Protein–RNA interactions for Protein: Q8TEQ0

SNX29, Sorting nexin-29, humanhuman

Predictions only

Length 813 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNX29Q8TEQ0 CHPF-201ENST00000243776 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
SNX29Q8TEQ0 LINC00461-203ENST00000504246 2300 ntTSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
SNX29Q8TEQ0 PRELID3A-209ENST00000592149 2001 ntTSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
SNX29Q8TEQ0 ERICH1-201ENST00000262109 1813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
SNX29Q8TEQ0 CYB561-205ENST00000542042 1302 ntTSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
SNX29Q8TEQ0 SRRM2-AS1-203ENST00000571305 1344 ntTSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
SNX29Q8TEQ0 DBN1-201ENST00000292385 3072 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
SNX29Q8TEQ0 SHKBP1-201ENST00000291842 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
SNX29Q8TEQ0 AL391807.1-203ENST00000604392 2365 ntBASIC20.52■□□□□ 0.88
SNX29Q8TEQ0 LONP1-201ENST00000360614 3236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
SNX29Q8TEQ0 FLYWCH1P1-201ENST00000460917 1874 ntBASIC20.52■□□□□ 0.88
SNX29Q8TEQ0 PRDM5-201ENST00000264808 5330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
SNX29Q8TEQ0 PHGDH-209ENST00000641074 1780 ntBASIC20.52■□□□□ 0.88
SNX29Q8TEQ0 IRGC-201ENST00000244314 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
SNX29Q8TEQ0 ZFC3H1-211ENST00000552037 1484 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
SNX29Q8TEQ0 ZNF655-203ENST00000357864 1370 ntTSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
SNX29Q8TEQ0 KCNH1-214ENST00000640566 1365 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
SNX29Q8TEQ0 TLE4-205ENST00000376544 4871 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
SNX29Q8TEQ0 ABCD1-202ENST00000370129 1016 ntTSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
SNX29Q8TEQ0 FAM8A6P-201ENST00000407496 1135 ntBASIC20.52■□□□□ 0.88
SNX29Q8TEQ0 AC114763.1-202ENST00000414911 867 ntTSL 3 BASIC20.52■□□□□ 0.88
SNX29Q8TEQ0 HELT-202ENST00000505610 846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
SNX29Q8TEQ0 CCNG1-211ENST00000512163 919 ntTSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
SNX29Q8TEQ0 LY6E-210ENST00000521182 1079 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
SNX29Q8TEQ0 HEXB-207ENST00000511181 2021 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
SNX29Q8TEQ0 FOXD4L6-201ENST00000622588 2034 ntAPPRIS P1 BASIC20.52■□□□□ 0.88
SNX29Q8TEQ0 TBC1D3I-202ENST00000618620 1900 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
SNX29Q8TEQ0 ABALON-201ENST00000629058 1903 ntBASIC20.52■□□□□ 0.88
SNX29Q8TEQ0 HERPUD2-201ENST00000311350 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
SNX29Q8TEQ0 GDF10-201ENST00000580279 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
SNX29Q8TEQ0 EVI5L-201ENST00000270530 3855 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
SNX29Q8TEQ0 EGFL6-201ENST00000361306 2398 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
SNX29Q8TEQ0 SULF2-201ENST00000359930 4915 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
SNX29Q8TEQ0 C6orf203-202ENST00000405204 1420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.87
SNX29Q8TEQ0 FIBCD1-201ENST00000372337 1868 ntTSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.87
SNX29Q8TEQ0 AGPAT3-201ENST00000291572 5546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
SNX29Q8TEQ0 PRPF39-201ENST00000355765 2868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
SNX29Q8TEQ0 C21orf59-201ENST00000290155 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
SNX29Q8TEQ0 SEPT9-236ENST00000591088 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
SNX29Q8TEQ0 TESMIN-201ENST00000255087 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
SNX29Q8TEQ0 PTPA-201ENST00000337738 2845 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
SNX29Q8TEQ0 LINC00535-201ENST00000501400 1914 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
SNX29Q8TEQ0 CMTM3-201ENST00000361909 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
SNX29Q8TEQ0 NDUFAF2-201ENST00000296597 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
SNX29Q8TEQ0 RHEBL1-201ENST00000301068 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
SNX29Q8TEQ0 PYDC1-201ENST00000302964 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
SNX29Q8TEQ0 TSPY8-203ENST00000383005 435 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
SNX29Q8TEQ0 MALL-203ENST00000427178 1070 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
SNX29Q8TEQ0 AC112907.2-201ENST00000448639 330 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
SNX29Q8TEQ0 MYD88-211ENST00000495303 976 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
SNX29Q8TEQ0 GSTZ1-218ENST00000557053 580 ntTSL 3 BASIC20.51■□□□□ 0.87
SNX29Q8TEQ0 SLC9A3R2-208ENST00000566198 1199 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
SNX29Q8TEQ0 RALY-203ENST00000375114 6430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
SNX29Q8TEQ0 KCNMA1-278ENST00000640141 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
SNX29Q8TEQ0 POR-209ENST00000439269 1858 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
SNX29Q8TEQ0 RPS6KA1-204ENST00000374168 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
SNX29Q8TEQ0 TMEM206-201ENST00000261455 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
SNX29Q8TEQ0 POLD3-203ENST00000527458 2122 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
SNX29Q8TEQ0 KRT13-201ENST00000246635 1699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
SNX29Q8TEQ0 AL390961.4-201ENST00000623958 2535 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
SNX29Q8TEQ0 PDLIM7-203ENST00000359895 1567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
SNX29Q8TEQ0 PSMD8-207ENST00000592035 1581 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
SNX29Q8TEQ0 CCNJ-203ENST00000465148 2677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
SNX29Q8TEQ0 RXRB-202ENST00000374685 2846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
SNX29Q8TEQ0 DHRS2-201ENST00000250383 1705 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
SNX29Q8TEQ0 GPT-202ENST00000394955 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
SNX29Q8TEQ0 TM2D2-201ENST00000397070 1631 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
SNX29Q8TEQ0 ASB7-203ENST00000558747 2133 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
SNX29Q8TEQ0 C1QTNF1-209ENST00000581774 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
SNX29Q8TEQ0 AATK-203ENST00000417379 5081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
SNX29Q8TEQ0 ZNF280B-203ENST00000626650 5721 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
SNX29Q8TEQ0 COPE-201ENST00000262812 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
SNX29Q8TEQ0 COPE-203ENST00000351079 907 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
SNX29Q8TEQ0 AL035541.1-201ENST00000424850 823 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
SNX29Q8TEQ0 HAGLR-204ENST00000425005 623 ntTSL 3 BASIC20.5■□□□□ 0.87
SNX29Q8TEQ0 LTBR-211ENST00000543190 785 ntTSL 3 BASIC20.5■□□□□ 0.87
SNX29Q8TEQ0 IFI27L2-206ENST00000556727 556 ntTSL 3 BASIC20.5■□□□□ 0.87
SNX29Q8TEQ0 DCTN5-208ENST00000568589 772 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
SNX29Q8TEQ0 AC020911.2-202ENST00000588945 593 ntTSL 3 BASIC20.5■□□□□ 0.87
SNX29Q8TEQ0 ELAVL1-202ENST00000593807 856 ntTSL 3 BASIC20.5■□□□□ 0.87
SNX29Q8TEQ0 FGF14-AS2-201ENST00000606448 1074 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
SNX29Q8TEQ0 RNASET2-213ENST00000611959 1124 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
SNX29Q8TEQ0 AC011416.4-201ENST00000639283 2195 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
SNX29Q8TEQ0 ITGB5-201ENST00000296181 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
SNX29Q8TEQ0 DOK7-201ENST00000340083 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
SNX29Q8TEQ0 DOK7-203ENST00000507039 2551 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
SNX29Q8TEQ0 PLEKHG5-212ENST00000537245 4794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
SNX29Q8TEQ0 ST3GAL3-201ENST00000262915 2470 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
SNX29Q8TEQ0 SNAPC3-207ENST00000610884 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
SNX29Q8TEQ0 AC142086.1-202ENST00000398669 1839 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
SNX29Q8TEQ0 SEMA3B-209ENST00000456560 2221 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
SNX29Q8TEQ0 TTLL9-205ENST00000375938 2623 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
SNX29Q8TEQ0 KIFC3-201ENST00000379655 3427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
SNX29Q8TEQ0 FLYWCH1-201ENST00000253928 5037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
SNX29Q8TEQ0 MID1IP1-202ENST00000378474 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
SNX29Q8TEQ0 ARPC4-201ENST00000397261 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
SNX29Q8TEQ0 HCG11-201ENST00000411553 5696 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
SNX29Q8TEQ0 ZSWIM4-201ENST00000254323 4339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
SNX29Q8TEQ0 GPC2-201ENST00000292377 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
SNX29Q8TEQ0 TMEM190-201ENST00000291934 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.8 ms