Protein–RNA interactions for Protein: Q8NDY6

BHLHE23, Class E basic helix-loop-helix protein 23, humanhuman

Predictions only

Length 225 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BHLHE23Q8NDY6 PEX16-202ENST00000378750 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
BHLHE23Q8NDY6 PPP1R7-207ENST00000407025 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
BHLHE23Q8NDY6 GLDN-201ENST00000335449 4971 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
BHLHE23Q8NDY6 PHRF1-205ENST00000533464 5218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
BHLHE23Q8NDY6 AJUBA-202ENST00000361265 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
BHLHE23Q8NDY6 E2F2-201ENST00000361729 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
BHLHE23Q8NDY6 FAM131A-202ENST00000340957 2421 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
BHLHE23Q8NDY6 SLCO6A1-201ENST00000379807 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
BHLHE23Q8NDY6 DOC2B-203ENST00000613549 6048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
BHLHE23Q8NDY6 AC012615.6-201ENST00000593201 1697 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
BHLHE23Q8NDY6 SYT8-202ENST00000381968 1424 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
BHLHE23Q8NDY6 AC106820.2-201ENST00000563775 3264 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
BHLHE23Q8NDY6 OPRD1-201ENST00000234961 9345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
BHLHE23Q8NDY6 RASSF1-201ENST00000327761 1757 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
BHLHE23Q8NDY6 PHB2-203ENST00000535923 1515 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
BHLHE23Q8NDY6 INTS11-249ENST00000618806 1523 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
BHLHE23Q8NDY6 KCNQ2-218ENST00000629676 2399 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
BHLHE23Q8NDY6 NDUFA12-201ENST00000327772 635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
BHLHE23Q8NDY6 MIR564-202ENST00000385049 94 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
BHLHE23Q8NDY6 KRTAP5-3-201ENST00000399685 899 ntAPPRIS P1 BASIC15.96■□□□□ 0.15
BHLHE23Q8NDY6 RNF144A-AS1-204ENST00000437589 618 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
BHLHE23Q8NDY6 MUC1-211ENST00000438413 927 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
BHLHE23Q8NDY6 AP006621.4-201ENST00000527021 532 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
BHLHE23Q8NDY6 AC015712.4-203ENST00000559673 630 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
BHLHE23Q8NDY6 JOSD2-204ENST00000598418 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
BHLHE23Q8NDY6 AL590627.2-201ENST00000637510 144 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
BHLHE23Q8NDY6 ADPGK-AS1-201ENST00000563592 2730 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
BHLHE23Q8NDY6 FBXW11-202ENST00000296933 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
BHLHE23Q8NDY6 AC034236.2-201ENST00000606662 1610 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
BHLHE23Q8NDY6 INPP5J-205ENST00000404390 2215 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
BHLHE23Q8NDY6 TSPAN17-201ENST00000298564 2810 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
BHLHE23Q8NDY6 TRIM8-201ENST00000302424 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
BHLHE23Q8NDY6 APP-203ENST00000354192 3167 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
BHLHE23Q8NDY6 PDXK-219ENST00000621478 1967 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
BHLHE23Q8NDY6 PTPRK-218ENST00000525459 1722 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
BHLHE23Q8NDY6 DUS1L-202ENST00000354321 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
BHLHE23Q8NDY6 TTLL8-201ENST00000266182 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.14
BHLHE23Q8NDY6 CYR61-201ENST00000451137 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
BHLHE23Q8NDY6 KDM4B-202ENST00000381759 3058 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
BHLHE23Q8NDY6 TCEA1-201ENST00000396401 2718 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
BHLHE23Q8NDY6 SCARB1-203ENST00000415380 2731 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.14
BHLHE23Q8NDY6 POM121C-208ENST00000615331 5835 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
BHLHE23Q8NDY6 PXK-206ENST00000463280 2825 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
BHLHE23Q8NDY6 CIRBP-201ENST00000320936 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
BHLHE23Q8NDY6 CIRBP-207ENST00000586472 1303 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
BHLHE23Q8NDY6 EFTUD1P1-204ENST00000560401 1798 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
BHLHE23Q8NDY6 STK25-203ENST00000403346 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
BHLHE23Q8NDY6 CBL-204ENST00000634840 4813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
BHLHE23Q8NDY6 VPS26A-202ENST00000373382 3229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
BHLHE23Q8NDY6 DHRS12-201ENST00000218981 1970 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
BHLHE23Q8NDY6 RARRES1-201ENST00000237696 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
BHLHE23Q8NDY6 CD276-203ENST00000537340 2439 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
BHLHE23Q8NDY6 PHKA1-201ENST00000339490 6121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
BHLHE23Q8NDY6 ADRA1A-201ENST00000276393 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
BHLHE23Q8NDY6 HMGA1P5-201ENST00000412453 271 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
BHLHE23Q8NDY6 LINC01534-202ENST00000433232 554 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
BHLHE23Q8NDY6 ADCYAP1-202ENST00000450565 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
BHLHE23Q8NDY6 YKT6-207ENST00000496112 1270 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
BHLHE23Q8NDY6 DUT-205ENST00000558813 769 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
BHLHE23Q8NDY6 AL929554.1-201ENST00000568665 460 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
BHLHE23Q8NDY6 AC004448.5-201ENST00000579897 567 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
BHLHE23Q8NDY6 TRAPPC6A-201ENST00000006275 805 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
BHLHE23Q8NDY6 FAM3A-201ENST00000322269 1815 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
BHLHE23Q8NDY6 AC118553.2-203ENST00000639037 2590 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
BHLHE23Q8NDY6 BTG3-201ENST00000339775 1485 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
BHLHE23Q8NDY6 VHL-202ENST00000345392 2696 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
BHLHE23Q8NDY6 NARFL-201ENST00000251588 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
BHLHE23Q8NDY6 MEF2A-204ENST00000557785 2854 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
BHLHE23Q8NDY6 CASKIN2-201ENST00000321617 5015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
BHLHE23Q8NDY6 ILK-203ENST00000420936 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
BHLHE23Q8NDY6 SLC2A14-214ENST00000542505 1650 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
BHLHE23Q8NDY6 KRAS-203ENST00000556131 1696 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
BHLHE23Q8NDY6 TICAM1-202ENST00000621756 1650 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
BHLHE23Q8NDY6 PLCB3-204ENST00000540288 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
BHLHE23Q8NDY6 AC020916.1-201ENST00000587762 1774 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
BHLHE23Q8NDY6 TRAPPC12-201ENST00000324266 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
BHLHE23Q8NDY6 CTSA-201ENST00000191018 1898 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
BHLHE23Q8NDY6 AP005717.1-201ENST00000500705 1899 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
BHLHE23Q8NDY6 HYOU1-212ENST00000532519 2162 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
BHLHE23Q8NDY6 CUTC-202ENST00000370476 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
BHLHE23Q8NDY6 PPP4C-202ENST00000561610 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
BHLHE23Q8NDY6 EGFL6-201ENST00000361306 2398 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
BHLHE23Q8NDY6 FBXW9-203ENST00000587955 1437 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
BHLHE23Q8NDY6 AP003071.5-201ENST00000641568 2695 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
BHLHE23Q8NDY6 AL365232.1-201ENST00000423730 1636 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
BHLHE23Q8NDY6 MFSD14A-201ENST00000370152 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
BHLHE23Q8NDY6 TRPM4-213ENST00000599628 1829 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
BHLHE23Q8NDY6 HPS3-202ENST00000460120 2745 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
BHLHE23Q8NDY6 MCF2L-203ENST00000375604 6445 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
BHLHE23Q8NDY6 PHB2-202ENST00000440277 996 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
BHLHE23Q8NDY6 TMUB1-205ENST00000482202 899 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
BHLHE23Q8NDY6 GPX4-207ENST00000589115 812 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
BHLHE23Q8NDY6 PHOSPHO2-206ENST00000616481 1252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
BHLHE23Q8NDY6 PHOSPHO2-208ENST00000617738 1053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
BHLHE23Q8NDY6 FP565260.3-205ENST00000620481 816 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
BHLHE23Q8NDY6 MYC-208ENST00000641036 567 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
BHLHE23Q8NDY6 NOMO3-201ENST00000263012 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
BHLHE23Q8NDY6 LRCH1-201ENST00000311191 4710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
BHLHE23Q8NDY6 NAPRT-202ENST00000426292 1654 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
BHLHE23Q8NDY6 TRAK1-209ENST00000487159 5536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.3 ms