Protein–RNA interactions for Protein: Q9C099

LRRCC1, Leucine-rich repeat and coiled-coil domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,032 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRRCC1Q9C099 TCP11-228ENST00000611141 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
LRRCC1Q9C099 RNASET2-213ENST00000611959 1124 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
LRRCC1Q9C099 SERPINF2-202ENST00000382061 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
LRRCC1Q9C099 MCC-208ENST00000514701 2855 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
LRRCC1Q9C099 SLC39A5-201ENST00000266980 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
LRRCC1Q9C099 PNMA6E-201ENST00000445091 2192 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
LRRCC1Q9C099 AC005865.2-201ENST00000505276 2303 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
LRRCC1Q9C099 SAMD11-212ENST00000617307 2314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
LRRCC1Q9C099 PCCA-203ENST00000376286 2481 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
LRRCC1Q9C099 CYB561-205ENST00000542042 1302 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
LRRCC1Q9C099 PTGES-201ENST00000340607 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
LRRCC1Q9C099 NR5A1-202ENST00000373588 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
LRRCC1Q9C099 PKD2-201ENST00000237596 5056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
LRRCC1Q9C099 AP001626.1-201ENST00000424890 2854 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
LRRCC1Q9C099 CNOT11-201ENST00000289382 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
LRRCC1Q9C099 AC008764.1-201ENST00000409035 2567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
LRRCC1Q9C099 SCYL1-202ENST00000279270 1659 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
LRRCC1Q9C099 ZNF655-203ENST00000357864 1370 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
LRRCC1Q9C099 DCST1-204ENST00000423025 2199 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
LRRCC1Q9C099 C19orf57-208ENST00000591586 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
LRRCC1Q9C099 C6orf203-202ENST00000405204 1420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
LRRCC1Q9C099 GNGT2-201ENST00000300406 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
LRRCC1Q9C099 HLA-F-217ENST00000334668 1283 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
LRRCC1Q9C099 AC131097.3-201ENST00000413820 1228 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
LRRCC1Q9C099 AC114763.1-202ENST00000414911 867 ntTSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
LRRCC1Q9C099 HLA-F-220ENST00000434407 884 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
LRRCC1Q9C099 AC092647.4-201ENST00000457211 535 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
LRRCC1Q9C099 MYD88-211ENST00000495303 976 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
LRRCC1Q9C099 HELT-202ENST00000505610 846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
LRRCC1Q9C099 LTBR-211ENST00000543190 785 ntTSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
LRRCC1Q9C099 AC092902.2-222ENST00000626312 568 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
LRRCC1Q9C099 PMAIP1-202ENST00000316660 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
LRRCC1Q9C099 CLASRP-203ENST00000391953 1941 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
LRRCC1Q9C099 PNLDC1-207ENST00000610273 1940 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
LRRCC1Q9C099 ADORA1-202ENST00000337894 2919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
LRRCC1Q9C099 TDRKH-207ENST00000458431 2768 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
LRRCC1Q9C099 ACTN4-202ENST00000390009 2102 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
LRRCC1Q9C099 SPACA1-201ENST00000237201 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
LRRCC1Q9C099 FNBP1-201ENST00000355681 1977 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
LRRCC1Q9C099 PCCA-202ENST00000376285 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
LRRCC1Q9C099 WDTC1-201ENST00000319394 4819 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
LRRCC1Q9C099 RNFT2-209ENST00000622220 2176 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
LRRCC1Q9C099 SLC23A3-207ENST00000455516 2048 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.19
LRRCC1Q9C099 STARD10-218ENST00000543304 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.19
LRRCC1Q9C099 ZNF668-202ENST00000394983 2717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
LRRCC1Q9C099 AL590648.2-201ENST00000427949 2225 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
LRRCC1Q9C099 ACADVL-205ENST00000543245 2227 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
LRRCC1Q9C099 NUMBL-207ENST00000598779 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
LRRCC1Q9C099 GUCA1A-202ENST00000372958 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
LRRCC1Q9C099 BAIAP2L2-202ENST00000381669 2146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
LRRCC1Q9C099 CCKBR-203ENST00000525462 2138 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
LRRCC1Q9C099 UNC5CL-202ENST00000373164 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
LRRCC1Q9C099 CENPT-215ENST00000564817 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
LRRCC1Q9C099 WNT5B-201ENST00000310594 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
LRRCC1Q9C099 CD276-201ENST00000318424 2738 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
LRRCC1Q9C099 PYDC1-201ENST00000302964 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
LRRCC1Q9C099 PLCB1-204ENST00000404098 1260 ntTSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
LRRCC1Q9C099 FAM8A6P-201ENST00000407496 1135 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
LRRCC1Q9C099 CCNG1-211ENST00000512163 919 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
LRRCC1Q9C099 AC022616.7-201ENST00000525383 220 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
LRRCC1Q9C099 BVES-AS1-203ENST00000580511 853 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
LRRCC1Q9C099 PSMD8-202ENST00000585598 541 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
LRRCC1Q9C099 PPP2R2C-209ENST00000515571 1832 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
LRRCC1Q9C099 MYO9A-214ENST00000566885 5111 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
LRRCC1Q9C099 SP7-203ENST00000537210 1472 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
LRRCC1Q9C099 PXK-206ENST00000463280 2825 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
LRRCC1Q9C099 IFFO1-204ENST00000396840 2677 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
LRRCC1Q9C099 NPFFR2-201ENST00000308744 1922 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
LRRCC1Q9C099 AC138430.1-201ENST00000586064 5409 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
LRRCC1Q9C099 PDIA2-202ENST00000404312 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
LRRCC1Q9C099 KANSL1-202ENST00000432791 5343 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
LRRCC1Q9C099 STMN3-202ENST00000540534 2351 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
LRRCC1Q9C099 ZNF839-202ENST00000442396 2987 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
LRRCC1Q9C099 RREB1-203ENST00000379933 5826 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
LRRCC1Q9C099 LYSMD4-210ENST00000545021 2431 ntTSL 4 BASIC22.5■■□□□ 1.19
LRRCC1Q9C099 DSCR9-201ENST00000454482 1644 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
LRRCC1Q9C099 AC093010.1-201ENST00000473625 1624 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
LRRCC1Q9C099 LAT-204ENST00000395461 1448 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
LRRCC1Q9C099 ABCD1-202ENST00000370129 1016 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
LRRCC1Q9C099 KIRREL3-AS3-201ENST00000404882 831 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
LRRCC1Q9C099 FAM210CP-201ENST00000445714 574 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
LRRCC1Q9C099 AC112907.2-201ENST00000448639 330 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
LRRCC1Q9C099 NOL7-202ENST00000451315 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
LRRCC1Q9C099 HYMAI.1-201ENST00000620949 238 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
LRRCC1Q9C099 NFATC2IP-201ENST00000320805 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
LRRCC1Q9C099 NOC2LP1-202ENST00000452600 2235 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
LRRCC1Q9C099 B4GALT4-202ENST00000393765 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
LRRCC1Q9C099 ESAM-201ENST00000278927 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
LRRCC1Q9C099 NUDT4-202ENST00000415493 4839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
LRRCC1Q9C099 IRF3-203ENST00000377139 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
LRRCC1Q9C099 CCDC88C-203ENST00000389856 1641 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
LRRCC1Q9C099 WDR45-205ENST00000376358 1432 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
LRRCC1Q9C099 PARP16-202ENST00000444347 2352 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
LRRCC1Q9C099 ZNF280B-203ENST00000626650 5721 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
LRRCC1Q9C099 SP100-208ENST00000427101 1922 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
LRRCC1Q9C099 CASD1-201ENST00000297273 3942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
LRRCC1Q9C099 MEST-201ENST00000223215 2465 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
LRRCC1Q9C099 RSPO4-201ENST00000217260 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
LRRCC1Q9C099 KCNC4-203ENST00000413138 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
LRRCC1Q9C099 LPAR2-201ENST00000407877 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.3 ms