Protein–RNA interactions for Protein: Q2WEN9

CEACAM16, Carcinoembryonic antigen-related cell adhesion molecule 16, humanhuman

Predictions only

Length 425 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CEACAM16Q2WEN9 MAFF-206ENST00000538320 2458 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CEACAM16Q2WEN9 ZCWPW1-201ENST00000360951 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CEACAM16Q2WEN9 LRCH1-201ENST00000311191 4710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CEACAM16Q2WEN9 ACAP3-202ENST00000354700 3896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CEACAM16Q2WEN9 SLC39A7-201ENST00000374675 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CEACAM16Q2WEN9 ASCL5-202ENST00000458416 1420 ntAPPRIS P1 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CEACAM16Q2WEN9 MYBPH-201ENST00000255416 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CEACAM16Q2WEN9 KCNN4-209ENST00000615047 2029 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CEACAM16Q2WEN9 MTMR12-201ENST00000264934 2215 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CEACAM16Q2WEN9 ZNF446-203ENST00000594369 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CEACAM16Q2WEN9 PSPC1-201ENST00000338910 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CEACAM16Q2WEN9 SENP2-201ENST00000296257 5717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CEACAM16Q2WEN9 INTS10-201ENST00000397977 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CEACAM16Q2WEN9 COPE-201ENST00000262812 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CEACAM16Q2WEN9 NUDT8-201ENST00000301490 809 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CEACAM16Q2WEN9 COPE-203ENST00000351079 907 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CEACAM16Q2WEN9 TSPY8-203ENST00000383005 435 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CEACAM16Q2WEN9 AL035541.1-201ENST00000424850 823 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CEACAM16Q2WEN9 AC092597.1-201ENST00000487352 616 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
CEACAM16Q2WEN9 HELT-202ENST00000505610 846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CEACAM16Q2WEN9 AC092902.2-222ENST00000626312 568 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CEACAM16Q2WEN9 SMIM29-209ENST00000636500 1186 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CEACAM16Q2WEN9 DAPK2-205ENST00000558069 1473 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CEACAM16Q2WEN9 THAP3-203ENST00000377627 2053 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CEACAM16Q2WEN9 RAP1GAP-204ENST00000374761 3318 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CEACAM16Q2WEN9 SERPINE2-206ENST00000447280 1716 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CEACAM16Q2WEN9 CYB561-205ENST00000542042 1302 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CEACAM16Q2WEN9 AL391807.1-203ENST00000604392 2365 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
CEACAM16Q2WEN9 LTBP1-203ENST00000404816 6333 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CEACAM16Q2WEN9 EFTUD1P1-204ENST00000560401 1798 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
CEACAM16Q2WEN9 TMEM214-203ENST00000404032 2830 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CEACAM16Q2WEN9 PIP4K2C-202ENST00000422156 1558 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CEACAM16Q2WEN9 C1QTNF1-209ENST00000581774 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CEACAM16Q2WEN9 SLC12A4-201ENST00000316341 4765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CEACAM16Q2WEN9 HNRNPM-201ENST00000325495 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CEACAM16Q2WEN9 LRCH2-202ENST00000538422 4868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CEACAM16Q2WEN9 ARHGAP26-201ENST00000274498 6862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CEACAM16Q2WEN9 SLC5A10-203ENST00000395645 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CEACAM16Q2WEN9 KCNN2-208ENST00000631899 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CEACAM16Q2WEN9 HS3ST3A1-201ENST00000284110 2527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CEACAM16Q2WEN9 LARGE2-208ENST00000531526 2528 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CEACAM16Q2WEN9 TMPRSS12-201ENST00000398458 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CEACAM16Q2WEN9 RAX2-201ENST00000555633 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CEACAM16Q2WEN9 GGT1-205ENST00000403838 1033 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CEACAM16Q2WEN9 ELOVL2-AS1-202ENST00000456616 903 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CEACAM16Q2WEN9 MOK-234ENST00000524370 1165 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CEACAM16Q2WEN9 TMEM9B-AS1-201ENST00000525484 1053 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CEACAM16Q2WEN9 ELAVL1-202ENST00000593807 856 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CEACAM16Q2WEN9 FGF14-AS2-201ENST00000606448 1074 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
CEACAM16Q2WEN9 PIF1-205ENST00000559239 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CEACAM16Q2WEN9 SPRED3-201ENST00000338502 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CEACAM16Q2WEN9 MATN4-203ENST00000372754 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CEACAM16Q2WEN9 SEMA3B-210ENST00000611067 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CEACAM16Q2WEN9 WWP1-202ENST00000517970 4686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CEACAM16Q2WEN9 PRR36-202ENST00000618550 4456 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CEACAM16Q2WEN9 SDF4-201ENST00000263741 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CEACAM16Q2WEN9 GABBR1-204ENST00000377016 4299 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CEACAM16Q2WEN9 LRP3-201ENST00000253193 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CEACAM16Q2WEN9 CBX2-202ENST00000310942 4644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CEACAM16Q2WEN9 LZTS2-202ENST00000370223 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CEACAM16Q2WEN9 FAM50A-202ENST00000393600 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CEACAM16Q2WEN9 KCNH1-214ENST00000640566 1365 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CEACAM16Q2WEN9 TSHZ3-201ENST00000240587 5176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CEACAM16Q2WEN9 ENOPH1-202ENST00000505846 1689 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CEACAM16Q2WEN9 SEPT9-236ENST00000591088 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CEACAM16Q2WEN9 CD19-202ENST00000538922 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CEACAM16Q2WEN9 CD1E-205ENST00000368160 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CEACAM16Q2WEN9 MED25-212ENST00000618715 1467 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CEACAM16Q2WEN9 PRODH-205ENST00000420436 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CEACAM16Q2WEN9 KCNA3-201ENST00000369769 2569 ntAPPRIS P1 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CEACAM16Q2WEN9 POLR2C-201ENST00000219252 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CEACAM16Q2WEN9 CCDC43-201ENST00000315286 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CEACAM16Q2WEN9 DPYSL4-202ENST00000368627 1545 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CEACAM16Q2WEN9 PRSS23-201ENST00000280258 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CEACAM16Q2WEN9 MADD-208ENST00000405573 1823 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CEACAM16Q2WEN9 PCSK5-201ENST00000376752 5756 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CEACAM16Q2WEN9 PEX11G-201ENST00000221480 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CEACAM16Q2WEN9 AC004540.1-203ENST00000421862 907 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CEACAM16Q2WEN9 DGUOK-AS1-203ENST00000453103 601 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CEACAM16Q2WEN9 MYD88-211ENST00000495303 976 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CEACAM16Q2WEN9 GSTZ1-218ENST00000557053 580 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CEACAM16Q2WEN9 NME3-204ENST00000563498 920 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CEACAM16Q2WEN9 SLC9A3R2-208ENST00000566198 1199 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CEACAM16Q2WEN9 AC243829.1-201ENST00000615128 1059 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CEACAM16Q2WEN9 AL024508.2-201ENST00000607749 1894 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
CEACAM16Q2WEN9 CCDC17-209ENST00000528266 2181 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CEACAM16Q2WEN9 CPAMD8-203ENST00000443236 5992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CEACAM16Q2WEN9 SRRM2-AS1-203ENST00000571305 1344 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CEACAM16Q2WEN9 NTMT1-211ENST00000617943 1346 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CEACAM16Q2WEN9 CENPT-215ENST00000564817 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CEACAM16Q2WEN9 TMEM198-202ENST00000373883 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CEACAM16Q2WEN9 TOR2A-205ENST00000463577 2211 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CEACAM16Q2WEN9 KMT5B-206ENST00000405515 2869 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CEACAM16Q2WEN9 UBE2E1-202ENST00000346855 1398 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CEACAM16Q2WEN9 ZNF655-203ENST00000357864 1370 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CEACAM16Q2WEN9 AC087500.1-202ENST00000571689 1715 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CEACAM16Q2WEN9 C6orf203-202ENST00000405204 1420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CEACAM16Q2WEN9 LINC01311-201ENST00000565162 1445 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
CEACAM16Q2WEN9 AC063977.6-201ENST00000600074 1763 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CEACAM16Q2WEN9 AC135776.1-201ENST00000319817 2481 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.5 ms