Protein–RNA interactions for Protein: Q6NZ36

FAAP20, Fanconi anemia core complex-associated protein 20, humanhuman

Predictions only

Length 180 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAAP20Q6NZ36 ACTB-201ENST00000331789 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
FAAP20Q6NZ36 RAB17-201ENST00000264601 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
FAAP20Q6NZ36 NDUFB1-201ENST00000329559 528 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
FAAP20Q6NZ36 FAIM-202ENST00000360570 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
FAAP20Q6NZ36 GUK1-205ENST00000366722 850 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
FAAP20Q6NZ36 CSF1-205ENST00000420111 1083 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
FAAP20Q6NZ36 AC137630.1-201ENST00000452042 782 ntTSL 4 BASIC15.59■□□□□ 0.09
FAAP20Q6NZ36 C1orf52-203ENST00000471115 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
FAAP20Q6NZ36 AC104986.2-201ENST00000521696 380 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
FAAP20Q6NZ36 RHOD-202ENST00000532559 538 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
FAAP20Q6NZ36 SEPT4-215ENST00000580809 952 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
FAAP20Q6NZ36 FXYD3-214ENST00000605677 633 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
FAAP20Q6NZ36 MARS-234ENST00000630571 216 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
FAAP20Q6NZ36 MARS-235ENST00000630803 183 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
FAAP20Q6NZ36 ZSCAN10-202ENST00000538082 2350 ntTSL 4 BASIC15.59■□□□□ 0.09
FAAP20Q6NZ36 SAYSD1-201ENST00000229903 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
FAAP20Q6NZ36 TSHZ1-204ENST00000580243 3582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
FAAP20Q6NZ36 CD58-203ENST00000457047 1328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
FAAP20Q6NZ36 RBM42-204ENST00000589559 1328 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
FAAP20Q6NZ36 RXRB-201ENST00000374680 2908 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
FAAP20Q6NZ36 PACS2-202ENST00000430725 2944 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
FAAP20Q6NZ36 CLDN11-201ENST00000064724 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
FAAP20Q6NZ36 SHANK1-201ENST00000293441 6643 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
FAAP20Q6NZ36 ZNF211-211ENST00000541801 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
FAAP20Q6NZ36 PCDHGA12-202ENST00000613314 2634 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
FAAP20Q6NZ36 CAV3-201ENST00000343849 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
FAAP20Q6NZ36 ASCL5-202ENST00000458416 1420 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
FAAP20Q6NZ36 FGFR3-204ENST00000412135 3951 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
FAAP20Q6NZ36 SEC23A-203ENST00000545328 2734 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
FAAP20Q6NZ36 NSFL1C-201ENST00000216879 3568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
FAAP20Q6NZ36 SLC6A9-202ENST00000360584 2330 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
FAAP20Q6NZ36 NPFFR2-201ENST00000308744 1922 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
FAAP20Q6NZ36 FAM50B-202ENST00000380274 1932 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.09
FAAP20Q6NZ36 RRAGD-202ENST00000369415 4900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
FAAP20Q6NZ36 NFATC4-222ENST00000555590 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
FAAP20Q6NZ36 NUDT16-201ENST00000502852 1552 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.09
FAAP20Q6NZ36 C18orf8-208ENST00000590868 2002 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.09
FAAP20Q6NZ36 SNAPC3-202ENST00000380821 5680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
FAAP20Q6NZ36 LINC01554-202ENST00000436592 2052 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
FAAP20Q6NZ36 DUSP8-202ENST00000397374 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
FAAP20Q6NZ36 ARHGEF28-214ENST00000545377 6351 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
FAAP20Q6NZ36 LITAF-209ENST00000571688 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
FAAP20Q6NZ36 BAZ1B-201ENST00000339594 6102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
FAAP20Q6NZ36 CICP6-201ENST00000457191 2729 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
FAAP20Q6NZ36 ARHGAP44-202ENST00000340825 4211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
FAAP20Q6NZ36 ARHGAP44-203ENST00000379672 4228 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
FAAP20Q6NZ36 PCDH8P1-201ENST00000428983 2773 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
FAAP20Q6NZ36 SLC45A1-202ENST00000471889 2784 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
FAAP20Q6NZ36 PHGDH-209ENST00000641074 1780 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
FAAP20Q6NZ36 IZUMO2-201ENST00000293405 728 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
FAAP20Q6NZ36 SMNDC1-201ENST00000369592 1110 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
FAAP20Q6NZ36 AC012146.1-202ENST00000413077 474 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
FAAP20Q6NZ36 AL359747.1-201ENST00000442370 536 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
FAAP20Q6NZ36 P2RX2-207ENST00000449132 1113 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
FAAP20Q6NZ36 PARD6A-203ENST00000602551 1171 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
FAAP20Q6NZ36 MFSD14C-203ENST00000602917 786 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
FAAP20Q6NZ36 NEK3-206ENST00000611833 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
FAAP20Q6NZ36 RAPGEFL1-212ENST00000620260 3855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
FAAP20Q6NZ36 RNPS1-205ENST00000561718 1806 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
FAAP20Q6NZ36 UBE2E3-201ENST00000392415 1347 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
FAAP20Q6NZ36 DIRC2-201ENST00000261038 3596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
FAAP20Q6NZ36 POU5F1-201ENST00000259915 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
FAAP20Q6NZ36 GAB3-203ENST00000424127 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
FAAP20Q6NZ36 BTG3-201ENST00000339775 1485 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
FAAP20Q6NZ36 SERGEF-201ENST00000265965 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
FAAP20Q6NZ36 STYXL1-208ENST00000451157 1570 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
FAAP20Q6NZ36 TBC1D2B-201ENST00000300584 6067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
FAAP20Q6NZ36 ITSN2-201ENST00000355123 6300 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
FAAP20Q6NZ36 CROCCP1-201ENST00000426910 5675 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
FAAP20Q6NZ36 CPZ-203ENST00000382480 2538 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
FAAP20Q6NZ36 NEK10-202ENST00000341435 2638 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
FAAP20Q6NZ36 MGAT2-201ENST00000305386 2687 ntAPPRIS P1 BASIC15.57■□□□□ 0.08
FAAP20Q6NZ36 LINC00595-204ENST00000434974 2692 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
FAAP20Q6NZ36 WIPF2-210ENST00000585043 2693 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
FAAP20Q6NZ36 CRTAC1-201ENST00000309155 1946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
FAAP20Q6NZ36 NTRK1-202ENST00000368196 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
FAAP20Q6NZ36 ACSS1-201ENST00000323482 3680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
FAAP20Q6NZ36 PDE1C-201ENST00000321453 2898 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
FAAP20Q6NZ36 CBWD5-204ENST00000377392 2863 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
FAAP20Q6NZ36 MLNR-201ENST00000218721 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
FAAP20Q6NZ36 ME3-201ENST00000323418 1068 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
FAAP20Q6NZ36 DUSP5P2-201ENST00000426873 1033 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
FAAP20Q6NZ36 AC008443.6-201ENST00000512508 500 ntTSL 4 BASIC15.57■□□□□ 0.08
FAAP20Q6NZ36 PLD4-205ENST00000553861 667 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
FAAP20Q6NZ36 AC133552.2-202ENST00000575694 574 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
FAAP20Q6NZ36 SLC35A2-211ENST00000634461 533 ntTSL 4 BASIC15.57■□□□□ 0.08
FAAP20Q6NZ36 TRPC4AP-202ENST00000451813 3138 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
FAAP20Q6NZ36 POLR3H-202ENST00000355209 4416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
FAAP20Q6NZ36 CYTH2-204ENST00000452733 4780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
FAAP20Q6NZ36 RECQL4-210ENST00000621189 3896 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
FAAP20Q6NZ36 C2CD4C-201ENST00000332235 3129 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
FAAP20Q6NZ36 C1QTNF1-202ENST00000339142 3100 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
FAAP20Q6NZ36 DIABLO-204ENST00000413918 1859 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
FAAP20Q6NZ36 DLGAP1-222ENST00000639615 1898 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
FAAP20Q6NZ36 ZFYVE28-208ENST00000511071 3273 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
FAAP20Q6NZ36 THUMPD2-204ENST00000505747 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
FAAP20Q6NZ36 TAF15-211ENST00000604841 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
FAAP20Q6NZ36 ZNF619-205ENST00000456778 2192 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
FAAP20Q6NZ36 FAM57B-202ENST00000380495 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
FAAP20Q6NZ36 STRADA-254ENST00000640999 2336 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.6 ms