Protein–RNA interactions for Protein: Q92576

PHF3, PHD finger protein 3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 2,039 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PHF3Q92576 DHRS4-203ENST00000397075 727 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
PHF3Q92576 SEC61G-203ENST00000415949 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
PHF3Q92576 ZNF549-203ENST00000594943 556 ntTSL 4 BASIC16.48■□□□□ 0.23
PHF3Q92576 RABAC1-208ENST00000601078 728 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
PHF3Q92576 TPSB2-201ENST00000606293 1165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
PHF3Q92576 AC092119.3-201ENST00000612618 583 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
PHF3Q92576 AL365255.1-201ENST00000637702 847 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
PHF3Q92576 CCDC3-201ENST00000378825 2731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
PHF3Q92576 NKX2-1-203ENST00000518149 2583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
PHF3Q92576 CAMKK2-207ENST00000404169 2116 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
PHF3Q92576 PEX5L-206ENST00000465751 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
PHF3Q92576 FADS1-204ENST00000433932 1690 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
PHF3Q92576 BAZ1B-202ENST00000404251 5428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
PHF3Q92576 NFKBIZ-201ENST00000326151 2058 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
PHF3Q92576 BAIAP2-204ENST00000428708 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
PHF3Q92576 GTF2IP4-202ENST00000544802 3609 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
PHF3Q92576 ASL-205ENST00000395332 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
PHF3Q92576 CENPT-215ENST00000564817 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
PHF3Q92576 BTG3-201ENST00000339775 1485 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
PHF3Q92576 CLK1-205ENST00000434813 2026 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
PHF3Q92576 GBX2-203ENST00000551105 1307 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
PHF3Q92576 SRP9-203ENST00000366839 1596 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
PHF3Q92576 MPZ-206ENST00000533357 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
PHF3Q92576 FDXR-214ENST00000581530 1827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
PHF3Q92576 AKR7L-201ENST00000420396 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
PHF3Q92576 MOBP-204ENST00000420739 940 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
PHF3Q92576 TOB2P1-201ENST00000469761 992 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
PHF3Q92576 CIB2-208ENST00000560618 804 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
PHF3Q92576 AC009084.1-201ENST00000566869 317 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
PHF3Q92576 SNHG15-203ENST00000578968 982 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
PHF3Q92576 AC015961.2-201ENST00000589281 701 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
PHF3Q92576 SSBP1-215ENST00000612337 884 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
PHF3Q92576 AC243773.1-201ENST00000614759 544 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
PHF3Q92576 HOXC10-201ENST00000303460 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
PHF3Q92576 SEPHS1-206ENST00000545675 2988 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
PHF3Q92576 IL34-201ENST00000288098 1607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
PHF3Q92576 WRB-201ENST00000333781 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
PHF3Q92576 CIRBP-202ENST00000413636 1606 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
PHF3Q92576 LYPD3-201ENST00000244333 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
PHF3Q92576 PTX4-201ENST00000293922 1422 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
PHF3Q92576 NCOA6-207ENST00000616167 3271 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
PHF3Q92576 HS3ST3A1-201ENST00000284110 2527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
PHF3Q92576 MTERF2-202ENST00000392830 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
PHF3Q92576 DCTN3-201ENST00000259632 808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
PHF3Q92576 MPIG6B-202ENST00000375805 668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
PHF3Q92576 GNB1L-203ENST00000405009 1076 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
PHF3Q92576 CYCS-202ENST00000409409 974 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
PHF3Q92576 ITM2C-204ENST00000409704 1106 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
PHF3Q92576 UNC93B7-201ENST00000509439 705 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
PHF3Q92576 PNN-202ENST00000553331 656 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
PHF3Q92576 TMIGD2-202ENST00000595645 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
PHF3Q92576 CYP1B1-AS1-214ENST00000620177 554 ntTSL 4 BASIC16.47■□□□□ 0.23
PHF3Q92576 TP53I3-202ENST00000335934 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
PHF3Q92576 CNOT11-201ENST00000289382 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
PHF3Q92576 DHRS12-201ENST00000218981 1970 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
PHF3Q92576 AC233702.3-201ENST00000578656 1387 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
PHF3Q92576 FAM213B-201ENST00000378424 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
PHF3Q92576 KRT8P32-201ENST00000512863 1461 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
PHF3Q92576 EDNRA-206ENST00000511804 1569 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
PHF3Q92576 CPT2-207ENST00000636867 2643 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
PHF3Q92576 VPS37D-202ENST00000451519 1303 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
PHF3Q92576 ZNF664-207ENST00000539644 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
PHF3Q92576 XYLT2-203ENST00000507602 2107 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
PHF3Q92576 ASZ1-201ENST00000284629 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
PHF3Q92576 NDUFS7-201ENST00000233627 1039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
PHF3Q92576 TBC1D7-202ENST00000356436 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
PHF3Q92576 TBC1D7-204ENST00000379300 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
PHF3Q92576 FAM239B-201ENST00000381106 1099 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
PHF3Q92576 AP000593.1-201ENST00000393668 712 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
PHF3Q92576 TSSC2-201ENST00000450217 709 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
PHF3Q92576 KRT17P6-201ENST00000453795 1220 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
PHF3Q92576 AC104819.1-201ENST00000504587 486 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
PHF3Q92576 AC092338.2-202ENST00000567158 611 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
PHF3Q92576 EXOSC3-201ENST00000327304 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
PHF3Q92576 EDC3-214ENST00000568176 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
PHF3Q92576 RNF135-201ENST00000324689 1905 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
PHF3Q92576 KCNC4-203ENST00000413138 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
PHF3Q92576 ARPC4-201ENST00000397261 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
PHF3Q92576 AMDHD2-203ENST00000413459 2049 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
PHF3Q92576 KRT89P-201ENST00000620027 1478 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
PHF3Q92576 FAM213B-202ENST00000378425 2665 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
PHF3Q92576 RASSF1-201ENST00000327761 1757 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
PHF3Q92576 SMIM24-201ENST00000215531 1329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
PHF3Q92576 SMARCD1-201ENST00000381513 3237 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
PHF3Q92576 STN1-201ENST00000224950 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
PHF3Q92576 APBB1-207ENST00000529519 1442 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
PHF3Q92576 SCYL1-203ENST00000420247 2583 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
PHF3Q92576 NDN-201ENST00000331837 1931 ntAPPRIS P1 BASIC16.46■□□□□ 0.23
PHF3Q92576 SSX2IP-210ENST00000605755 1933 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
PHF3Q92576 PCDHB2-202ENST00000622947 2231 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
PHF3Q92576 ZNF274-203ENST00000424679 2539 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
PHF3Q92576 CHST2-201ENST00000309575 4582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
PHF3Q92576 GAD2-202ENST00000376248 680 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
PHF3Q92576 CRELD2-202ENST00000403427 1242 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
PHF3Q92576 FDX1P1-201ENST00000449115 551 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
PHF3Q92576 MTG1-205ENST00000477902 1283 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
PHF3Q92576 SMN2-213ENST00000614240 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
PHF3Q92576 CABP1-201ENST00000288616 1369 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
PHF3Q92576 TEX13A-201ENST00000600991 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
PHF3Q92576 FKBP3-201ENST00000216330 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.8 ms