Protein–RNA interactions for Protein: Q96Q35

ALS2CR12, Amyotrophic lateral sclerosis 2 chromosomal region candidate gene 12 protein, humanhuman

Predictions only

Length 445 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ALS2CR12Q96Q35 OGFOD2-212ENST00000538755 1949 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
ALS2CR12Q96Q35 CMTM3-214ENST00000567572 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
ALS2CR12Q96Q35 ZNF48-205ENST00000613509 3339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
ALS2CR12Q96Q35 C18orf8-208ENST00000590868 2002 ntTSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
ALS2CR12Q96Q35 HLA-DQB1-201ENST00000374943 1656 ntBASIC19.56■□□□□ 0.72
ALS2CR12Q96Q35 CTSB-232ENST00000534510 1989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
ALS2CR12Q96Q35 STRN4-201ENST00000263280 3210 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
ALS2CR12Q96Q35 PPP1R16A-202ENST00000435887 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
ALS2CR12Q96Q35 MAPK11-201ENST00000330651 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
ALS2CR12Q96Q35 RWDD4-202ENST00000327570 2590 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC19.55■□□□□ 0.72
ALS2CR12Q96Q35 SMN1-209ENST00000514951 1308 ntTSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
ALS2CR12Q96Q35 FKBP8-206ENST00000596558 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
ALS2CR12Q96Q35 PRRT1-201ENST00000211413 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
ALS2CR12Q96Q35 DUS1L-201ENST00000306796 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
ALS2CR12Q96Q35 ACADVL-205ENST00000543245 2227 ntTSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
ALS2CR12Q96Q35 ZFP3-201ENST00000318833 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
ALS2CR12Q96Q35 MT3-201ENST00000200691 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
ALS2CR12Q96Q35 TNNC1-201ENST00000232975 714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
ALS2CR12Q96Q35 RPP25L-201ENST00000297613 1092 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
ALS2CR12Q96Q35 RECK-201ENST00000377966 4888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
ALS2CR12Q96Q35 PPP1R14BP5-201ENST00000440334 435 ntBASIC19.55■□□□□ 0.72
ALS2CR12Q96Q35 AP002982.1-201ENST00000492365 877 ntBASIC19.55■□□□□ 0.72
ALS2CR12Q96Q35 AC093752.1-201ENST00000511950 605 ntTSL 4 BASIC19.55■□□□□ 0.72
ALS2CR12Q96Q35 AP002433.1-201ENST00000525548 964 ntTSL 3 BASIC19.55■□□□□ 0.72
ALS2CR12Q96Q35 MMAB-206ENST00000540016 945 ntTSL 3 BASIC19.55■□□□□ 0.72
ALS2CR12Q96Q35 TMEM235-204ENST00000551068 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
ALS2CR12Q96Q35 MIR381HG-201ENST00000553692 425 ntTSL 3 BASIC19.55■□□□□ 0.72
ALS2CR12Q96Q35 TPGS2-219ENST00000593035 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
ALS2CR12Q96Q35 STX2-201ENST00000261653 3331 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
ALS2CR12Q96Q35 KAT2A-201ENST00000225916 3109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
ALS2CR12Q96Q35 NUDT19-201ENST00000397061 2967 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
ALS2CR12Q96Q35 CEBPG-201ENST00000284000 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
ALS2CR12Q96Q35 ZNF133-212ENST00000622607 2660 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC19.55■□□□□ 0.72
ALS2CR12Q96Q35 GYPC-202ENST00000356887 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
ALS2CR12Q96Q35 PDIA5-201ENST00000316218 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
ALS2CR12Q96Q35 CAPN1-201ENST00000279247 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
ALS2CR12Q96Q35 ENDOV-225ENST00000522751 1475 ntTSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
ALS2CR12Q96Q35 FXYD6-204ENST00000526014 2171 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
ALS2CR12Q96Q35 ENC1-207ENST00000618628 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
ALS2CR12Q96Q35 HNRNPK-202ENST00000360384 2038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
ALS2CR12Q96Q35 P2RX3-204ENST00000616487 1346 ntTSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
ALS2CR12Q96Q35 XRCC3-201ENST00000352127 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
ALS2CR12Q96Q35 DNM1P34-201ENST00000567292 2276 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
ALS2CR12Q96Q35 MRM2-203ENST00000440306 1570 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
ALS2CR12Q96Q35 HDAC10-202ENST00000349505 1950 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
ALS2CR12Q96Q35 GOLGA7-204ENST00000520817 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
ALS2CR12Q96Q35 ASB18-201ENST00000409749 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
ALS2CR12Q96Q35 PTGER3-209ENST00000460330 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
ALS2CR12Q96Q35 SCARB1-208ENST00000544327 1812 ntTSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
ALS2CR12Q96Q35 ESRRAP1-201ENST00000400596 1257 ntBASIC19.54■□□□□ 0.72
ALS2CR12Q96Q35 SCARA5-203ENST00000518030 1074 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
ALS2CR12Q96Q35 LY6E-205ENST00000519611 635 ntTSL 3 BASIC19.54■□□□□ 0.72
ALS2CR12Q96Q35 LY6E-212ENST00000522024 868 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
ALS2CR12Q96Q35 AC091564.2-201ENST00000527191 399 ntTSL 3 BASIC19.54■□□□□ 0.72
ALS2CR12Q96Q35 AC233263.1-201ENST00000578059 224 ntBASIC19.54■□□□□ 0.72
ALS2CR12Q96Q35 FFAR2-201ENST00000246549 2051 ntAPPRIS P1 BASIC19.54■□□□□ 0.72
ALS2CR12Q96Q35 BFSP1-201ENST00000377868 2063 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
ALS2CR12Q96Q35 RUBCNL-203ENST00000378787 2731 ntTSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
ALS2CR12Q96Q35 RPS6KB1-204ENST00000443572 1913 ntTSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
ALS2CR12Q96Q35 PSMD8-210ENST00000620216 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
ALS2CR12Q96Q35 MCMBP-201ENST00000360003 4169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
ALS2CR12Q96Q35 NEURL1B-201ENST00000369800 6424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
ALS2CR12Q96Q35 ELN-202ENST00000320399 2274 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
ALS2CR12Q96Q35 TNFRSF19-202ENST00000382258 1625 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
ALS2CR12Q96Q35 ASNS-206ENST00000437628 1638 ntTSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
ALS2CR12Q96Q35 RPN2-201ENST00000237530 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
ALS2CR12Q96Q35 CXXC5-211ENST00000511048 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
ALS2CR12Q96Q35 TRIM33-201ENST00000358465 8339 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
ALS2CR12Q96Q35 CTSA-204ENST00000372484 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
ALS2CR12Q96Q35 NXNL2-202ENST00000375855 1457 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
ALS2CR12Q96Q35 SGCB-201ENST00000381431 4431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
ALS2CR12Q96Q35 KIAA1324L-207ENST00000444627 3527 ntTSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
ALS2CR12Q96Q35 RNPS1-205ENST00000561718 1806 ntTSL 3 BASIC19.53■□□□□ 0.72
ALS2CR12Q96Q35 KCNA2-201ENST00000316361 2827 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
ALS2CR12Q96Q35 HECTD2-203ENST00000371681 2175 ntTSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
ALS2CR12Q96Q35 SLC27A2-202ENST00000380902 2181 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
ALS2CR12Q96Q35 CDK4-202ENST00000312990 1650 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
ALS2CR12Q96Q35 KHDC1-202ENST00000370384 1430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
ALS2CR12Q96Q35 PHGDH-209ENST00000641074 1780 ntBASIC19.53■□□□□ 0.72
ALS2CR12Q96Q35 PIN1-201ENST00000247970 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
ALS2CR12Q96Q35 PRSS57-201ENST00000329267 1025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
ALS2CR12Q96Q35 RALGPS1-206ENST00000394011 819 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
ALS2CR12Q96Q35 KSR1P1-201ENST00000446298 240 ntBASIC19.53■□□□□ 0.72
ALS2CR12Q96Q35 CD99P1-205ENST00000527459 561 ntBASIC19.53■□□□□ 0.72
ALS2CR12Q96Q35 SIVA1-203ENST00000535554 1244 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
ALS2CR12Q96Q35 PSMC3IP-208ENST00000590760 664 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
ALS2CR12Q96Q35 PRSS57-202ENST00000613411 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
ALS2CR12Q96Q35 AC011298.2-201ENST00000617989 482 ntBASIC19.53■□□□□ 0.72
ALS2CR12Q96Q35 SLC30A2-202ENST00000374278 3097 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
ALS2CR12Q96Q35 CBS-201ENST00000352178 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
ALS2CR12Q96Q35 UNC5D-202ENST00000404895 3252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
ALS2CR12Q96Q35 MARCH1-203ENST00000503008 5877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
ALS2CR12Q96Q35 FGFR4-202ENST00000393637 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
ALS2CR12Q96Q35 SBF2-AS1-201ENST00000498905 2709 ntTSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
ALS2CR12Q96Q35 MDFIC-201ENST00000257724 4598 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
ALS2CR12Q96Q35 OARD1-202ENST00000424266 1337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
ALS2CR12Q96Q35 ACSS2-201ENST00000253382 2925 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
ALS2CR12Q96Q35 CNST-202ENST00000366512 2422 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
ALS2CR12Q96Q35 NOS3-210ENST00000484524 2537 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
ALS2CR12Q96Q35 AC012313.1-201ENST00000593393 3059 ntBASIC19.52■□□□□ 0.72
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.9 ms