Protein–RNA interactions for Protein: Q9NQ76

MEPE, Matrix extracellular phosphoglycoprotein, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 525 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MEPEQ9NQ76 RNF144A-AS1-204ENST00000437589 618 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
MEPEQ9NQ76 WWOX-216ENST00000569818 525 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
MEPEQ9NQ76 AC027796.4-201ENST00000575741 874 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
MEPEQ9NQ76 UBL5-202ENST00000586895 432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
MEPEQ9NQ76 ATP5D-207ENST00000591660 637 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
MEPEQ9NQ76 FFAR4-203ENST00000604414 1142 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
MEPEQ9NQ76 AGAP2-AS1-201ENST00000542466 1500 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
MEPEQ9NQ76 PIGH-201ENST00000216452 1420 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
MEPEQ9NQ76 ITGA4-202ENST00000339307 1403 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
MEPEQ9NQ76 NKD2-202ENST00000296849 2155 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
MEPEQ9NQ76 ZNF74-202ENST00000400451 3159 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
MEPEQ9NQ76 HMGXB3-206ENST00000613459 5567 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
MEPEQ9NQ76 NIPAL2-202ENST00000430223 4496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
MEPEQ9NQ76 L1CAM-205ENST00000370060 5113 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
MEPEQ9NQ76 PCSK5-201ENST00000376752 5756 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
MEPEQ9NQ76 ENC1-201ENST00000302351 5520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
MEPEQ9NQ76 MAPK8IP3-201ENST00000250894 5661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
MEPEQ9NQ76 OGFOD2-205ENST00000454694 1488 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
MEPEQ9NQ76 FAM110A-201ENST00000246100 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
MEPEQ9NQ76 CD40-201ENST00000372276 1623 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
MEPEQ9NQ76 GNAZ-203ENST00000615612 3333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
MEPEQ9NQ76 KBTBD11-201ENST00000320248 6710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
MEPEQ9NQ76 VEGFA-206ENST00000372077 2834 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
MEPEQ9NQ76 AC060780.1-201ENST00000635600 1782 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
MEPEQ9NQ76 PNKP-224ENST00000631020 1545 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
MEPEQ9NQ76 TBX18-202ENST00000369663 6245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
MEPEQ9NQ76 ILF2-202ENST00000368681 726 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
MEPEQ9NQ76 MIR1238-201ENST00000408483 83 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
MEPEQ9NQ76 AL050404.1-201ENST00000424566 802 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
MEPEQ9NQ76 KRT18P23-201ENST00000435622 1283 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
MEPEQ9NQ76 BX322234.1-201ENST00000444188 980 ntTSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
MEPEQ9NQ76 SNORA78-201ENST00000459373 127 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
MEPEQ9NQ76 TGIF1-219ENST00000551541 990 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
MEPEQ9NQ76 AL355075.4-201ENST00000554988 638 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
MEPEQ9NQ76 GPSM2-201ENST00000264126 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
MEPEQ9NQ76 SLC35F3-201ENST00000366617 2762 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
MEPEQ9NQ76 TMEM132A-201ENST00000005286 3480 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
MEPEQ9NQ76 EDNRA-206ENST00000511804 1569 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
MEPEQ9NQ76 ZNF487-202ENST00000437590 2111 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
MEPEQ9NQ76 CASKIN2-201ENST00000321617 5015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
MEPEQ9NQ76 TRIM8-201ENST00000302424 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
MEPEQ9NQ76 DHRS2-201ENST00000250383 1705 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
MEPEQ9NQ76 APMAP-201ENST00000217456 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
MEPEQ9NQ76 PDE9A-206ENST00000380328 1875 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
MEPEQ9NQ76 PCBP3-205ENST00000400310 2168 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
MEPEQ9NQ76 DDX17-211ENST00000640332 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
MEPEQ9NQ76 DDX17-212ENST00000640668 2196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
MEPEQ9NQ76 AC009102.3-201ENST00000623118 1491 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
MEPEQ9NQ76 MON1B-202ENST00000439557 1759 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
MEPEQ9NQ76 AL512380.2-201ENST00000637901 1780 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
MEPEQ9NQ76 EIF3B-201ENST00000360876 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
MEPEQ9NQ76 PACS2-203ENST00000447393 6365 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
MEPEQ9NQ76 OR6D1P-202ENST00000641007 5290 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
MEPEQ9NQ76 WDR90-215ENST00000549091 5589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
MEPEQ9NQ76 CACNA1A-227ENST00000636549 6792 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
MEPEQ9NQ76 MATN4-205ENST00000537548 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
MEPEQ9NQ76 ALDH4A1-201ENST00000290597 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
MEPEQ9NQ76 PLD3-207ENST00000409735 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
MEPEQ9NQ76 POLD3-203ENST00000527458 2122 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
MEPEQ9NQ76 CBX2-202ENST00000310942 4644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
MEPEQ9NQ76 WWP1-202ENST00000517970 4686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
MEPEQ9NQ76 GLCCI1-201ENST00000223145 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
MEPEQ9NQ76 GTF2H4-201ENST00000259895 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
MEPEQ9NQ76 FSCN2-201ENST00000334850 1551 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
MEPEQ9NQ76 MIR149-201ENST00000384879 89 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
MEPEQ9NQ76 QPRT-202ENST00000395384 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
MEPEQ9NQ76 KDM1A-202ENST00000400181 3059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
MEPEQ9NQ76 ZDHHC8P1-204ENST00000433168 2309 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
MEPEQ9NQ76 AC007663.1-201ENST00000438948 1240 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
MEPEQ9NQ76 CCR12P-201ENST00000446203 998 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
MEPEQ9NQ76 AL451069.1-201ENST00000455414 634 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
MEPEQ9NQ76 KRT8P7-201ENST00000533003 1432 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
MEPEQ9NQ76 C16orf74-202ENST00000602583 1237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
MEPEQ9NQ76 TPSB2-201ENST00000606293 1165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
MEPEQ9NQ76 AL513523.10-201ENST00000623024 1186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
MEPEQ9NQ76 XKR8-201ENST00000373884 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
MEPEQ9NQ76 NOX4-201ENST00000263317 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
MEPEQ9NQ76 MYO19-225ENST00000621344 1640 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
MEPEQ9NQ76 HIC1-202ENST00000399849 3156 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
MEPEQ9NQ76 OLFM1-201ENST00000252854 2591 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
MEPEQ9NQ76 PDLIM3-201ENST00000284767 2589 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
MEPEQ9NQ76 MOAP1-201ENST00000298894 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
MEPEQ9NQ76 LHFPL6-201ENST00000379589 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
MEPEQ9NQ76 RNF157-201ENST00000269391 4955 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
MEPEQ9NQ76 FCMR-201ENST00000367091 1950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
MEPEQ9NQ76 MLLT1-201ENST00000252674 4507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
MEPEQ9NQ76 TNFAIP1-202ENST00000544907 1656 ntTSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
MEPEQ9NQ76 ERCC2-205ENST00000485403 1538 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
MEPEQ9NQ76 TAP1-201ENST00000354258 2959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
MEPEQ9NQ76 PRMT2-203ENST00000355680 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
MEPEQ9NQ76 ASB13-201ENST00000357700 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
MEPEQ9NQ76 RPN2-201ENST00000237530 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
MEPEQ9NQ76 ARFIP2-201ENST00000254584 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
MEPEQ9NQ76 PIGQ-203ENST00000321878 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
MEPEQ9NQ76 ACOXL-205ENST00000439055 2373 ntTSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
MEPEQ9NQ76 ACADVL-205ENST00000543245 2227 ntTSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
MEPEQ9NQ76 FAM222A-201ENST00000358906 2731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
MEPEQ9NQ76 SCARB1-203ENST00000415380 2731 ntTSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
MEPEQ9NQ76 SH2D2A-201ENST00000368198 1599 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
MEPEQ9NQ76 GNE-201ENST00000377902 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.3 ms