Protein–RNA interactions for Protein: Q16695

HIST3H3, Histone H3.1t, humanhuman

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Length 136 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HIST3H3Q16695 AC131097.3-201ENST00000413820 1228 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
HIST3H3Q16695 SLC25A6P5-201ENST00000435663 894 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
HIST3H3Q16695 AC009185.1-201ENST00000517634 911 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
HIST3H3Q16695 CRNDE-210ENST00000560912 459 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
HIST3H3Q16695 AC008687.5-201ENST00000593746 558 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
HIST3H3Q16695 AC139887.4-201ENST00000607877 719 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
HIST3H3Q16695 SMN1-211ENST00000625245 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
HIST3H3Q16695 SMN2-215ENST00000628696 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
HIST3H3Q16695 MCOLN1-201ENST00000264079 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
HIST3H3Q16695 ZNF385A-202ENST00000352268 2076 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
HIST3H3Q16695 SMPD3-211ENST00000568373 2073 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
HIST3H3Q16695 FBXO41-204ENST00000520530 3293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
HIST3H3Q16695 TYMS-201ENST00000323224 1327 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
HIST3H3Q16695 IMPAD1-201ENST00000262644 7199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
HIST3H3Q16695 KCTD12-201ENST00000377474 6225 ntAPPRIS P1 BASIC16.13■□□□□ 0.17
HIST3H3Q16695 RGN-204ENST00000457380 2041 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
HIST3H3Q16695 FNBP1-203ENST00000443566 5227 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
HIST3H3Q16695 GPS1-201ENST00000306823 1842 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
HIST3H3Q16695 UNC5CL-202ENST00000373164 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
HIST3H3Q16695 HOXC6-202ENST00000394331 2943 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
HIST3H3Q16695 JMJD6-202ENST00000397625 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
HIST3H3Q16695 DNAJA3-203ENST00000431375 2294 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
HIST3H3Q16695 MYO19-225ENST00000621344 1640 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
HIST3H3Q16695 CD276-201ENST00000318424 2738 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
HIST3H3Q16695 PPP2R2B-203ENST00000394411 2071 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
HIST3H3Q16695 BMP2K-208ENST00000628286 3848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
HIST3H3Q16695 MID1IP1-202ENST00000378474 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
HIST3H3Q16695 ELOC-209ENST00000602840 2780 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
HIST3H3Q16695 KRT13-201ENST00000246635 1699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
HIST3H3Q16695 TMSB4Y-201ENST00000284856 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
HIST3H3Q16695 ARPC4-201ENST00000397261 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
HIST3H3Q16695 SP100-208ENST00000427101 1922 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
HIST3H3Q16695 SPACA1-201ENST00000237201 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
HIST3H3Q16695 AAED1-201ENST00000375234 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
HIST3H3Q16695 MRPL52-201ENST00000311892 1042 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
HIST3H3Q16695 LCE4A-202ENST00000368777 672 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
HIST3H3Q16695 PRICKLE4-202ENST00000394260 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
HIST3H3Q16695 PRICKLE4-203ENST00000394263 1155 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
HIST3H3Q16695 YPEL3-201ENST00000398838 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
HIST3H3Q16695 HOXD12-201ENST00000404162 841 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
HIST3H3Q16695 AC117947.1-201ENST00000427448 529 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
HIST3H3Q16695 ST6GALNAC4P1-201ENST00000435385 499 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
HIST3H3Q16695 AC134772.1-201ENST00000438872 885 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
HIST3H3Q16695 RARRES2-205ENST00000482669 563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
HIST3H3Q16695 GSTZ1-218ENST00000557053 580 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
HIST3H3Q16695 C17orf62-221ENST00000581196 668 ntTSL 4 BASIC16.12■□□□□ 0.17
HIST3H3Q16695 AC004076.1-201ENST00000596831 664 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
HIST3H3Q16695 C16orf74-207ENST00000602914 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
HIST3H3Q16695 PHYKPL-201ENST00000308158 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
HIST3H3Q16695 ANKRD40-201ENST00000285243 4184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
HIST3H3Q16695 SRP9-203ENST00000366839 1596 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
HIST3H3Q16695 GUCA1A-202ENST00000372958 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
HIST3H3Q16695 FERMT2-204ENST00000399304 2082 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
HIST3H3Q16695 ZNF205-206ENST00000620094 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
HIST3H3Q16695 SLC44A3-201ENST00000271227 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
HIST3H3Q16695 SLC25A48-201ENST00000274513 1880 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
HIST3H3Q16695 LHX8-201ENST00000294638 2373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
HIST3H3Q16695 GCH1-207ENST00000622544 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
HIST3H3Q16695 ATRIP-203ENST00000357105 2403 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
HIST3H3Q16695 ADCK5-201ENST00000308860 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
HIST3H3Q16695 SMARCD3-202ENST00000356800 1669 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
HIST3H3Q16695 RNPS1-219ENST00000566397 1685 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
HIST3H3Q16695 EPHX4-201ENST00000370383 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
HIST3H3Q16695 FAM222A-202ENST00000538780 3294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
HIST3H3Q16695 REEP4-201ENST00000306306 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
HIST3H3Q16695 TRPV4-208ENST00000544971 2295 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
HIST3H3Q16695 SLC23A3-203ENST00000409878 2010 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
HIST3H3Q16695 MST1R-214ENST00000613534 2025 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
HIST3H3Q16695 GNGT2-201ENST00000300406 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
HIST3H3Q16695 H2AFB2-201ENST00000354514 348 ntAPPRIS P1 BASIC16.11■□□□□ 0.17
HIST3H3Q16695 ZMYM5-203ENST00000382907 1092 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
HIST3H3Q16695 ABHD14B-208ENST00000525795 980 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
HIST3H3Q16695 PPOX-219ENST00000544598 813 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
HIST3H3Q16695 FAM181A-203ENST00000556222 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
HIST3H3Q16695 CADM1-222ENST00000616271 1246 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
HIST3H3Q16695 AC079602.3-201ENST00000623931 403 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
HIST3H3Q16695 NDUFAB1-201ENST00000007516 717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
HIST3H3Q16695 PCDHA2-203ENST00000526136 5254 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
HIST3H3Q16695 SMAD4-201ENST00000342988 8769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
HIST3H3Q16695 CNNM3-202ENST00000377060 3308 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
HIST3H3Q16695 NRBP1-203ENST00000379852 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
HIST3H3Q16695 LY6E-203ENST00000517503 1335 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
HIST3H3Q16695 MID1IP1-201ENST00000336949 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
HIST3H3Q16695 PDE4A-202ENST00000344979 2579 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
HIST3H3Q16695 THUMPD2-204ENST00000505747 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
HIST3H3Q16695 ADORA1-202ENST00000337894 2919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
HIST3H3Q16695 TRABD-201ENST00000303434 2329 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
HIST3H3Q16695 LINC00574-201ENST00000420557 2318 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
HIST3H3Q16695 ZNF839-202ENST00000442396 2987 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
HIST3H3Q16695 IFFO1-204ENST00000396840 2677 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
HIST3H3Q16695 PARP16-202ENST00000444347 2352 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
HIST3H3Q16695 ADRA1A-205ENST00000380582 2089 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
HIST3H3Q16695 CNTNAP3B-203ENST00000377561 5379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
HIST3H3Q16695 SP7-203ENST00000537210 1472 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
HIST3H3Q16695 ANKRD17-211ENST00000639793 3486 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
HIST3H3Q16695 PSRC1-205ENST00000409138 1826 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
HIST3H3Q16695 KMT5B-206ENST00000405515 2869 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
HIST3H3Q16695 GATA2-203ENST00000487848 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
HIST3H3Q16695 PCDHA1-202ENST00000394633 2204 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
HIST3H3Q16695 MFSD2A-203ENST00000420632 1914 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
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