Protein–RNA interactions for Protein: Q68CJ9

CREB3L3, Cyclic AMP-responsive element-binding protein 3-like protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 461 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CREB3L3Q68CJ9 ST3GAL3-205ENST00000347631 1324 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
CREB3L3Q68CJ9 ZNF446-207ENST00000610298 1869 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
CREB3L3Q68CJ9 PANX1-201ENST00000227638 2769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
CREB3L3Q68CJ9 B3GNT2-201ENST00000301998 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
CREB3L3Q68CJ9 FERMT2-204ENST00000399304 2082 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
CREB3L3Q68CJ9 KCNN2-208ENST00000631899 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
CREB3L3Q68CJ9 PCSK7-201ENST00000320934 4649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
CREB3L3Q68CJ9 RPN2-201ENST00000237530 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
CREB3L3Q68CJ9 FST-201ENST00000256759 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
CREB3L3Q68CJ9 ACD-203ENST00000602320 1408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
CREB3L3Q68CJ9 POU3F2-201ENST00000328345 4879 ntAPPRIS P1 BASIC21.74■■□□□ 1.07
CREB3L3Q68CJ9 UBE2QL1-201ENST00000399816 4317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
CREB3L3Q68CJ9 FAM117B-201ENST00000392238 5763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
CREB3L3Q68CJ9 PVRIG2P-201ENST00000435460 978 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
CREB3L3Q68CJ9 FIS1-207ENST00000474120 915 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
CREB3L3Q68CJ9 USF2-205ENST00000594064 1179 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
CREB3L3Q68CJ9 C16orf74-206ENST00000602766 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.74■■□□□ 1.07
CREB3L3Q68CJ9 AC140113.3-201ENST00000605663 199 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
CREB3L3Q68CJ9 AC139887.4-201ENST00000607877 719 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
CREB3L3Q68CJ9 AC011558.1-201ENST00000623459 338 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
CREB3L3Q68CJ9 STXBP2-202ENST00000414284 1859 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
CREB3L3Q68CJ9 PGR-201ENST00000263463 2496 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
CREB3L3Q68CJ9 LHFPL6-201ENST00000379589 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
CREB3L3Q68CJ9 PLD3-207ENST00000409735 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
CREB3L3Q68CJ9 FIBIN-201ENST00000318627 1938 ntAPPRIS P1 BASIC21.74■■□□□ 1.07
CREB3L3Q68CJ9 MFSD2A-203ENST00000420632 1914 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
CREB3L3Q68CJ9 PTPRJ-202ENST00000440289 3158 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
CREB3L3Q68CJ9 HGFAC-201ENST00000382774 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
CREB3L3Q68CJ9 C1QTNF1-201ENST00000311661 2624 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
CREB3L3Q68CJ9 C18orf21-205ENST00000592875 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
CREB3L3Q68CJ9 UBE2E1-202ENST00000346855 1398 ntTSL 3 BASIC21.74■■□□□ 1.07
CREB3L3Q68CJ9 FAM50A-202ENST00000393600 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
CREB3L3Q68CJ9 NDRG2-208ENST00000397851 2022 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
CREB3L3Q68CJ9 COPS7A-210ENST00000539735 1832 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
CREB3L3Q68CJ9 IRF3-203ENST00000377139 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
CREB3L3Q68CJ9 CHTF8-203ENST00000448552 2903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
CREB3L3Q68CJ9 DOC2A-209ENST00000564979 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
CREB3L3Q68CJ9 AP000997.3-201ENST00000623333 2250 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
CREB3L3Q68CJ9 ENTPD2-202ENST00000355097 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
CREB3L3Q68CJ9 GATA2-203ENST00000487848 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
CREB3L3Q68CJ9 MCCC1-215ENST00000629669 2316 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
CREB3L3Q68CJ9 KRT13-201ENST00000246635 1699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
CREB3L3Q68CJ9 SMARCD3-202ENST00000356800 1669 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
CREB3L3Q68CJ9 PDLIM3-201ENST00000284767 2589 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
CREB3L3Q68CJ9 SLC2A8-202ENST00000373360 1937 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
CREB3L3Q68CJ9 ALDH3A1-206ENST00000457500 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
CREB3L3Q68CJ9 SP7-203ENST00000537210 1472 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
CREB3L3Q68CJ9 METTL5-201ENST00000260953 1010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
CREB3L3Q68CJ9 FAM19A3-201ENST00000361886 1056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
CREB3L3Q68CJ9 KRT18P57-201ENST00000443599 1254 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
CREB3L3Q68CJ9 HOXD8-203ENST00000450510 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
CREB3L3Q68CJ9 AL136307.1-201ENST00000454882 411 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
CREB3L3Q68CJ9 AC021739.3-201ENST00000557908 855 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
CREB3L3Q68CJ9 TK2-213ENST00000563369 882 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
CREB3L3Q68CJ9 SMN1-211ENST00000625245 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
CREB3L3Q68CJ9 SMN2-215ENST00000628696 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
CREB3L3Q68CJ9 TTLL12-201ENST00000216129 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
CREB3L3Q68CJ9 NUMBL-207ENST00000598779 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
CREB3L3Q68CJ9 FLJ13224-201ENST00000313737 1514 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
CREB3L3Q68CJ9 SLC12A9-215ENST00000540482 2269 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
CREB3L3Q68CJ9 CCDC157-201ENST00000338306 3001 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
CREB3L3Q68CJ9 OTOP2-202ENST00000580223 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
CREB3L3Q68CJ9 AC120049.1-201ENST00000592638 2065 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
CREB3L3Q68CJ9 WDTC1-201ENST00000319394 4819 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
CREB3L3Q68CJ9 EVI5L-201ENST00000270530 3855 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
CREB3L3Q68CJ9 CCDC88C-203ENST00000389856 1641 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
CREB3L3Q68CJ9 TEFM-205ENST00000581216 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
CREB3L3Q68CJ9 NRBP1-204ENST00000379863 2174 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
CREB3L3Q68CJ9 NSUN5-201ENST00000252594 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
CREB3L3Q68CJ9 CDK5R1-201ENST00000313401 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
CREB3L3Q68CJ9 UBQLN4-201ENST00000368309 3576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
CREB3L3Q68CJ9 PAK4-209ENST00000599470 1715 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
CREB3L3Q68CJ9 STK4-201ENST00000372801 2038 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
CREB3L3Q68CJ9 GABRB2-206ENST00000520240 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
CREB3L3Q68CJ9 NPBWR1-201ENST00000331251 2687 ntAPPRIS P1 BASIC21.72■■□□□ 1.07
CREB3L3Q68CJ9 IGSF9-206ENST00000611023 2663 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
CREB3L3Q68CJ9 ANKRD20A18P-201ENST00000359341 492 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
CREB3L3Q68CJ9 HOXD12-201ENST00000404162 841 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
CREB3L3Q68CJ9 AC117947.1-201ENST00000427448 529 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
CREB3L3Q68CJ9 BX664615.1-201ENST00000443558 458 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
CREB3L3Q68CJ9 AC019068.1-202ENST00000483218 768 ntTSL 3 BASIC21.72■■□□□ 1.07
CREB3L3Q68CJ9 CNTD2-203ENST00000513948 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
CREB3L3Q68CJ9 AZIN1-AS1-215ENST00000522939 644 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
CREB3L3Q68CJ9 LY6E-214ENST00000522971 857 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
CREB3L3Q68CJ9 TMEM9B-AS1-201ENST00000525484 1053 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
CREB3L3Q68CJ9 FAM181A-203ENST00000556222 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
CREB3L3Q68CJ9 SLC9A3R2-208ENST00000566198 1199 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
CREB3L3Q68CJ9 SLX1B-SULT1A4-201ENST00000344620 2424 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
CREB3L3Q68CJ9 UPF1-201ENST00000262803 5348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
CREB3L3Q68CJ9 PCBP3-205ENST00000400310 2168 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
CREB3L3Q68CJ9 CADPS-201ENST00000283269 4591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
CREB3L3Q68CJ9 NOX4-201ENST00000263317 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
CREB3L3Q68CJ9 PLK3-201ENST00000372201 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
CREB3L3Q68CJ9 PSTPIP1-201ENST00000379595 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
CREB3L3Q68CJ9 LGI4-201ENST00000310123 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
CREB3L3Q68CJ9 ZNF131-206ENST00000505606 3209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
CREB3L3Q68CJ9 TFCP2-204ENST00000548115 1862 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
CREB3L3Q68CJ9 CYP4F8-210ENST00000612078 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
CREB3L3Q68CJ9 SRP9-203ENST00000366839 1596 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
CREB3L3Q68CJ9 GUCA1A-202ENST00000372958 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.5 ms