Protein–RNA interactions for Protein: Q96MW1

CCDC43, Coiled-coil domain-containing protein 43, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 224 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC43Q96MW1 P2RY6-201ENST00000349767 1700 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
CCDC43Q96MW1 NOL4L-211ENST00000621426 6577 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
CCDC43Q96MW1 CABP7-201ENST00000216144 3259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
CCDC43Q96MW1 EGFL7-204ENST00000406555 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
CCDC43Q96MW1 KRT8P50-201ENST00000562022 1438 ntBASIC20.62■□□□□ 0.89
CCDC43Q96MW1 KLHL17-201ENST00000338591 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
CCDC43Q96MW1 SCAND1-203ENST00000615116 1371 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
CCDC43Q96MW1 LRRC27-203ENST00000368613 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
CCDC43Q96MW1 UBL3-201ENST00000380680 4384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
CCDC43Q96MW1 ZBED3-AS1-208ENST00000512001 1668 ntTSL 3 BASIC20.62■□□□□ 0.89
CCDC43Q96MW1 ABCD1-202ENST00000370129 1016 ntTSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
CCDC43Q96MW1 DDRGK1-202ENST00000380201 1128 ntTSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
CCDC43Q96MW1 GGT1-205ENST00000403838 1033 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
CCDC43Q96MW1 AC004540.1-201ENST00000439120 891 ntTSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
CCDC43Q96MW1 AC112907.2-201ENST00000448639 330 ntBASIC20.62■□□□□ 0.89
CCDC43Q96MW1 KRT18P41-201ENST00000518924 1277 ntBASIC20.62■□□□□ 0.89
CCDC43Q96MW1 SDR39U1-202ENST00000538105 1041 ntTSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
CCDC43Q96MW1 AC002310.4-201ENST00000568114 377 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
CCDC43Q96MW1 AL157888.1-201ENST00000631930 593 ntBASIC20.62■□□□□ 0.89
CCDC43Q96MW1 TRIM61-201ENST00000329314 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
CCDC43Q96MW1 AC093525.10-201ENST00000625130 1569 ntBASIC20.62■□□□□ 0.89
CCDC43Q96MW1 ZBTB4-202ENST00000380599 5866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
CCDC43Q96MW1 TMEM8B-204ENST00000439587 2150 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
CCDC43Q96MW1 MSLN-202ENST00000545450 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
CCDC43Q96MW1 ST3GAL3-201ENST00000262915 2470 ntTSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
CCDC43Q96MW1 SMPD1-201ENST00000342245 2452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
CCDC43Q96MW1 NLGN2-204ENST00000575301 4374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
CCDC43Q96MW1 AP5S1-202ENST00000379567 1791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
CCDC43Q96MW1 ABCB9-202ENST00000344275 2394 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
CCDC43Q96MW1 MRPS7-204ENST00000579761 1717 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
CCDC43Q96MW1 FBF1-205ENST00000586717 4825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
CCDC43Q96MW1 IL10RB-201ENST00000290200 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
CCDC43Q96MW1 ADPGK-201ENST00000311669 2557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
CCDC43Q96MW1 HIPK1-207ENST00000369561 3777 ntTSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
CCDC43Q96MW1 SSX2IP-210ENST00000605755 1933 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
CCDC43Q96MW1 CIRBP-202ENST00000413636 1606 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
CCDC43Q96MW1 NTMT1-211ENST00000617943 1346 ntTSL 3 BASIC20.61■□□□□ 0.89
CCDC43Q96MW1 C18orf63-201ENST00000579455 5127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
CCDC43Q96MW1 GDF10-201ENST00000580279 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
CCDC43Q96MW1 CHPF-201ENST00000243776 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
CCDC43Q96MW1 AL671277.2-201ENST00000458060 996 ntBASIC20.61■□□□□ 0.89
CCDC43Q96MW1 CD177-202ENST00000607855 536 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
CCDC43Q96MW1 NDUFAB1-201ENST00000007516 717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
CCDC43Q96MW1 SUFU-201ENST00000369899 1839 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
CCDC43Q96MW1 FBXW11-202ENST00000296933 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
CCDC43Q96MW1 GAMT-202ENST00000447102 1769 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
CCDC43Q96MW1 SNX17-201ENST00000233575 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
CCDC43Q96MW1 SPAG4-201ENST00000374273 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
CCDC43Q96MW1 ACBD5-201ENST00000375888 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
CCDC43Q96MW1 GPR75-201ENST00000394705 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
CCDC43Q96MW1 HLA-G-205ENST00000428701 1578 ntAPPRIS P2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
CCDC43Q96MW1 RHOBTB1-201ENST00000337910 4473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
CCDC43Q96MW1 HCCS-201ENST00000321143 2277 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
CCDC43Q96MW1 SORBS3-221ENST00000523965 2028 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
CCDC43Q96MW1 RFTN1-201ENST00000334133 2982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
CCDC43Q96MW1 CDCP1-201ENST00000296129 6006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
CCDC43Q96MW1 COMTD1-201ENST00000372538 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
CCDC43Q96MW1 HDAC11-AS1-201ENST00000424112 515 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
CCDC43Q96MW1 KRT18P38-201ENST00000449496 1282 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
CCDC43Q96MW1 DGUOK-AS1-203ENST00000453103 601 ntTSL 3 BASIC20.6■□□□□ 0.89
CCDC43Q96MW1 LINC00595-207ENST00000476909 792 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
CCDC43Q96MW1 AF250324.1-201ENST00000506276 703 ntTSL 3 BASIC20.6■□□□□ 0.89
CCDC43Q96MW1 TMEM218-206ENST00000527766 812 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.6■□□□□ 0.89
CCDC43Q96MW1 MIR3180-4-201ENST00000582223 153 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
CCDC43Q96MW1 FGF14-AS2-201ENST00000606448 1074 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
CCDC43Q96MW1 PHC1-212ENST00000543824 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
CCDC43Q96MW1 TRIL-201ENST00000539664 4935 ntAPPRIS P1 BASIC20.6■□□□□ 0.89
CCDC43Q96MW1 GRB7-202ENST00000394204 1667 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
CCDC43Q96MW1 PLA2G7-201ENST00000274793 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
CCDC43Q96MW1 RNF114-201ENST00000244061 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
CCDC43Q96MW1 AC005082.1-201ENST00000413042 2259 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
CCDC43Q96MW1 PCCA-203ENST00000376286 2481 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
CCDC43Q96MW1 EDC3-214ENST00000568176 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
CCDC43Q96MW1 KHNYN-206ENST00000556842 2443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
CCDC43Q96MW1 CROCC2-201ENST00000443866 5382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
CCDC43Q96MW1 BLOC1S3-201ENST00000433642 2601 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
CCDC43Q96MW1 AL499627.1-201ENST00000569373 2188 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
CCDC43Q96MW1 APOLD1-202ENST00000356591 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
CCDC43Q96MW1 LRRC20-205ENST00000395010 2959 ntTSL 3 BASIC20.59■□□□□ 0.89
CCDC43Q96MW1 LINC00634-201ENST00000381348 1510 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
CCDC43Q96MW1 TTC3-203ENST00000399010 2115 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
CCDC43Q96MW1 NLE1-203ENST00000586869 5286 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
CCDC43Q96MW1 MLXIP-201ENST00000319080 8427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
CCDC43Q96MW1 TH-205ENST00000381175 1898 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
CCDC43Q96MW1 SLC26A11-212ENST00000572725 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
CCDC43Q96MW1 ANXA3-201ENST00000264908 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
CCDC43Q96MW1 SLC2A14-214ENST00000542505 1650 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
CCDC43Q96MW1 ELAVL1-202ENST00000593807 856 ntTSL 3 BASIC20.59■□□□□ 0.89
CCDC43Q96MW1 SMIM8-209ENST00000608868 815 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
CCDC43Q96MW1 AL772307.1-201ENST00000639363 1066 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
CCDC43Q96MW1 IL17RC-215ENST00000455057 2244 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
CCDC43Q96MW1 LUC7L2-210ENST00000619796 2783 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
CCDC43Q96MW1 AC007613.1-201ENST00000572811 2597 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
CCDC43Q96MW1 MYLKP1-201ENST00000509077 1580 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
CCDC43Q96MW1 C1QTNF1-209ENST00000581774 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
CCDC43Q96MW1 COL4A3BP-201ENST00000261415 2262 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
CCDC43Q96MW1 RGS3-231ENST00000613049 1726 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
CCDC43Q96MW1 MEN1-201ENST00000312049 2761 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
CCDC43Q96MW1 PLCXD1-202ENST00000381663 1863 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
CCDC43Q96MW1 SPAG16-209ENST00000447990 1330 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.5 ms