Protein–RNA interactions for Protein: Q9BRJ9

MESP1, Mesoderm posterior protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 268 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MESP1Q9BRJ9 IGHV3-47-201ENST00000425060 335 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
MESP1Q9BRJ9 NUS1P1-201ENST00000446295 882 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
MESP1Q9BRJ9 EMBP1-201ENST00000458200 901 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
MESP1Q9BRJ9 AC012615.1-201ENST00000565797 1299 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
MESP1Q9BRJ9 MID1IP1-202ENST00000378474 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
MESP1Q9BRJ9 ORAI2-204ENST00000473939 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
MESP1Q9BRJ9 MED9-201ENST00000268711 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
MESP1Q9BRJ9 TOR2A-205ENST00000463577 2211 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
MESP1Q9BRJ9 DHRS4L2-201ENST00000335125 1370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
MESP1Q9BRJ9 CCSAP-203ENST00000366687 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
MESP1Q9BRJ9 JKAMP-201ENST00000261247 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
MESP1Q9BRJ9 ZNF692-204ENST00000451251 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
MESP1Q9BRJ9 PDLIM2-206ENST00000409141 1463 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
MESP1Q9BRJ9 KCNJ12-202ENST00000583088 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
MESP1Q9BRJ9 ZFYVE9-201ENST00000287727 5194 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
MESP1Q9BRJ9 CMTM7-201ENST00000334983 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
MESP1Q9BRJ9 RND1-201ENST00000309739 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
MESP1Q9BRJ9 STAC3-201ENST00000332782 1656 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
MESP1Q9BRJ9 ISL2-201ENST00000290759 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
MESP1Q9BRJ9 PPP1R3F-202ENST00000376188 2443 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
MESP1Q9BRJ9 NUP50-AS1-201ENST00000426282 2076 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
MESP1Q9BRJ9 RAD51-203ENST00000423169 1611 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
MESP1Q9BRJ9 MTMR12-203ENST00000382142 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
MESP1Q9BRJ9 PNOC-201ENST00000301908 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
MESP1Q9BRJ9 SPIN2B-202ENST00000333933 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
MESP1Q9BRJ9 PAX3-208ENST00000409828 1254 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
MESP1Q9BRJ9 AL645608.6-201ENST00000418300 402 ntTSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
MESP1Q9BRJ9 MOBP-204ENST00000420739 940 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
MESP1Q9BRJ9 KRT17P6-201ENST00000453795 1220 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
MESP1Q9BRJ9 LINC00595-207ENST00000476909 792 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
MESP1Q9BRJ9 AC104819.1-201ENST00000504587 486 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
MESP1Q9BRJ9 GUSBP12-201ENST00000513727 720 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
MESP1Q9BRJ9 ENDOV-202ENST00000517295 908 ntTSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
MESP1Q9BRJ9 AC011511.2-201ENST00000592893 918 ntTSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
MESP1Q9BRJ9 AC099336.1-202ENST00000602961 463 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
MESP1Q9BRJ9 PTTG1IP-204ENST00000445724 2497 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
MESP1Q9BRJ9 HTATSF1-204ENST00000535601 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
MESP1Q9BRJ9 KCNQ2-205ENST00000360480 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
MESP1Q9BRJ9 AC004408.2-201ENST00000623613 2777 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
MESP1Q9BRJ9 ARPC1B-201ENST00000252725 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
MESP1Q9BRJ9 AP001626.1-201ENST00000424890 2854 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
MESP1Q9BRJ9 SMARCC2-203ENST00000394023 4271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
MESP1Q9BRJ9 FAM69B-201ENST00000371691 2410 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
MESP1Q9BRJ9 SIGLEC10-204ENST00000436984 1776 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
MESP1Q9BRJ9 FAM222A-202ENST00000538780 3294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
MESP1Q9BRJ9 TMPRSS5-205ENST00000538955 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
MESP1Q9BRJ9 LETM1P2-201ENST00000597330 2178 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
MESP1Q9BRJ9 MAN1B1-207ENST00000535144 2296 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
MESP1Q9BRJ9 HNRNPM-201ENST00000325495 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
MESP1Q9BRJ9 NSUN5P1-202ENST00000421140 1535 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
MESP1Q9BRJ9 NSUN5P2-203ENST00000457352 1529 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
MESP1Q9BRJ9 KCNA3-201ENST00000369769 2569 ntAPPRIS P1 BASIC16.96■□□□□ 0.31
MESP1Q9BRJ9 ARHGEF2-204ENST00000368315 1645 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
MESP1Q9BRJ9 UNC5CL-202ENST00000373164 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
MESP1Q9BRJ9 ASL-205ENST00000395332 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
MESP1Q9BRJ9 IFIH1-202ENST00000421365 1617 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
MESP1Q9BRJ9 CADPS-202ENST00000357948 5190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
MESP1Q9BRJ9 LRRC27-201ENST00000344079 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
MESP1Q9BRJ9 RNF38-202ENST00000350199 5104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
MESP1Q9BRJ9 PTBP1-220ENST00000627714 2201 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
MESP1Q9BRJ9 LIPG-203ENST00000577628 2323 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
MESP1Q9BRJ9 INTS10-201ENST00000397977 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
MESP1Q9BRJ9 AC026471.1-201ENST00000564629 3026 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
MESP1Q9BRJ9 GNGT2-201ENST00000300406 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
MESP1Q9BRJ9 NT5E-202ENST00000369646 974 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
MESP1Q9BRJ9 ROMO1-204ENST00000374078 498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
MESP1Q9BRJ9 CXorf40A-202ENST00000393985 1148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
MESP1Q9BRJ9 AC093585.1-201ENST00000425183 428 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
MESP1Q9BRJ9 KRT18P31-201ENST00000506277 1292 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
MESP1Q9BRJ9 CCDC61-201ENST00000536603 1282 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
MESP1Q9BRJ9 LAT-211ENST00000566177 786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
MESP1Q9BRJ9 AL732314.6-201ENST00000627721 484 ntTSL 4 BASIC16.96■□□□□ 0.31
MESP1Q9BRJ9 GTPBP8-208ENST00000619116 1378 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
MESP1Q9BRJ9 PPP1R7-202ENST00000272983 1954 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
MESP1Q9BRJ9 INAVA-202ENST00000413687 2197 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
MESP1Q9BRJ9 PRDM1-202ENST00000369091 2612 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
MESP1Q9BRJ9 COX20-203ENST00000411948 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
MESP1Q9BRJ9 APLP2-210ENST00000528499 2530 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
MESP1Q9BRJ9 ESPNP-201ENST00000270691 2015 ntBASIC16.96■□□□□ 0.3
MESP1Q9BRJ9 AC018445.3-201ENST00000624177 1945 ntBASIC16.96■□□□□ 0.3
MESP1Q9BRJ9 SMN1-204ENST00000506163 1445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
MESP1Q9BRJ9 KDM4B-202ENST00000381759 3058 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
MESP1Q9BRJ9 PCSK6-214ENST00000611716 4409 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
MESP1Q9BRJ9 CMTM3-201ENST00000361909 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
MESP1Q9BRJ9 C21orf59-201ENST00000290155 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
MESP1Q9BRJ9 C5orf30-203ENST00000515669 1573 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.95■□□□□ 0.3
MESP1Q9BRJ9 GRM6-201ENST00000231188 6143 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
MESP1Q9BRJ9 TP53TG1-202ENST00000416560 710 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
MESP1Q9BRJ9 TPM4P1-201ENST00000436100 807 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
MESP1Q9BRJ9 AC004975.2-201ENST00000442017 565 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
MESP1Q9BRJ9 AC135586.2-201ENST00000537262 567 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.95■□□□□ 0.3
MESP1Q9BRJ9 INO80E-207ENST00000563197 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
MESP1Q9BRJ9 APBB1-215ENST00000608394 2128 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
MESP1Q9BRJ9 APBB1-222ENST00000610474 2147 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
MESP1Q9BRJ9 GRM5-202ENST00000305447 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
MESP1Q9BRJ9 CLK2-202ENST00000361168 1934 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
MESP1Q9BRJ9 SNX8-201ENST00000222990 4727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
MESP1Q9BRJ9 ASL-204ENST00000395331 1538 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
MESP1Q9BRJ9 ENTPD6-201ENST00000354989 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
MESP1Q9BRJ9 ARNTL-203ENST00000403290 2746 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55 ms