Protein–RNA interactions for Protein: Q5JVF3

PCID2, PCI domain-containing protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 399 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCID2Q5JVF3 ZFYVE1-202ENST00000394207 1183 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
PCID2Q5JVF3 DHRS4L2-202ENST00000397071 1117 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
PCID2Q5JVF3 RNF144A-AS1-205ENST00000439208 757 ntTSL 3 BASIC18.4■□□□□ 0.54
PCID2Q5JVF3 C7orf49-209ENST00000483029 596 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
PCID2Q5JVF3 AC024243.1-201ENST00000609234 778 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
PCID2Q5JVF3 DNAJB6-218ENST00000634080 1005 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
PCID2Q5JVF3 KRT18P22-201ENST00000402024 1347 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
PCID2Q5JVF3 TMSB4Y-201ENST00000284856 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
PCID2Q5JVF3 NFKB2-201ENST00000189444 3011 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
PCID2Q5JVF3 RGN-204ENST00000457380 2041 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
PCID2Q5JVF3 TAX1BP3-201ENST00000225525 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
PCID2Q5JVF3 ACVRL1-202ENST00000419526 1356 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
PCID2Q5JVF3 PLCL2-204ENST00000615277 4147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
PCID2Q5JVF3 THOP1-201ENST00000307741 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
PCID2Q5JVF3 LMNA-207ENST00000368301 2461 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
PCID2Q5JVF3 VIM-201ENST00000224237 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
PCID2Q5JVF3 MCCC1-215ENST00000629669 2316 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
PCID2Q5JVF3 PAQR4-202ENST00000318782 2793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
PCID2Q5JVF3 ICA1-208ENST00000407906 1615 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
PCID2Q5JVF3 CASKIN2-205ENST00000581870 1612 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
PCID2Q5JVF3 TMEM88B-201ENST00000378821 492 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
PCID2Q5JVF3 ROMO1-205ENST00000397416 288 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.39■□□□□ 0.53
PCID2Q5JVF3 MFGE8-203ENST00000542878 1172 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
PCID2Q5JVF3 AC006942.1-201ENST00000600669 520 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
PCID2Q5JVF3 NLE1-201ENST00000360831 1726 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
PCID2Q5JVF3 NRBP1-204ENST00000379863 2174 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
PCID2Q5JVF3 PLA2G15-202ENST00000413021 1346 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
PCID2Q5JVF3 NEK2-205ENST00000540251 1318 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
PCID2Q5JVF3 LYSMD4-201ENST00000332728 2847 ntTSL 4 BASIC18.39■□□□□ 0.53
PCID2Q5JVF3 CCNJL-203ENST00000393977 3320 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
PCID2Q5JVF3 NPFFR2-201ENST00000308744 1922 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
PCID2Q5JVF3 AR-207ENST00000612010 3896 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
PCID2Q5JVF3 NDUFA10-214ENST00000620965 1489 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
PCID2Q5JVF3 SLC22A23-203ENST00000406686 5658 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
PCID2Q5JVF3 SLC35G2-202ENST00000446465 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
PCID2Q5JVF3 GLCCI1-201ENST00000223145 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
PCID2Q5JVF3 ARHGAP8-202ENST00000356099 1584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
PCID2Q5JVF3 WIPI1-202ENST00000546360 1575 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
PCID2Q5JVF3 APP-203ENST00000354192 3167 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
PCID2Q5JVF3 EEPD1-201ENST00000242108 4765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
PCID2Q5JVF3 SPAG9-202ENST00000357122 4761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
PCID2Q5JVF3 GABRB1-201ENST00000295454 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
PCID2Q5JVF3 HPS3-202ENST00000460120 2745 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
PCID2Q5JVF3 B3GNT2-201ENST00000301998 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
PCID2Q5JVF3 RAP1GDS1-201ENST00000264572 1686 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
PCID2Q5JVF3 C21orf59-201ENST00000290155 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
PCID2Q5JVF3 TNFAIP1-202ENST00000544907 1656 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
PCID2Q5JVF3 OLFM2-203ENST00000590841 1665 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
PCID2Q5JVF3 ZNF12-204ENST00000405858 5051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
PCID2Q5JVF3 RAI2-201ENST00000331511 2317 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
PCID2Q5JVF3 LPAR2-201ENST00000407877 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
PCID2Q5JVF3 AEBP2-201ENST00000266508 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
PCID2Q5JVF3 GATA2-203ENST00000487848 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
PCID2Q5JVF3 AL024508.2-201ENST00000607749 1894 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
PCID2Q5JVF3 TMEM234-201ENST00000309777 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
PCID2Q5JVF3 Telomerase-vert.1-201ENST00000363312 438 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
PCID2Q5JVF3 SNAPIN-201ENST00000368685 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
PCID2Q5JVF3 HMGB3P22-201ENST00000442010 597 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
PCID2Q5JVF3 AL162457.2-201ENST00000447909 937 ntTSL 3 BASIC18.38■□□□□ 0.53
PCID2Q5JVF3 SLC9A3R2-208ENST00000566198 1199 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
PCID2Q5JVF3 BCL2L12-208ENST00000600947 633 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
PCID2Q5JVF3 AC009542.2-201ENST00000637483 1189 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
PCID2Q5JVF3 EHMT1-203ENST00000460843 5137 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
PCID2Q5JVF3 SNAI3-AS1-202ENST00000563475 2081 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
PCID2Q5JVF3 CHTF8-203ENST00000448552 2903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
PCID2Q5JVF3 PRR36-202ENST00000618550 4456 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
PCID2Q5JVF3 ST6GALNAC6-201ENST00000291839 2280 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
PCID2Q5JVF3 GPR135-201ENST00000395116 4578 ntAPPRIS P1 BASIC18.38■□□□□ 0.53
PCID2Q5JVF3 SDC2-202ENST00000518385 1583 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
PCID2Q5JVF3 TMEM59L-201ENST00000262817 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
PCID2Q5JVF3 IRF3-203ENST00000377139 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
PCID2Q5JVF3 PLK3-201ENST00000372201 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
PCID2Q5JVF3 CARD10-202ENST00000403299 4113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
PCID2Q5JVF3 SNAPC3-207ENST00000610884 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
PCID2Q5JVF3 NSUN5-201ENST00000252594 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
PCID2Q5JVF3 PSRC1-205ENST00000409138 1826 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
PCID2Q5JVF3 CYP4F8-210ENST00000612078 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
PCID2Q5JVF3 ACYP2-203ENST00000406041 1913 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
PCID2Q5JVF3 RGMB-AS1-201ENST00000498871 1903 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
PCID2Q5JVF3 MEN1-203ENST00000337652 3162 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
PCID2Q5JVF3 PTPRJ-202ENST00000440289 3158 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
PCID2Q5JVF3 USP18-201ENST00000215794 2129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
PCID2Q5JVF3 NKD2-202ENST00000296849 2155 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
PCID2Q5JVF3 SCOC-208ENST00000510586 2193 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
PCID2Q5JVF3 ELP5-214ENST00000574993 2209 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
PCID2Q5JVF3 NOX4-201ENST00000263317 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
PCID2Q5JVF3 P2RY6-208ENST00000540124 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
PCID2Q5JVF3 SLX1B-SULT1A4-201ENST00000344620 2424 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
PCID2Q5JVF3 INSIG1-202ENST00000342407 1127 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
PCID2Q5JVF3 AC007563.2-201ENST00000447289 552 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
PCID2Q5JVF3 EHMT1-211ENST00000482340 691 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
PCID2Q5JVF3 CHCHD6-204ENST00000508789 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
PCID2Q5JVF3 TMA16-209ENST00000513272 803 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
PCID2Q5JVF3 CMTM3-210ENST00000565666 769 ntTSL 3 BASIC18.37■□□□□ 0.53
PCID2Q5JVF3 SYNGR4-204ENST00000601610 859 ntTSL 3 BASIC18.37■□□□□ 0.53
PCID2Q5JVF3 PITPNB-211ENST00000634017 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
PCID2Q5JVF3 RNF187-203ENST00000639044 708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
PCID2Q5JVF3 STK11-201ENST00000326873 2611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
PCID2Q5JVF3 LRRC32-202ENST00000404995 2656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
PCID2Q5JVF3 FO681492.1-203ENST00000622861 1362 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 62.2 ms