Protein–RNA interactions for Protein: Q96EM0

L3HYPDH, Trans-3-hydroxy-L-proline dehydratase, humanhuman

Predictions only

Length 354 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
L3HYPDHQ96EM0 NCF1-201ENST00000289473 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
L3HYPDHQ96EM0 EIF3C-211ENST00000566866 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
L3HYPDHQ96EM0 ZNF74-202ENST00000400451 3159 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
L3HYPDHQ96EM0 GABRB2-206ENST00000520240 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
L3HYPDHQ96EM0 PEX16-202ENST00000378750 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
L3HYPDHQ96EM0 GRAP2-202ENST00000407075 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
L3HYPDHQ96EM0 JMJD4-207ENST00000620518 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
L3HYPDHQ96EM0 RABL6-201ENST00000311502 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
L3HYPDHQ96EM0 GOLGA7-204ENST00000520817 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
L3HYPDHQ96EM0 SLC12A4-201ENST00000316341 4765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
L3HYPDHQ96EM0 RREB1-203ENST00000379933 5826 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
L3HYPDHQ96EM0 JPH2-201ENST00000342272 1923 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
L3HYPDHQ96EM0 HIST1H2APS4-201ENST00000362070 348 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
L3HYPDHQ96EM0 TCEAL6-202ENST00000372774 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
L3HYPDHQ96EM0 TNNT3-206ENST00000381579 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
L3HYPDHQ96EM0 AC131097.3-201ENST00000413820 1228 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
L3HYPDHQ96EM0 AL050404.1-201ENST00000424566 802 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
L3HYPDHQ96EM0 AL390728.5-201ENST00000428687 706 ntTSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
L3HYPDHQ96EM0 PHB2-202ENST00000440277 996 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
L3HYPDHQ96EM0 AL451069.1-201ENST00000455414 634 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
L3HYPDHQ96EM0 AL139246.2-201ENST00000456687 1297 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
L3HYPDHQ96EM0 BX088651.1-201ENST00000540551 451 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
L3HYPDHQ96EM0 MLF2-210ENST00000542154 838 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
L3HYPDHQ96EM0 TAF15-211ENST00000604841 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
L3HYPDHQ96EM0 GOLGA2P10-205ENST00000618267 983 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
L3HYPDHQ96EM0 AL513523.10-201ENST00000623024 1186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
L3HYPDHQ96EM0 AC112497.1-201ENST00000624824 639 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
L3HYPDHQ96EM0 KDELC1-201ENST00000376004 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
L3HYPDHQ96EM0 NRSN2-202ENST00000382291 2088 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
L3HYPDHQ96EM0 TREX2-201ENST00000330912 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
L3HYPDHQ96EM0 CHTOP-201ENST00000368686 2250 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
L3HYPDHQ96EM0 AZIN1-201ENST00000337198 4721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
L3HYPDHQ96EM0 IGSF9B-206ENST00000533871 5050 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
L3HYPDHQ96EM0 TMEM45B-201ENST00000281441 2234 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
L3HYPDHQ96EM0 DVL2-201ENST00000005340 3018 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
L3HYPDHQ96EM0 ARNTL-205ENST00000403510 2745 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
L3HYPDHQ96EM0 WNT5B-202ENST00000397196 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
L3HYPDHQ96EM0 AGO3-202ENST00000324350 1726 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
L3HYPDHQ96EM0 PIF1-201ENST00000268043 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
L3HYPDHQ96EM0 MCM9-201ENST00000316068 2442 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
L3HYPDHQ96EM0 MIPEP-201ENST00000382172 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
L3HYPDHQ96EM0 GRAMD2B-218ENST00000542322 2977 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
L3HYPDHQ96EM0 PHC1-212ENST00000543824 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
L3HYPDHQ96EM0 TMSB4X-201ENST00000380633 495 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
L3HYPDHQ96EM0 NDUFB10-202ENST00000543683 830 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
L3HYPDHQ96EM0 FITM1-202ENST00000559294 800 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
L3HYPDHQ96EM0 HCK-210ENST00000629881 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
L3HYPDHQ96EM0 AR-209ENST00000613054 3532 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
L3HYPDHQ96EM0 ADCK5-201ENST00000308860 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
L3HYPDHQ96EM0 SLC47A2-202ENST00000350657 2285 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
L3HYPDHQ96EM0 C1orf159-204ENST00000379339 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
L3HYPDHQ96EM0 ZBTB46-203ENST00000395104 5198 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
L3HYPDHQ96EM0 HLA-DQB1-204ENST00000399084 1734 ntAPPRIS P1 BASIC17.78■□□□□ 0.44
L3HYPDHQ96EM0 KIRREL2-205ENST00000592409 2563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
L3HYPDHQ96EM0 MID1IP1-202ENST00000378474 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
L3HYPDHQ96EM0 AUTS2-201ENST00000342771 6173 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
L3HYPDHQ96EM0 SSC5D-201ENST00000389623 4845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
L3HYPDHQ96EM0 SLCO6A1-202ENST00000389019 2340 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
L3HYPDHQ96EM0 UBXN2A-201ENST00000309033 6066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
L3HYPDHQ96EM0 SIM2-201ENST00000290399 4442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
L3HYPDHQ96EM0 ACD-215ENST00000620761 1483 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
L3HYPDHQ96EM0 POMT2-201ENST00000261534 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
L3HYPDHQ96EM0 SPSB4-201ENST00000310546 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
L3HYPDHQ96EM0 BPHL-203ENST00000380379 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
L3HYPDHQ96EM0 CXCL3-201ENST00000296026 1075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
L3HYPDHQ96EM0 NKAIN4-201ENST00000370307 793 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
L3HYPDHQ96EM0 LTB-210ENST00000429299 897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
L3HYPDHQ96EM0 AC007663.1-201ENST00000438948 1240 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
L3HYPDHQ96EM0 RNF144A-AS1-205ENST00000439208 757 ntTSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.44
L3HYPDHQ96EM0 ZNF706-206ENST00000519744 785 ntTSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.44
L3HYPDHQ96EM0 ETFA-216ENST00000560726 942 ntTSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.44
L3HYPDHQ96EM0 SLC9A3R2-208ENST00000566198 1199 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
L3HYPDHQ96EM0 USP36-216ENST00000589424 970 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
L3HYPDHQ96EM0 PDCD5-207ENST00000590247 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
L3HYPDHQ96EM0 APEH-202ENST00000438011 2249 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
L3HYPDHQ96EM0 UBE3C-201ENST00000348165 5229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
L3HYPDHQ96EM0 PTPN6-204ENST00000456013 2389 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
L3HYPDHQ96EM0 NOMO2-201ENST00000330537 4352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.43
L3HYPDHQ96EM0 ZSWIM4-201ENST00000254323 4339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.43
L3HYPDHQ96EM0 AC140125.2-201ENST00000502515 1517 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
L3HYPDHQ96EM0 SDHA-213ENST00000510361 2148 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.43
L3HYPDHQ96EM0 CAPN1-201ENST00000279247 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
L3HYPDHQ96EM0 CDK16-223ENST00000622098 2968 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
L3HYPDHQ96EM0 NAA60-201ENST00000360862 2522 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
L3HYPDHQ96EM0 ARSA-204ENST00000395621 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
L3HYPDHQ96EM0 RGMB-AS1-201ENST00000498871 1903 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
L3HYPDHQ96EM0 CMTM3-214ENST00000567572 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
L3HYPDHQ96EM0 HPCA-201ENST00000373467 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
L3HYPDHQ96EM0 NR1H2-202ENST00000411902 1466 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
L3HYPDHQ96EM0 DCBLD2-201ENST00000326840 6122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
L3HYPDHQ96EM0 CEP78-204ENST00000415759 2623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
L3HYPDHQ96EM0 ZNF346-208ENST00000511834 2306 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
L3HYPDHQ96EM0 BPIFB4-201ENST00000375483 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
L3HYPDHQ96EM0 KCNQ5-203ENST00000355635 6623 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
L3HYPDHQ96EM0 CSNK2A2-201ENST00000262506 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
L3HYPDHQ96EM0 CD1E-211ENST00000368166 1271 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
L3HYPDHQ96EM0 MED4-202ENST00000378586 931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
L3HYPDHQ96EM0 AL445472.1-201ENST00000452532 1007 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
L3HYPDHQ96EM0 AC004080.6-201ENST00000467897 919 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
L3HYPDHQ96EM0 PACRGL-207ENST00000502938 810 ntTSL 4 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.7 ms