Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQD1

PMCHL2, Putative pro-MCH-like protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 86 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PMCHL2Q9BQD1 EWSAT1-206ENST00000558922 1725 ntTSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
PMCHL2Q9BQD1 NGFR-201ENST00000172229 3417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
PMCHL2Q9BQD1 TSPAN15-201ENST00000373290 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
PMCHL2Q9BQD1 ADCY1-204ENST00000621543 1647 ntTSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
PMCHL2Q9BQD1 TPD52-211ENST00000519303 1594 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
PMCHL2Q9BQD1 NAA60-235ENST00000576916 1567 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
PMCHL2Q9BQD1 MAPK8IP1P2-201ENST00000580257 1472 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
PMCHL2Q9BQD1 FBXO21-201ENST00000330622 2906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
PMCHL2Q9BQD1 ARL6IP6-201ENST00000326446 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
PMCHL2Q9BQD1 ITGB7-202ENST00000422257 2791 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
PMCHL2Q9BQD1 AC132872.4-202ENST00000622924 2756 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
PMCHL2Q9BQD1 WDR13-202ENST00000376729 5469 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
PMCHL2Q9BQD1 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.25□□□□□ -0.29
PMCHL2Q9BQD1 CHD4-210ENST00000544040 6514 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
PMCHL2Q9BQD1 ITGB2-207ENST00000397854 2592 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
PMCHL2Q9BQD1 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
PMCHL2Q9BQD1 ZNRF2P2-202ENST00000442865 590 ntTSL 4 BASIC13.25□□□□□ -0.29
PMCHL2Q9BQD1 WWTR1-AS1-203ENST00000495094 975 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
PMCHL2Q9BQD1 SMIM20-201ENST00000506197 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
PMCHL2Q9BQD1 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC13.25□□□□□ -0.29
PMCHL2Q9BQD1 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC13.25□□□□□ -0.29
PMCHL2Q9BQD1 ADARB1-204ENST00000389863 3563 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
PMCHL2Q9BQD1 HYAL1-202ENST00000320295 2324 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.25□□□□□ -0.29
PMCHL2Q9BQD1 PRRT4-205ENST00000489835 2313 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
PMCHL2Q9BQD1 UMOD-205ENST00000570689 2315 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
PMCHL2Q9BQD1 STRADA-254ENST00000640999 2336 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
PMCHL2Q9BQD1 LZTS1-201ENST00000265801 5459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
PMCHL2Q9BQD1 GPR75-201ENST00000394705 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
PMCHL2Q9BQD1 ERMARD-210ENST00000588451 2146 ntTSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
PMCHL2Q9BQD1 TXNDC11-202ENST00000356957 3178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
PMCHL2Q9BQD1 SYNRG-223ENST00000616179 4050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
PMCHL2Q9BQD1 HNRNPLL-212ENST00000608859 3035 ntTSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
PMCHL2Q9BQD1 MYRIP-202ENST00000396217 4877 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
PMCHL2Q9BQD1 SMARCA2-203ENST00000349721 5761 ntTSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
PMCHL2Q9BQD1 ANKHD1-202ENST00000297183 7606 ntTSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
PMCHL2Q9BQD1 PDZD4-202ENST00000393758 3763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
PMCHL2Q9BQD1 NPAS3-202ENST00000356141 2802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
PMCHL2Q9BQD1 TPRA1-204ENST00000450633 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
PMCHL2Q9BQD1 GOSR2-210ENST00000576910 1891 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
PMCHL2Q9BQD1 UCKL1-202ENST00000358711 1845 ntTSL 2 BASIC13.25□□□□□ -0.29
PMCHL2Q9BQD1 DNM2-202ENST00000359692 3588 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
PMCHL2Q9BQD1 NEIL1-221ENST00000569035 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
PMCHL2Q9BQD1 CRY1-201ENST00000008527 3267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
PMCHL2Q9BQD1 TM2D2-201ENST00000397070 1631 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
PMCHL2Q9BQD1 MYO19-225ENST00000621344 1640 ntTSL 2 BASIC13.24□□□□□ -0.29
PMCHL2Q9BQD1 SCARB1-211ENST00000546215 1597 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
PMCHL2Q9BQD1 C17orf58-201ENST00000334461 1535 ntTSL 2 BASIC13.24□□□□□ -0.29
PMCHL2Q9BQD1 WDR81-206ENST00000446363 2968 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
PMCHL2Q9BQD1 TBX5-203ENST00000405440 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
PMCHL2Q9BQD1 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
PMCHL2Q9BQD1 KRT19-201ENST00000361566 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
PMCHL2Q9BQD1 C1orf115-201ENST00000294889 3413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
PMCHL2Q9BQD1 AGAP6-201ENST00000374056 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
PMCHL2Q9BQD1 TTYH2-206ENST00000529107 2015 ntTSL 2 BASIC13.24□□□□□ -0.29
PMCHL2Q9BQD1 TXNRD2-218ENST00000542719 2024 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
PMCHL2Q9BQD1 C18orf8-208ENST00000590868 2002 ntTSL 2 BASIC13.24□□□□□ -0.29
PMCHL2Q9BQD1 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.24□□□□□ -0.29
PMCHL2Q9BQD1 PML-211ENST00000564428 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
PMCHL2Q9BQD1 TBC1D9B-202ENST00000356834 5173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
PMCHL2Q9BQD1 PBX1-219ENST00000560641 3225 ntTSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
PMCHL2Q9BQD1 LINC00535-201ENST00000501400 1914 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
PMCHL2Q9BQD1 PNLDC1-207ENST00000610273 1940 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
PMCHL2Q9BQD1 YBX1P1-201ENST00000445822 960 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
PMCHL2Q9BQD1 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
PMCHL2Q9BQD1 AC006538.2-201ENST00000586572 543 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC13.24□□□□□ -0.29
PMCHL2Q9BQD1 AL512625.3-202ENST00000591993 1091 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
PMCHL2Q9BQD1 FAM83C-201ENST00000374408 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
PMCHL2Q9BQD1 AL353997.2-201ENST00000579352 4955 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
PMCHL2Q9BQD1 KDM3A-201ENST00000312912 4886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
PMCHL2Q9BQD1 ZFAND2B-202ENST00000409097 1765 ntTSL 2 BASIC13.24□□□□□ -0.29
PMCHL2Q9BQD1 AC006460.2-201ENST00000638173 4744 ntTSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
PMCHL2Q9BQD1 ARHGAP9-204ENST00000430041 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
PMCHL2Q9BQD1 NPAS2-201ENST00000335681 4007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
PMCHL2Q9BQD1 MGRN1-201ENST00000262370 3968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
PMCHL2Q9BQD1 PAXBP1-202ENST00000331923 3995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
PMCHL2Q9BQD1 DHFR-201ENST00000439211 3917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
PMCHL2Q9BQD1 PTPN11-201ENST00000351677 6101 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
PMCHL2Q9BQD1 USP39-201ENST00000323701 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
PMCHL2Q9BQD1 APBB1-215ENST00000608394 2128 ntTSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
PMCHL2Q9BQD1 APBB1-222ENST00000610474 2147 ntTSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
PMCHL2Q9BQD1 MREG-205ENST00000620139 2618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.24□□□□□ -0.29
PMCHL2Q9BQD1 USP42-201ENST00000306177 5155 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
PMCHL2Q9BQD1 PDE3A-201ENST00000359062 7576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
PMCHL2Q9BQD1 MYLK2-202ENST00000375994 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
PMCHL2Q9BQD1 NAP1L4-222ENST00000620138 2479 ntTSL 2 BASIC13.23□□□□□ -0.29
PMCHL2Q9BQD1 TRAF4-205ENST00000444415 1456 ntTSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
PMCHL2Q9BQD1 SLC35B2-205ENST00000538577 1909 ntTSL 2 BASIC13.23□□□□□ -0.29
PMCHL2Q9BQD1 ZFPM2-201ENST00000407775 4700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
PMCHL2Q9BQD1 CCR7-203ENST00000579344 1874 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
PMCHL2Q9BQD1 BICD2-202ENST00000375512 4636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
PMCHL2Q9BQD1 CNOT3-204ENST00000447684 2765 ntTSL 2 BASIC13.23□□□□□ -0.29
PMCHL2Q9BQD1 SRCIN1-215ENST00000621492 4644 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
PMCHL2Q9BQD1 SPINT2-202ENST00000454580 1367 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
PMCHL2Q9BQD1 PCDH17-201ENST00000377918 8232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
PMCHL2Q9BQD1 PNO1-201ENST00000263657 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
PMCHL2Q9BQD1 TLE2-204ENST00000455444 2253 ntTSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
PMCHL2Q9BQD1 GLS2-216ENST00000610413 2296 ntTSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
PMCHL2Q9BQD1 GGA1-203ENST00000343632 3159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
PMCHL2Q9BQD1 PAX6-203ENST00000379109 3182 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.23□□□□□ -0.29
PMCHL2Q9BQD1 TTC13-202ENST00000366662 3112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.8 ms