Protein–RNA interactions for Protein: Q99956

DUSP9, Dual specificity protein phosphatase 9, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 384 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DUSP9Q99956 ICAM4-201ENST00000340992 1176 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
DUSP9Q99956 S100A16-203ENST00000368705 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
DUSP9Q99956 AC113347.1-201ENST00000413321 391 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
DUSP9Q99956 CT47A4-201ENST00000415858 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
DUSP9Q99956 CT47A9-201ENST00000417256 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
DUSP9Q99956 CT47A6-201ENST00000419194 1298 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
DUSP9Q99956 CT47A10-201ENST00000430448 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
DUSP9Q99956 CT47A5-201ENST00000439466 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
DUSP9Q99956 CT47A3-201ENST00000441330 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
DUSP9Q99956 UNC5B-AS1-201ENST00000447119 647 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
DUSP9Q99956 CT47A8-201ENST00000457977 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
DUSP9Q99956 CT47A2-201ENST00000458218 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
DUSP9Q99956 HRASLS5-205ENST00000539221 1167 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
DUSP9Q99956 AC100793.2-201ENST00000593139 542 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
DUSP9Q99956 LINC00896-202ENST00000609602 2128 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
DUSP9Q99956 AC005363.2-201ENST00000618631 242 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
DUSP9Q99956 RNF187-203ENST00000639044 708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
DUSP9Q99956 TMEM132A-201ENST00000005286 3480 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
DUSP9Q99956 HHATL-201ENST00000310417 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
DUSP9Q99956 PABPC1L-217ENST00000537323 1910 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
DUSP9Q99956 C16orf45-201ENST00000300006 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
DUSP9Q99956 DLK2-203ENST00000372488 1590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
DUSP9Q99956 KCNQ5-207ENST00000403813 6539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
DUSP9Q99956 RAD23A-201ENST00000316856 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
DUSP9Q99956 MID1IP1-202ENST00000378474 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
DUSP9Q99956 NRXN1-220ENST00000611589 1857 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
DUSP9Q99956 PHYKPL-201ENST00000308158 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
DUSP9Q99956 SPC24-206ENST00000592540 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
DUSP9Q99956 SMARCD3-202ENST00000356800 1669 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
DUSP9Q99956 NEK2-205ENST00000540251 1318 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
DUSP9Q99956 ADPGK-AS1-201ENST00000563592 2730 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
DUSP9Q99956 SEMA3B-202ENST00000418576 1765 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
DUSP9Q99956 PHF1-201ENST00000374512 2224 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
DUSP9Q99956 UBAP1-203ENST00000379186 2524 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
DUSP9Q99956 ACSS2-201ENST00000253382 2925 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
DUSP9Q99956 GNAS-203ENST00000306120 1878 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
DUSP9Q99956 ZNF584-202ENST00000322834 1042 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
DUSP9Q99956 MLLT10-205ENST00000377100 1136 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
DUSP9Q99956 TMEM88B-201ENST00000378821 492 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
DUSP9Q99956 ZDHHC4-205ENST00000396713 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
DUSP9Q99956 FBXO32-202ENST00000443022 1227 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
DUSP9Q99956 MPP2-206ENST00000518766 1896 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
DUSP9Q99956 KLK7-206ENST00000597707 1054 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
DUSP9Q99956 DEDD2-209ENST00000598727 1037 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
DUSP9Q99956 AC024243.1-201ENST00000609234 778 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
DUSP9Q99956 DNAJB6-218ENST00000634080 1005 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
DUSP9Q99956 HUNK-201ENST00000270112 7385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
DUSP9Q99956 KIRREL2-205ENST00000592409 2563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
DUSP9Q99956 CDC25B-202ENST00000340833 1978 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
DUSP9Q99956 OSR2-201ENST00000297565 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
DUSP9Q99956 RNPS1-205ENST00000561718 1806 ntTSL 3 BASIC20.06■□□□□ 0.8
DUSP9Q99956 CACNA1B-201ENST00000277549 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
DUSP9Q99956 CACNA1B-202ENST00000277551 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
DUSP9Q99956 CRB2-202ENST00000373631 5550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
DUSP9Q99956 ACVRL1-202ENST00000419526 1356 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
DUSP9Q99956 PIF1-201ENST00000268043 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
DUSP9Q99956 MFSD14A-201ENST00000370152 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
DUSP9Q99956 MFGE8-202ENST00000268151 1752 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
DUSP9Q99956 CASKIN2-205ENST00000581870 1612 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
DUSP9Q99956 NUDT16L1-201ENST00000304301 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
DUSP9Q99956 GRAMD2B-218ENST00000542322 2977 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
DUSP9Q99956 CD40-202ENST00000372285 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
DUSP9Q99956 NFATC1-206ENST00000542384 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
DUSP9Q99956 AL109910.2-201ENST00000607733 1953 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
DUSP9Q99956 PARD3-205ENST00000374773 3420 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
DUSP9Q99956 CCK-201ENST00000334681 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
DUSP9Q99956 NME1-202ENST00000336097 986 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
DUSP9Q99956 H2AFB2-201ENST00000354514 348 ntAPPRIS P1 BASIC20.05■□□□□ 0.8
DUSP9Q99956 NME1-203ENST00000393196 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
DUSP9Q99956 AC073343.2-202ENST00000430844 532 ntTSL 4 BASIC20.05■□□□□ 0.8
DUSP9Q99956 GRAMD4P1-201ENST00000435181 1110 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
DUSP9Q99956 AC128688.1-201ENST00000487626 519 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
DUSP9Q99956 CHCHD6-204ENST00000508789 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
DUSP9Q99956 DYNLL1-205ENST00000548342 662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
DUSP9Q99956 TMEM249-203ENST00000565365 975 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC20.05■□□□□ 0.8
DUSP9Q99956 AC008735.6-201ENST00000635964 1292 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
DUSP9Q99956 RNPS1-203ENST00000397086 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
DUSP9Q99956 CISD2-201ENST00000273986 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
DUSP9Q99956 ZNF211-203ENST00000299871 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.05■□□□□ 0.8
DUSP9Q99956 ASPRV1-201ENST00000320256 2177 ntAPPRIS P1 BASIC20.05■□□□□ 0.8
DUSP9Q99956 TAX1BP3-201ENST00000225525 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
DUSP9Q99956 DVL2-209ENST00000575458 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
DUSP9Q99956 C9orf66-201ENST00000382387 2918 ntAPPRIS P1 BASIC20.05■□□□□ 0.8
DUSP9Q99956 MAPKAPK3-201ENST00000357955 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
DUSP9Q99956 MYOZ3-203ENST00000517768 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
DUSP9Q99956 RPS6KA5-201ENST00000418736 2249 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
DUSP9Q99956 CCDC137-201ENST00000329214 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
DUSP9Q99956 SOCS3-201ENST00000330871 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
DUSP9Q99956 CPAMD8-202ENST00000388925 5355 ntTSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
DUSP9Q99956 CIRBP-201ENST00000320936 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
DUSP9Q99956 GSTM4-201ENST00000326729 1321 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
DUSP9Q99956 CIRBP-207ENST00000586472 1303 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC20.04■□□□□ 0.8
DUSP9Q99956 BIN1-208ENST00000376113 1832 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
DUSP9Q99956 FDXR-202ENST00000413947 1809 ntTSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
DUSP9Q99956 NRSN2-202ENST00000382291 2088 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
DUSP9Q99956 ANKRD6-201ENST00000339746 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
DUSP9Q99956 HDAC10-201ENST00000216271 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
DUSP9Q99956 STN1-201ENST00000224950 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
DUSP9Q99956 GMDS-208ENST00000530927 1440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
DUSP9Q99956 AC073508.3-201ENST00000619697 1419 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.5 ms