PPP2R2C-206ENST00000507294 1667 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
ATP8A2Q9NTI2 USP49-202ENST00000373010 2446 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
ATP8A2Q9NTI2 FYTTD1-205ENST00000424384 1758 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
ATP8A2Q9NTI2 ACSM2A-201ENST00000219054 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
ATP8A2Q9NTI2 AP5S1-201ENST00000246041 1960 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.56■■□□□ 1.04
ATP8A2Q9NTI2 CYR61-201ENST00000451137 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
ATP8A2Q9NTI2 MCOLN2-201ENST00000284027 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
ATP8A2Q9NTI2 AC087500.1-202ENST00000571689 1715 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
ATP8A2Q9NTI2 GPANK1-204ENST00000375900 1814 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
ATP8A2Q9NTI2 POLD3-203ENST00000527458 2122 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
ATP8A2Q9NTI2 AGPAT5-201ENST00000285518 3685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
ATP8A2Q9NTI2 IQCJ-SCHIP1-207ENST00000638749 2633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
ATP8A2Q9NTI2 MRPS34-201ENST00000177742 1040 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
ATP8A2Q9NTI2 ANKRD37-201ENST00000335174 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
ATP8A2Q9NTI2 SPATA22-202ENST00000355380 1216 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
ATP8A2Q9NTI2 BEX4-201ENST00000372691 1066 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
ATP8A2Q9NTI2 MTCL1P1-201ENST00000446207 792 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
ATP8A2Q9NTI2 POLR2M-203ENST00000464277 910 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
ATP8A2Q9NTI2 CDV3-207ENST00000508481 661 ntTSL 3 BASIC21.55■■□□□ 1.04
ATP8A2Q9NTI2 ENDOV-205ENST00000518644 625 ntTSL 4 BASIC21.55■■□□□ 1.04
ATP8A2Q9NTI2 RNPS1-224ENST00000569598 918 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
ATP8A2Q9NTI2 SMARCD3-202ENST00000356800 1669 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
ATP8A2Q9NTI2 INF2-204ENST00000398337 1689 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
ATP8A2Q9NTI2 ZIC4-212ENST00000484399 1774 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
ATP8A2Q9NTI2 KRT24-201ENST00000264651 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
ATP8A2Q9NTI2 ATP1B1-201ENST00000367815 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
ATP8A2Q9NTI2 SPTBN4-207ENST00000595535 6105 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
ATP8A2Q9NTI2 LIN54-209ENST00000510557 2257 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
ATP8A2Q9NTI2 SCARF2-202ENST00000622235 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
ATP8A2Q9NTI2 CEP55-201ENST00000371485 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
ATP8A2Q9NTI2 TMEM198-202ENST00000373883 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
ATP8A2Q9NTI2 STARD3-201ENST00000336308 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
ATP8A2Q9NTI2 HOXC11-201ENST00000243082 2039 ntTSL 3 BASIC21.55■■□□□ 1.04
ATP8A2Q9NTI2 NF2-203ENST00000353887 1845 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
ATP8A2Q9NTI2 DAP3-214ENST00000471642 1671 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
ATP8A2Q9NTI2 TOR2A-205ENST00000463577 2211 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
ATP8A2Q9NTI2 KLK12-202ENST00000319590 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
ATP8A2Q9NTI2 NPFFR2-202ENST00000344413 1234 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
ATP8A2Q9NTI2 DYNLL1-203ENST00000392509 814 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.54■■□□□ 1.04
ATP8A2Q9NTI2 TSPY19P-201ENST00000418461 509 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
ATP8A2Q9NTI2 TSPY18P-201ENST00000441642 509 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
ATP8A2Q9NTI2 TSFM-208ENST00000543727 651 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
ATP8A2Q9NTI2 BIRC5-207ENST00000590449 568 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
ATP8A2Q9NTI2 WWOX-203ENST00000406884 1701 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
ATP8A2Q9NTI2 SH2B3-201ENST00000341259 5406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
ATP8A2Q9NTI2 NSUN5P1-202ENST00000421140 1535 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
ATP8A2Q9NTI2 NSUN5P2-203ENST00000457352 1529 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
ATP8A2Q9NTI2 BAIAP2-204ENST00000428708 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
ATP8A2Q9NTI2 WDR90-201ENST00000293879 5488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
ATP8A2Q9NTI2 RBFA-202ENST00000306735 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
ATP8A2Q9NTI2 VGLL4-210ENST00000426568 1428 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
ATP8A2Q9NTI2 ATRIP-202ENST00000346691 2509 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
ATP8A2Q9NTI2 ACVR1B-203ENST00000426655 1782 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
ATP8A2Q9NTI2 PHGDH-209ENST00000641074 1780 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
ATP8A2Q9NTI2 LSM11-201ENST00000286307 6584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
ATP8A2Q9NTI2 IRF7-207ENST00000525445 1588 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
ATP8A2Q9NTI2 CDK13-202ENST00000340829 5066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
ATP8A2Q9NTI2 ATP6V1D-201ENST00000216442 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.4 ms