Protein–RNA interactions for Protein: Q96JT2

SLC45A3, Solute carrier family 45 member 3, humanhuman

Predictions only

Length 553 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC45A3Q96JT2 RAB4B-EGLN2-201ENST00000594136 2554 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
SLC45A3Q96JT2 NAPRT-202ENST00000426292 1654 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SLC45A3Q96JT2 NFYC-AS1-201ENST00000606277 1687 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
SLC45A3Q96JT2 UBAP1-203ENST00000379186 2524 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
SLC45A3Q96JT2 NPBWR1-201ENST00000331251 2687 ntAPPRIS P1 BASIC18.03■□□□□ 0.48
SLC45A3Q96JT2 RABEP2-202ENST00000358201 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SLC45A3Q96JT2 VEGFA-206ENST00000372077 2834 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SLC45A3Q96JT2 LMNA-207ENST00000368301 2461 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
SLC45A3Q96JT2 DCLK1-203ENST00000379892 2101 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
SLC45A3Q96JT2 GGT1-205ENST00000403838 1033 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SLC45A3Q96JT2 ELOB-202ENST00000409477 997 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SLC45A3Q96JT2 MRPL53-202ENST00000409710 386 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
SLC45A3Q96JT2 SMIM19-202ENST00000416469 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SLC45A3Q96JT2 DAP-202ENST00000432074 1048 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
SLC45A3Q96JT2 TMA7-201ENST00000438607 561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SLC45A3Q96JT2 CBR1-203ENST00000439427 1024 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SLC45A3Q96JT2 AL359075.1-203ENST00000462729 1002 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
SLC45A3Q96JT2 AC104596.1-202ENST00000507486 759 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
SLC45A3Q96JT2 AF186192.2-201ENST00000524514 423 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
SLC45A3Q96JT2 REEP1-207ENST00000535845 1196 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
SLC45A3Q96JT2 IGHMBP2-205ENST00000539224 785 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
SLC45A3Q96JT2 NDUFB10-202ENST00000543683 830 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SLC45A3Q96JT2 C17orf49-208ENST00000552402 760 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
SLC45A3Q96JT2 ANKRD34C-AS1-203ENST00000559225 528 ntTSL 4 BASIC18.03■□□□□ 0.48
SLC45A3Q96JT2 UBA52-210ENST00000598780 668 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
SLC45A3Q96JT2 OBP2B-205ENST00000618116 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SLC45A3Q96JT2 AL023973.1-201ENST00000624619 620 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
SLC45A3Q96JT2 UNKL-202ENST00000301712 1431 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SLC45A3Q96JT2 KRT8P11-201ENST00000409686 1436 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
SLC45A3Q96JT2 ZNF420-201ENST00000304239 1945 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
SLC45A3Q96JT2 RNFT2-204ENST00000407967 2415 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
SLC45A3Q96JT2 TRAPPC2L-201ENST00000301021 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SLC45A3Q96JT2 MTA1-201ENST00000331320 2876 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SLC45A3Q96JT2 MARK2-209ENST00000509502 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
SLC45A3Q96JT2 PARVG-206ENST00000444313 3523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SLC45A3Q96JT2 TACSTD2-201ENST00000371225 2351 ntAPPRIS P1 BASIC18.03■□□□□ 0.48
SLC45A3Q96JT2 MCCC1-201ENST00000265594 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SLC45A3Q96JT2 HIC1-202ENST00000399849 3156 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SLC45A3Q96JT2 PIF1-201ENST00000268043 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SLC45A3Q96JT2 HCLS1-201ENST00000314583 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SLC45A3Q96JT2 HEIH-201ENST00000623091 1652 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
SLC45A3Q96JT2 IDUA-210ENST00000514224 2130 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
SLC45A3Q96JT2 KLC1-217ENST00000554280 2426 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
SLC45A3Q96JT2 HAGHL-203ENST00000389703 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
SLC45A3Q96JT2 HSPB6-201ENST00000004982 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
SLC45A3Q96JT2 STARD4-203ENST00000502322 1467 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
SLC45A3Q96JT2 FAM118A-202ENST00000405673 1612 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
SLC45A3Q96JT2 AP2M1-201ENST00000292807 1931 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
SLC45A3Q96JT2 CCDC43-201ENST00000315286 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
SLC45A3Q96JT2 CYP7B1-201ENST00000310193 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
SLC45A3Q96JT2 PPAN-P2RY11-201ENST00000393796 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
SLC45A3Q96JT2 PLEKHG5-206ENST00000377748 5221 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
SLC45A3Q96JT2 AP000523.1-201ENST00000398242 1049 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
SLC45A3Q96JT2 PRSS44-201ENST00000515154 1146 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
SLC45A3Q96JT2 C5orf30-203ENST00000515669 1573 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
SLC45A3Q96JT2 CCNC-207ENST00000518714 1426 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
SLC45A3Q96JT2 CORO6-210ENST00000580212 2345 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
SLC45A3Q96JT2 LCE1C-202ENST00000607093 644 ntAPPRIS P2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
SLC45A3Q96JT2 AL513523.10-201ENST00000623024 1186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
SLC45A3Q96JT2 ZCWPW1-201ENST00000360951 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.47
SLC45A3Q96JT2 SNHG10-201ENST00000500370 1531 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.47
SLC45A3Q96JT2 HOXC10-201ENST00000303460 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
SLC45A3Q96JT2 DNAJC8-201ENST00000263697 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
SLC45A3Q96JT2 IL17RC-206ENST00000416074 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SLC45A3Q96JT2 CENPA-202ENST00000335756 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SLC45A3Q96JT2 FAM49B-214ENST00000519540 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SLC45A3Q96JT2 N4BP2L1-210ENST00000613078 2032 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
SLC45A3Q96JT2 KANK4-204ENST00000371153 4665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SLC45A3Q96JT2 SCFD2-204ENST00000611795 1320 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
SLC45A3Q96JT2 GALNT2-201ENST00000366672 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SLC45A3Q96JT2 CLDN5-202ENST00000406028 2548 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
SLC45A3Q96JT2 C9orf66-201ENST00000382387 2918 ntAPPRIS P1 BASIC18.01■□□□□ 0.47
SLC45A3Q96JT2 ZNF200-202ENST00000396870 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SLC45A3Q96JT2 FDXR-214ENST00000581530 1827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SLC45A3Q96JT2 AIRN-201ENST00000601203 4374 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
SLC45A3Q96JT2 RTBDN-202ENST00000393233 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
SLC45A3Q96JT2 C21orf91-202ENST00000400558 1090 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SLC45A3Q96JT2 AL596442.1-201ENST00000429305 429 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
SLC45A3Q96JT2 NPM2-204ENST00000518119 1190 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SLC45A3Q96JT2 AL132780.2-201ENST00000557615 1021 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
SLC45A3Q96JT2 CMTM3-210ENST00000565666 769 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
SLC45A3Q96JT2 AC116407.4-201ENST00000623319 1061 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
SLC45A3Q96JT2 NARFL-218ENST00000568545 2486 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
SLC45A3Q96JT2 MBD3-201ENST00000156825 5518 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SLC45A3Q96JT2 C22orf39-205ENST00000542103 1523 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SLC45A3Q96JT2 TMPRSS5-209ENST00000544634 1524 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
SLC45A3Q96JT2 ZHX3-212ENST00000558993 1528 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
SLC45A3Q96JT2 OLFM1-201ENST00000252854 2591 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SLC45A3Q96JT2 RIMBP3C-201ENST00000331505 5475 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
SLC45A3Q96JT2 USP39-201ENST00000323701 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SLC45A3Q96JT2 ARHGAP23-222ENST00000622683 5964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
SLC45A3Q96JT2 TRAPPC12-201ENST00000324266 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SLC45A3Q96JT2 P2RX2-208ENST00000542301 1881 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SLC45A3Q96JT2 ZNF446-207ENST00000610298 1869 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SLC45A3Q96JT2 ADPGK-AS1-201ENST00000563592 2730 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
SLC45A3Q96JT2 AC005332.1-201ENST00000577698 1310 ntBASIC18■□□□□ 0.47
SLC45A3Q96JT2 C8orf58-207ENST00000615223 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
SLC45A3Q96JT2 TULP1-208ENST00000614066 2084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
SLC45A3Q96JT2 DMRT3-201ENST00000190165 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SLC45A3Q96JT2 DUS1L-202ENST00000354321 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 64.2 ms