Protein–RNA interactions for Protein: Q16798

ME3, NADP-dependent malic enzyme, mitochondrial, humanhuman

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Length 604 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ME3Q16798 DLGAP1-222ENST00000639615 1898 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
ME3Q16798 KLHL29-203ENST00000486442 5287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
ME3Q16798 MAP3K6-207ENST00000493901 4309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
ME3Q16798 FOXD2-201ENST00000334793 4675 ntAPPRIS P1 BASIC21.43■■□□□ 1.02
ME3Q16798 DGCR6L-201ENST00000248879 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
ME3Q16798 NME1-202ENST00000336097 986 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
ME3Q16798 Telomerase-vert.1-201ENST00000363312 438 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
ME3Q16798 NME1-203ENST00000393196 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
ME3Q16798 GRAMD4P1-201ENST00000435181 1110 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
ME3Q16798 FAHD2CP-202ENST00000443258 893 ntTSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
ME3Q16798 AC007563.2-201ENST00000447289 552 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
ME3Q16798 AC002467.1-201ENST00000457510 657 ntTSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
ME3Q16798 KRT8P12-201ENST00000468527 998 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
ME3Q16798 RARRES1-204ENST00000479756 839 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
ME3Q16798 AC100793.2-201ENST00000593139 542 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
ME3Q16798 CCDC28A-203ENST00000617445 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
ME3Q16798 AC066615.1-201ENST00000640911 628 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
ME3Q16798 IRF3-203ENST00000377139 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
ME3Q16798 PTPN12-201ENST00000248594 3406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
ME3Q16798 MOCS2-202ENST00000396954 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
ME3Q16798 SIGLEC6-203ENST00000359982 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
ME3Q16798 ATP6AP2-214ENST00000636287 1904 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
ME3Q16798 TREX2-201ENST00000330912 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
ME3Q16798 DVL2-209ENST00000575458 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
ME3Q16798 FCGRT-201ENST00000221466 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
ME3Q16798 SMARCD3-202ENST00000356800 1669 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
ME3Q16798 ZNF74-201ENST00000357502 2788 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
ME3Q16798 ADK-202ENST00000372734 2083 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
ME3Q16798 AL161452.1-201ENST00000415062 1117 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
ME3Q16798 HMGB3P22-201ENST00000442010 597 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
ME3Q16798 AL162457.2-201ENST00000447909 937 ntTSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
ME3Q16798 LINC01184-202ENST00000501173 949 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
ME3Q16798 GNE-204ENST00000539208 2190 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
ME3Q16798 NEK2-205ENST00000540251 1318 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
ME3Q16798 C22orf39-205ENST00000542103 1523 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
ME3Q16798 SLC25A11-202ENST00000544061 952 ntTSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
ME3Q16798 NUDT16L1-203ENST00000586252 922 ntTSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
ME3Q16798 SPC24-206ENST00000592540 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
ME3Q16798 THOC3-212ENST00000628318 1442 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
ME3Q16798 MARK2-207ENST00000502399 2885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
ME3Q16798 NAA60-201ENST00000360862 2522 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
ME3Q16798 CCDC137-201ENST00000329214 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
ME3Q16798 ZNF394-201ENST00000337673 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
ME3Q16798 LINC00896-202ENST00000609602 2128 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
ME3Q16798 NRSN2-202ENST00000382291 2088 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
ME3Q16798 PDE9A-213ENST00000398236 1776 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
ME3Q16798 RAD23A-201ENST00000316856 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
ME3Q16798 THAP12-201ENST00000260045 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
ME3Q16798 CCDC88C-203ENST00000389856 1641 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
ME3Q16798 STN1-201ENST00000224950 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
ME3Q16798 WNT5B-203ENST00000537031 1437 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
ME3Q16798 FAM212A-201ENST00000333323 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
ME3Q16798 PLEKHB2-203ENST00000404460 1167 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
ME3Q16798 HMGA1P5-201ENST00000412453 271 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
ME3Q16798 EHMT1-211ENST00000482340 691 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
ME3Q16798 MFGE8-203ENST00000542878 1172 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
ME3Q16798 NUMBL-207ENST00000598779 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
ME3Q16798 ZNF419-204ENST00000415379 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
ME3Q16798 NFATC1-206ENST00000542384 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
ME3Q16798 RABEP2-202ENST00000358201 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
ME3Q16798 MPP2-206ENST00000518766 1896 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
ME3Q16798 CDHR1-201ENST00000332904 2694 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
ME3Q16798 KRAS-203ENST00000556131 1696 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
ME3Q16798 PRMT5-204ENST00000397441 2418 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
ME3Q16798 DLK2-203ENST00000372488 1590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
ME3Q16798 CISD2-201ENST00000273986 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
ME3Q16798 PLA2G15-202ENST00000413021 1346 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
ME3Q16798 SLC43A1-201ENST00000278426 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
ME3Q16798 PABPC1L-217ENST00000537323 1910 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
ME3Q16798 UPK3B-201ENST00000257632 1296 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
ME3Q16798 MPC2-201ENST00000271373 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
ME3Q16798 UNC5B-AS1-201ENST00000447119 647 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
ME3Q16798 BCL2L12-208ENST00000600947 633 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
ME3Q16798 FIBCD1-201ENST00000372337 1868 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
ME3Q16798 NRXN1-220ENST00000611589 1857 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
ME3Q16798 RNPS1-205ENST00000561718 1806 ntTSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
ME3Q16798 MCM9-201ENST00000316068 2442 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
ME3Q16798 MFGE8-202ENST00000268151 1752 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
ME3Q16798 CLDND1-204ENST00000394185 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
ME3Q16798 ZDHHC4-205ENST00000396713 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
ME3Q16798 LINC00634-201ENST00000381348 1510 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
ME3Q16798 NARFL-218ENST00000568545 2486 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.02
ME3Q16798 SREBF2-209ENST00000612482 5365 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.02
ME3Q16798 GNAS-203ENST00000306120 1878 ntBASIC21.39■■□□□ 1.02
ME3Q16798 LINC01568-207ENST00000641790 1380 ntBASIC21.39■■□□□ 1.02
ME3Q16798 MYBPH-201ENST00000255416 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
ME3Q16798 AC012317.2-201ENST00000623305 2251 ntBASIC21.39■■□□□ 1.02
ME3Q16798 MARVELD3-202ENST00000299952 2214 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
ME3Q16798 HHATL-201ENST00000310417 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
ME3Q16798 PHKA1-204ENST00000373545 6173 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
ME3Q16798 ASPRV1-201ENST00000320256 2177 ntAPPRIS P1 BASIC21.39■■□□□ 1.01
ME3Q16798 FXYD6-204ENST00000526014 2171 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
ME3Q16798 ZNF584-202ENST00000322834 1042 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
ME3Q16798 LRRC23-202ENST00000323702 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
ME3Q16798 INSIG1-202ENST00000342407 1127 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
ME3Q16798 ZFYVE1-202ENST00000394207 1183 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
ME3Q16798 ROMO1-205ENST00000397416 288 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
ME3Q16798 AL390719.1-201ENST00000427998 977 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
ME3Q16798 PRTN3-202ENST00000544537 1036 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
ME3Q16798 YPEL3-207ENST00000566134 761 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
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