Protein–RNA interactions for Protein: Q14721

KCNB1, Potassium voltage-gated channel subfamily B member 1, humanhuman

Predictions only

Length 858 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCNB1Q14721 MRI1-201ENST00000040663 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
KCNB1Q14721 KIFC3-201ENST00000379655 3427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
KCNB1Q14721 NPLOC4-201ENST00000331134 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
KCNB1Q14721 MAFF-201ENST00000338483 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
KCNB1Q14721 WIPI1-202ENST00000546360 1575 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
KCNB1Q14721 DAPK2-205ENST00000558069 1473 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
KCNB1Q14721 DGCR6L-201ENST00000248879 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
KCNB1Q14721 BUD23-201ENST00000265758 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
KCNB1Q14721 FAM212A-201ENST00000333323 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
KCNB1Q14721 ZNF534-203ENST00000432303 956 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
KCNB1Q14721 UNC5B-AS1-201ENST00000447119 647 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
KCNB1Q14721 ABHD11-207ENST00000458339 890 ntTSL 3 BASIC20.27■□□□□ 0.84
KCNB1Q14721 DCTN3-209ENST00000477738 713 ntTSL 3 BASIC20.27■□□□□ 0.84
KCNB1Q14721 PLXND1-205ENST00000504689 546 ntTSL 3 BASIC20.27■□□□□ 0.84
KCNB1Q14721 LINC01024-205ENST00000521563 939 ntTSL 3 BASIC20.27■□□□□ 0.84
KCNB1Q14721 SLC25A11-202ENST00000544061 952 ntTSL 3 BASIC20.27■□□□□ 0.84
KCNB1Q14721 AC010331.1-201ENST00000611423 582 ntBASIC20.27■□□□□ 0.84
KCNB1Q14721 AC008735.6-201ENST00000635964 1292 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
KCNB1Q14721 LYSMD4-201ENST00000332728 2847 ntTSL 4 BASIC20.27■□□□□ 0.84
KCNB1Q14721 PTP4A3-202ENST00000349124 2710 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
KCNB1Q14721 JMJD6-202ENST00000397625 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
KCNB1Q14721 ICA1-208ENST00000407906 1615 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
KCNB1Q14721 MRPL10-203ENST00000414011 1622 ntTSL 3 BASIC20.27■□□□□ 0.83
KCNB1Q14721 PARP16-202ENST00000444347 2352 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.83
KCNB1Q14721 THOC3-212ENST00000628318 1442 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.83
KCNB1Q14721 NUDT16L1-201ENST00000304301 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
KCNB1Q14721 ZNF394-201ENST00000337673 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
KCNB1Q14721 TAL1-202ENST00000371884 4642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
KCNB1Q14721 SF1-203ENST00000377387 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
KCNB1Q14721 DLGAP1-222ENST00000639615 1898 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
KCNB1Q14721 MFGE8-202ENST00000268151 1752 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
KCNB1Q14721 MMP9-201ENST00000372330 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
KCNB1Q14721 AC134043.2-201ENST00000624206 2238 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
KCNB1Q14721 TBX2-201ENST00000240328 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
KCNB1Q14721 MACROD2-201ENST00000217246 4994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
KCNB1Q14721 FAM117B-201ENST00000392238 5763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
KCNB1Q14721 MFSD2A-203ENST00000420632 1914 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
KCNB1Q14721 ATP6AP2-214ENST00000636287 1904 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
KCNB1Q14721 SIGLEC6-203ENST00000359982 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
KCNB1Q14721 UPK3B-201ENST00000257632 1296 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
KCNB1Q14721 S100A16-203ENST00000368705 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
KCNB1Q14721 TMPOP1-202ENST00000424642 1267 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
KCNB1Q14721 AC105935.2-201ENST00000435478 544 ntTSL 4 BASIC20.26■□□□□ 0.83
KCNB1Q14721 AL162457.2-201ENST00000447909 937 ntTSL 3 BASIC20.26■□□□□ 0.83
KCNB1Q14721 C12orf43-206ENST00000537817 1270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
KCNB1Q14721 TK2-213ENST00000563369 882 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
KCNB1Q14721 MAP3K14-AS1-202ENST00000585351 893 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
KCNB1Q14721 AC027682.4-201ENST00000605277 798 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
KCNB1Q14721 AC024243.1-201ENST00000609234 778 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
KCNB1Q14721 RNF187-203ENST00000639044 708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
KCNB1Q14721 PODN-203ENST00000395871 2744 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
KCNB1Q14721 PCBP3-205ENST00000400310 2168 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
KCNB1Q14721 FMR1-206ENST00000370477 3437 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
KCNB1Q14721 CDX4-201ENST00000373514 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
KCNB1Q14721 MID1IP1-202ENST00000378474 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
KCNB1Q14721 TMC6-203ENST00000392467 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
KCNB1Q14721 MEN1-203ENST00000337652 3162 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
KCNB1Q14721 FDXR-202ENST00000413947 1809 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
KCNB1Q14721 SORCS3-201ENST00000369699 5530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
KCNB1Q14721 HS3ST2-201ENST00000261374 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
KCNB1Q14721 PDLIM3-201ENST00000284767 2589 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
KCNB1Q14721 LRRN4CL-201ENST00000317449 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
KCNB1Q14721 TRAF3-203ENST00000392745 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
KCNB1Q14721 GFY-201ENST00000576655 1876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
KCNB1Q14721 GAD2-202ENST00000376248 680 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
KCNB1Q14721 TRPT1-202ENST00000394546 1058 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
KCNB1Q14721 DHRS4L2-202ENST00000397071 1117 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
KCNB1Q14721 AC007563.2-201ENST00000447289 552 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
KCNB1Q14721 AC002467.1-201ENST00000457510 657 ntTSL 3 BASIC20.25■□□□□ 0.83
KCNB1Q14721 REEP1-207ENST00000535845 1196 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
KCNB1Q14721 TRPT1-210ENST00000541278 941 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
KCNB1Q14721 REEP1-209ENST00000541910 969 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
KCNB1Q14721 PRTN3-202ENST00000544537 1036 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
KCNB1Q14721 H3F3B-206ENST00000587560 551 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
KCNB1Q14721 GPX4-207ENST00000589115 812 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
KCNB1Q14721 SYNGR4-204ENST00000601610 859 ntTSL 3 BASIC20.25■□□□□ 0.83
KCNB1Q14721 PITPNB-211ENST00000634017 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
KCNB1Q14721 LINC00634-201ENST00000381348 1510 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
KCNB1Q14721 REPS1-202ENST00000367663 2607 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
KCNB1Q14721 WDR59-202ENST00000536050 1752 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
KCNB1Q14721 SQOR-201ENST00000260324 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
KCNB1Q14721 NDRG2-208ENST00000397851 2022 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
KCNB1Q14721 RELA-226ENST00000612991 2266 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
KCNB1Q14721 ARFIP2-201ENST00000254584 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
KCNB1Q14721 STN1-201ENST00000224950 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
KCNB1Q14721 ADCK5-201ENST00000308860 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
KCNB1Q14721 SDHA-204ENST00000504309 2067 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
KCNB1Q14721 CD40-202ENST00000372285 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
KCNB1Q14721 LUC7L-201ENST00000293872 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
KCNB1Q14721 RHOB-201ENST00000272233 2372 ntAPPRIS P1 BASIC20.24■□□□□ 0.83
KCNB1Q14721 PPAN-P2RY11-201ENST00000393796 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
KCNB1Q14721 FOLH1-204ENST00000356696 2403 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
KCNB1Q14721 GNE-204ENST00000539208 2190 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
KCNB1Q14721 GSDMD-206ENST00000526406 2496 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
KCNB1Q14721 HMGB3P22-201ENST00000442010 597 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
KCNB1Q14721 FAHD2CP-202ENST00000443258 893 ntTSL 3 BASIC20.24■□□□□ 0.83
KCNB1Q14721 EHMT1-211ENST00000482340 691 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
KCNB1Q14721 RN7SL850P-201ENST00000579959 291 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
KCNB1Q14721 MIR3917-201ENST00000580971 93 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
KCNB1Q14721 PIGV-201ENST00000078527 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.6 ms