Protein–RNA interactions for Protein: Q92750

TAF4B, Transcription initiation factor TFIID subunit 4B, humanhuman

Predictions only

Length 862 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TAF4BQ92750 TMC6-203ENST00000392467 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
TAF4BQ92750 H1FNT-201ENST00000335017 1300 ntAPPRIS P1 BASIC20.03■□□□□ 0.8
TAF4BQ92750 GPATCH3-201ENST00000361720 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
TAF4BQ92750 SERPINA4-201ENST00000298841 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
TAF4BQ92750 KRCC1-201ENST00000347055 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
TAF4BQ92750 SYT8-202ENST00000381968 1424 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
TAF4BQ92750 AC073508.3-201ENST00000619697 1419 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
TAF4BQ92750 FBF1-205ENST00000586717 4825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
TAF4BQ92750 ZNF419-201ENST00000221735 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
TAF4BQ92750 ATRIP-202ENST00000346691 2509 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
TAF4BQ92750 P2RY6-201ENST00000349767 1700 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
TAF4BQ92750 HES7-201ENST00000317814 678 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
TAF4BQ92750 LINC01063-201ENST00000441644 348 ntTSL 3 BASIC20.03■□□□□ 0.8
TAF4BQ92750 AC010203.1-204ENST00000548782 407 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
TAF4BQ92750 SMN1-211ENST00000625245 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
TAF4BQ92750 SMN2-215ENST00000628696 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
TAF4BQ92750 AC141257.4-201ENST00000634557 245 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
TAF4BQ92750 AC136944.6-201ENST00000634818 245 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
TAF4BQ92750 PPRC1-201ENST00000278070 5330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
TAF4BQ92750 LGALS8-AS1-201ENST00000487567 1457 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
TAF4BQ92750 CLYBL-203ENST00000376355 6771 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
TAF4BQ92750 GTF2H4-202ENST00000376316 1673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
TAF4BQ92750 KRAS-203ENST00000556131 1696 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
TAF4BQ92750 ISYNA1-206ENST00000578963 1691 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
TAF4BQ92750 PLCB3-204ENST00000540288 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
TAF4BQ92750 AC135782.1-201ENST00000537498 2154 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
TAF4BQ92750 EIF4ENIF1-202ENST00000344710 3115 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
TAF4BQ92750 CCT4-204ENST00000544079 2261 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
TAF4BQ92750 RALGPS1-208ENST00000424082 2362 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
TAF4BQ92750 AC112777.1-201ENST00000540175 1423 ntBASIC20.02■□□□□ 0.8
TAF4BQ92750 SAAL1-201ENST00000300013 1518 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
TAF4BQ92750 RASA4B-201ENST00000306682 2589 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
TAF4BQ92750 TOX2-205ENST00000423191 1709 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
TAF4BQ92750 MADD-208ENST00000405573 1823 ntTSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
TAF4BQ92750 HEXB-207ENST00000511181 2021 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
TAF4BQ92750 HNF1A-202ENST00000400024 2337 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
TAF4BQ92750 NFKB2-201ENST00000189444 3011 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
TAF4BQ92750 CAPN10-203ENST00000352879 862 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
TAF4BQ92750 AP000593.1-201ENST00000393668 712 ntBASIC20.02■□□□□ 0.8
TAF4BQ92750 HSD11B1L-205ENST00000422535 730 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
TAF4BQ92750 AC009947.2-201ENST00000444014 672 ntBASIC20.02■□□□□ 0.8
TAF4BQ92750 ATP5G1P1-201ENST00000448724 379 ntBASIC20.02■□□□□ 0.8
TAF4BQ92750 PDCD6-206ENST00000507528 1088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
TAF4BQ92750 PPOX-219ENST00000544598 813 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
TAF4BQ92750 LY6L-201ENST00000562505 988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
TAF4BQ92750 TMEM220-AS1-201ENST00000579114 575 ntTSL 4 BASIC20.02■□□□□ 0.8
TAF4BQ92750 AC009477.2-201ENST00000635976 171 ntAPPRIS P1 BASIC20.02■□□□□ 0.8
TAF4BQ92750 AHSA2-202ENST00000394457 6574 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
TAF4BQ92750 TRIM61-201ENST00000329314 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
TAF4BQ92750 ISL2-201ENST00000290759 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
TAF4BQ92750 TBX20-201ENST00000408931 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
TAF4BQ92750 HOXA9-201ENST00000343483 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
TAF4BQ92750 HYAL1-204ENST00000395144 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
TAF4BQ92750 CBS-203ENST00000398158 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
TAF4BQ92750 CBSL-206ENST00000624406 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
TAF4BQ92750 MYO1B-204ENST00000392318 5082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
TAF4BQ92750 SPART-209ENST00000494062 3018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
TAF4BQ92750 PRDM14-201ENST00000276594 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
TAF4BQ92750 NOC2LP2-201ENST00000407594 1944 ntBASIC20.02■□□□□ 0.79
TAF4BQ92750 COL4A3BP-203ENST00000380494 5651 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.79
TAF4BQ92750 PCED1A-201ENST00000356872 1706 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.79
TAF4BQ92750 MAFG-202ENST00000392366 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
TAF4BQ92750 FARSA-202ENST00000423140 1720 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.79
TAF4BQ92750 AC140125.2-201ENST00000502515 1517 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
TAF4BQ92750 GAS7-210ENST00000579158 1528 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
TAF4BQ92750 ART1-201ENST00000250693 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
TAF4BQ92750 CIRBP-201ENST00000320936 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
TAF4BQ92750 CIRBP-207ENST00000586472 1303 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC20.02■□□□□ 0.79
TAF4BQ92750 VIPR1-201ENST00000325123 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
TAF4BQ92750 PTPRF-209ENST00000438120 6377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
TAF4BQ92750 NOMO3-201ENST00000263012 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
TAF4BQ92750 TULP1-208ENST00000614066 2084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
TAF4BQ92750 ACTG1-201ENST00000331925 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
TAF4BQ92750 SLC25A48-201ENST00000274513 1880 ntTSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
TAF4BQ92750 PLA2G2F-201ENST00000375102 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
TAF4BQ92750 VPS26B-202ENST00000525095 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
TAF4BQ92750 NGLY1-207ENST00000428257 2534 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
TAF4BQ92750 SEMA3B-209ENST00000456560 2221 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
TAF4BQ92750 ALKBH4-201ENST00000292566 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
TAF4BQ92750 COMMD1-201ENST00000311832 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
TAF4BQ92750 ICAM4-201ENST00000340992 1176 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
TAF4BQ92750 SPNS3-201ENST00000355530 2133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
TAF4BQ92750 MED4-202ENST00000378586 931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
TAF4BQ92750 AC005521.1-201ENST00000393351 872 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
TAF4BQ92750 CT47A4-201ENST00000415858 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
TAF4BQ92750 CT47A9-201ENST00000417256 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
TAF4BQ92750 CT47A6-201ENST00000419194 1298 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
TAF4BQ92750 CT47A10-201ENST00000430448 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
TAF4BQ92750 CT47A5-201ENST00000439466 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
TAF4BQ92750 CT47A3-201ENST00000441330 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
TAF4BQ92750 CT47A8-201ENST00000457977 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
TAF4BQ92750 CT47A2-201ENST00000458218 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
TAF4BQ92750 AC008825.1-201ENST00000504398 452 ntTSL 3 BASIC20.01■□□□□ 0.79
TAF4BQ92750 AC104596.1-202ENST00000507486 759 ntTSL 3 BASIC20.01■□□□□ 0.79
TAF4BQ92750 NT5C-210ENST00000582160 860 ntTSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
TAF4BQ92750 BCL2L12-208ENST00000600947 633 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
TAF4BQ92750 CTNNBL1-201ENST00000361383 1925 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
TAF4BQ92750 ABALON-201ENST00000629058 1903 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
TAF4BQ92750 EIF2B5-201ENST00000273783 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
TAF4BQ92750 SIN3A-203ENST00000394949 4930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 79.2 ms