Protein–RNA interactions for Protein: Q8N6F1

CLDN19, Claudin-19, humanhuman

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Length 224 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLDN19Q8N6F1 SMIM29-209ENST00000636500 1186 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CLDN19Q8N6F1 PRELID3A-209ENST00000592149 2001 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
CLDN19Q8N6F1 TBC1D3I-202ENST00000618620 1900 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CLDN19Q8N6F1 PJA1-202ENST00000374571 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CLDN19Q8N6F1 ACSL6-205ENST00000379246 2622 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CLDN19Q8N6F1 CCDC63-202ENST00000545036 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
CLDN19Q8N6F1 IRGC-201ENST00000244314 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CLDN19Q8N6F1 LEFTY2-201ENST00000366820 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CLDN19Q8N6F1 BMP8B-201ENST00000372827 4822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CLDN19Q8N6F1 AC011416.4-201ENST00000639283 2195 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
CLDN19Q8N6F1 CIAO1-203ENST00000488633 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
CLDN19Q8N6F1 ASB7-203ENST00000558747 2133 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
CLDN19Q8N6F1 CD276-201ENST00000318424 2738 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
CLDN19Q8N6F1 ADAMTS16-203ENST00000511368 2682 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
CLDN19Q8N6F1 VPS37B-201ENST00000267202 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
CLDN19Q8N6F1 ZFYVE21-202ENST00000311141 1383 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
CLDN19Q8N6F1 MAP4K4-204ENST00000350198 7316 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
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CLDN19Q8N6F1 SIM2-201ENST00000290399 4442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
CLDN19Q8N6F1 RHEBL1-201ENST00000301068 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
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CLDN19Q8N6F1 C16orf74-207ENST00000602914 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
CLDN19Q8N6F1 PHGDH-209ENST00000641074 1780 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
CLDN19Q8N6F1 SEMA3B-209ENST00000456560 2221 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
CLDN19Q8N6F1 NUMBL-207ENST00000598779 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
CLDN19Q8N6F1 SEPT9-236ENST00000591088 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
CLDN19Q8N6F1 NOMO2-201ENST00000330537 4352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
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CLDN19Q8N6F1 IL15-201ENST00000296545 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
CLDN19Q8N6F1 HEXB-207ENST00000511181 2021 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
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CLDN19Q8N6F1 HIPK1-207ENST00000369561 3777 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
CLDN19Q8N6F1 SPAG4-201ENST00000374273 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CLDN19Q8N6F1 ERICH1-201ENST00000262109 1813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CLDN19Q8N6F1 CNOT11-201ENST00000289382 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CLDN19Q8N6F1 PLPPR2-208ENST00000591608 2552 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CLDN19Q8N6F1 MSLN-202ENST00000545450 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
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CLDN19Q8N6F1 CARD10-202ENST00000403299 4113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CLDN19Q8N6F1 MIR4300HG-201ENST00000500502 1397 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
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CLDN19Q8N6F1 EIF2B5-201ENST00000273783 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CLDN19Q8N6F1 ADCK5-201ENST00000308860 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
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CLDN19Q8N6F1 EWSR1-207ENST00000406548 2207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
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CLDN19Q8N6F1 ARNT-202ENST00000358595 4887 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CLDN19Q8N6F1 SRRM2-AS1-203ENST00000571305 1344 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CLDN19Q8N6F1 FIBCD1-201ENST00000372337 1868 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CLDN19Q8N6F1 PTCRA-201ENST00000304672 1080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CLDN19Q8N6F1 DNAJC4-201ENST00000321460 1015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CLDN19Q8N6F1 GPATCH3-201ENST00000361720 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CLDN19Q8N6F1 GUK1-204ENST00000366721 689 ntTSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CLDN19Q8N6F1 FAM8A6P-201ENST00000407496 1135 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
CLDN19Q8N6F1 PTCRA-202ENST00000441198 1005 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CLDN19Q8N6F1 PTCRA-203ENST00000446507 759 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CLDN19Q8N6F1 AC112907.2-201ENST00000448639 330 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
CLDN19Q8N6F1 LY6E-210ENST00000521182 1079 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CLDN19Q8N6F1 LTBR-211ENST00000543190 785 ntTSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CLDN19Q8N6F1 AL049597.2-201ENST00000565575 961 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
CLDN19Q8N6F1 DCTN5-208ENST00000568589 772 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CLDN19Q8N6F1 PSMD8-202ENST00000585598 541 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CLDN19Q8N6F1 CACNA1A-218ENST00000635895 8657 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CLDN19Q8N6F1 CACNA1A-257ENST00000638009 8665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CLDN19Q8N6F1 SSUH2-202ENST00000341795 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CLDN19Q8N6F1 AGPAT3-201ENST00000291572 5546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CLDN19Q8N6F1 AC008687.8-201ENST00000599795 1748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CLDN19Q8N6F1 FCMR-201ENST00000367091 1950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
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