Protein–RNA interactions for Protein: Q6DD88

ATL3, Atlastin-3, humanhuman

Predictions only

Length 541 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATL3Q6DD88 CXCL3-201ENST00000296026 1075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
ATL3Q6DD88 GRAMD4P1-201ENST00000435181 1110 ntBASIC20.87■□□□□ 0.93
ATL3Q6DD88 AL365259.1-203ENST00000451660 707 ntTSL 3 BASIC20.87■□□□□ 0.93
ATL3Q6DD88 C14orf144-201ENST00000553757 537 ntTSL 4 BASIC20.87■□□□□ 0.93
ATL3Q6DD88 TMEM45B-201ENST00000281441 2234 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
ATL3Q6DD88 CDK11A-203ENST00000357760 2446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
ATL3Q6DD88 CDK11A-204ENST00000358779 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
ATL3Q6DD88 CDK11A-206ENST00000378638 2429 ntTSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
ATL3Q6DD88 CDK11A-208ENST00000404249 2449 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
ATL3Q6DD88 PRMT2-203ENST00000355680 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
ATL3Q6DD88 OTOP2-202ENST00000580223 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
ATL3Q6DD88 SEMA3B-202ENST00000418576 1765 ntTSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
ATL3Q6DD88 OLFM1-201ENST00000252854 2591 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
ATL3Q6DD88 AATK-203ENST00000417379 5081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
ATL3Q6DD88 SNAPC3-207ENST00000610884 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
ATL3Q6DD88 HOTAIR-201ENST00000424518 2421 ntTSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
ATL3Q6DD88 PRDM5-201ENST00000264808 5330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
ATL3Q6DD88 CISD2-201ENST00000273986 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
ATL3Q6DD88 SLC43A1-201ENST00000278426 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
ATL3Q6DD88 NOMO2-201ENST00000330537 4352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
ATL3Q6DD88 NKAIN4-201ENST00000370307 793 ntTSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
ATL3Q6DD88 LINC01063-201ENST00000441644 348 ntTSL 3 BASIC20.86■□□□□ 0.93
ATL3Q6DD88 GXYLT1P6-201ENST00000456472 1187 ntBASIC20.86■□□□□ 0.93
ATL3Q6DD88 PACRGL-207ENST00000502938 810 ntTSL 4 BASIC20.86■□□□□ 0.93
ATL3Q6DD88 TMEM263-208ENST00000551489 621 ntTSL 4 BASIC20.86■□□□□ 0.93
ATL3Q6DD88 MIR4785-201ENST00000585005 73 ntBASIC20.86■□□□□ 0.93
ATL3Q6DD88 AC016737.2-201ENST00000609273 358 ntTSL 3 BASIC20.86■□□□□ 0.93
ATL3Q6DD88 GOLGA2P10-205ENST00000618267 983 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
ATL3Q6DD88 MSL1-202ENST00000398532 4707 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
ATL3Q6DD88 CCDC137-201ENST00000329214 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
ATL3Q6DD88 USP32-201ENST00000300896 5171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
ATL3Q6DD88 RAD23A-201ENST00000316856 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
ATL3Q6DD88 CMTM3-214ENST00000567572 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
ATL3Q6DD88 ZIC1-201ENST00000282928 5241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
ATL3Q6DD88 NME9-203ENST00000383180 2133 ntTSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
ATL3Q6DD88 KDELC1-201ENST00000376004 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
ATL3Q6DD88 CHAC1-202ENST00000446533 1849 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
ATL3Q6DD88 DCBLD2-201ENST00000326840 6122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
ATL3Q6DD88 BDKRB1-202ENST00000553356 1526 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
ATL3Q6DD88 PHC1-212ENST00000543824 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
ATL3Q6DD88 MPG-201ENST00000219431 1193 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC20.85■□□□□ 0.93
ATL3Q6DD88 BAALC-201ENST00000297574 801 ntTSL 3 BASIC20.85■□□□□ 0.93
ATL3Q6DD88 METTL27-201ENST00000297873 941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
ATL3Q6DD88 NME1-202ENST00000336097 986 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
ATL3Q6DD88 MIR718-201ENST00000390190 70 ntBASIC20.85■□□□□ 0.93
ATL3Q6DD88 NME1-203ENST00000393196 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
ATL3Q6DD88 ROMO1-205ENST00000397416 288 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.85■□□□□ 0.93
ATL3Q6DD88 SGO1-AS1-202ENST00000448208 819 ntTSL 3 BASIC20.85■□□□□ 0.93
ATL3Q6DD88 AC004080.6-201ENST00000467897 919 ntTSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
ATL3Q6DD88 PHF11-218ENST00000496623 1173 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
ATL3Q6DD88 TMEM185A-204ENST00000507237 903 ntTSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
ATL3Q6DD88 ERI1-203ENST00000519292 2107 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
ATL3Q6DD88 SIDT2-217ENST00000532062 2143 ntTSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
ATL3Q6DD88 CLPB-212ENST00000543042 2133 ntTSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
ATL3Q6DD88 AC089999.2-201ENST00000552525 248 ntTSL 3 BASIC20.85■□□□□ 0.93
ATL3Q6DD88 C2orf69P3-201ENST00000565542 1120 ntBASIC20.85■□□□□ 0.93
ATL3Q6DD88 USP36-216ENST00000589424 970 ntTSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
ATL3Q6DD88 NR1H2-202ENST00000411902 1466 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
ATL3Q6DD88 COLCA2-201ENST00000398035 1414 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
ATL3Q6DD88 GABRB2-206ENST00000520240 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
ATL3Q6DD88 JMJD4-207ENST00000620518 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
ATL3Q6DD88 TRPM2-202ENST00000300482 5989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
ATL3Q6DD88 AFG3L1P-203ENST00000418696 2965 ntTSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
ATL3Q6DD88 ANKRD6-204ENST00000447838 2968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
ATL3Q6DD88 ACOXL-205ENST00000439055 2373 ntTSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
ATL3Q6DD88 CDC25B-202ENST00000340833 1978 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
ATL3Q6DD88 ZCCHC23-201ENST00000500526 1951 ntTSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
ATL3Q6DD88 SIRPAP1-201ENST00000448467 1770 ntBASIC20.85■□□□□ 0.93
ATL3Q6DD88 SCHIP1-205ENST00000482804 1799 ntTSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
ATL3Q6DD88 TRAF4-201ENST00000262395 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
ATL3Q6DD88 TBXAS1-204ENST00000416849 2505 ntTSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
ATL3Q6DD88 C3orf18-201ENST00000357203 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
ATL3Q6DD88 DTX2-202ENST00000413936 2472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
ATL3Q6DD88 FMR1-206ENST00000370477 3437 ntTSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
ATL3Q6DD88 PRSS36-201ENST00000268281 2840 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
ATL3Q6DD88 MID1IP1-202ENST00000378474 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
ATL3Q6DD88 RNF166-203ENST00000541206 2419 ntTSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
ATL3Q6DD88 FBXL3-201ENST00000355619 3503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
ATL3Q6DD88 SLC12A4-201ENST00000316341 4765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
ATL3Q6DD88 TRIM33-202ENST00000369543 3457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
ATL3Q6DD88 RAB39A-201ENST00000320578 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
ATL3Q6DD88 VCY1B-201ENST00000250823 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
ATL3Q6DD88 VCY-201ENST00000250825 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
ATL3Q6DD88 TSPY14P-201ENST00000303979 915 ntBASIC20.84■□□□□ 0.93
ATL3Q6DD88 COX5A-201ENST00000322347 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
ATL3Q6DD88 IMMP2L-201ENST00000331762 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
ATL3Q6DD88 TMSB4X-201ENST00000380633 495 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.84■□□□□ 0.93
ATL3Q6DD88 AC131097.3-201ENST00000413820 1228 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
ATL3Q6DD88 CHCHD10-202ENST00000484558 1171 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
ATL3Q6DD88 SLC39A13-212ENST00000531974 856 ntTSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
ATL3Q6DD88 CDC42EP2-202ENST00000533419 1279 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.84■□□□□ 0.93
ATL3Q6DD88 ANKRD36-207ENST00000639293 1168 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
ATL3Q6DD88 SNAP23-201ENST00000249647 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
ATL3Q6DD88 ASB13-201ENST00000357700 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
ATL3Q6DD88 GOLGA6L2-204ENST00000567107 3030 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
ATL3Q6DD88 TAF15-211ENST00000604841 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
ATL3Q6DD88 B4GALT2-202ENST00000356836 2629 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
ATL3Q6DD88 CNST-202ENST00000366512 2422 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
ATL3Q6DD88 WNT9B-201ENST00000290015 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
ATL3Q6DD88 ARL5A-201ENST00000295087 5326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.1 ms