Protein–RNA interactions for Protein: Q14534

SQLE, Squalene monooxygenase, humanhuman

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Length 574 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SQLEQ14534 DDX1-207ENST00000617198 2257 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
SQLEQ14534 TUFM-201ENST00000313511 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
SQLEQ14534 BFSP1-205ENST00000536626 2075 ntTSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
SQLEQ14534 SLC26A11-212ENST00000572725 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
SQLEQ14534 CYP2W1-201ENST00000308919 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
SQLEQ14534 HNRNPLL-202ENST00000358367 2779 ntTSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
SQLEQ14534 CYP2D7-201ENST00000358097 1655 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
SQLEQ14534 KCNA7-201ENST00000221444 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
SQLEQ14534 NXNL2-202ENST00000375855 1457 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
SQLEQ14534 AC108860.2-201ENST00000562760 2183 ntBASIC17.65■□□□□ 0.42
SQLEQ14534 MT3-201ENST00000200691 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
SQLEQ14534 RXFP4-201ENST00000368318 1240 ntAPPRIS P1 BASIC17.65■□□□□ 0.42
SQLEQ14534 RGCC-201ENST00000379359 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
SQLEQ14534 FAM207BP-201ENST00000447172 505 ntBASIC17.65■□□□□ 0.42
SQLEQ14534 CHAC1-203ENST00000487220 853 ntTSL 3 BASIC17.65■□□□□ 0.42
SQLEQ14534 AC026366.1-201ENST00000488803 879 ntBASIC17.65■□□□□ 0.42
SQLEQ14534 TMEM235-204ENST00000551068 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
SQLEQ14534 FCMR-201ENST00000367091 1950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
SQLEQ14534 HCK-210ENST00000629881 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
SQLEQ14534 PIP5K1C-205ENST00000589578 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
SQLEQ14534 C8orf34-206ENST00000518698 2223 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
SQLEQ14534 CIAO1-203ENST00000488633 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
SQLEQ14534 TXNRD2-218ENST00000542719 2024 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
SQLEQ14534 EFHC1-206ENST00000635760 2030 ntTSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
SQLEQ14534 DTNB-209ENST00000407038 2294 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
SQLEQ14534 EPS8L2-205ENST00000526198 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
SQLEQ14534 BNIP2-213ENST00000612191 2515 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
SQLEQ14534 CD99P1-204ENST00000435581 2788 ntTSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
SQLEQ14534 SEPT2-208ENST00000407971 3267 ntTSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
SQLEQ14534 ANXA6-201ENST00000354546 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
SQLEQ14534 SYT7-209ENST00000542836 1362 ntTSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
SQLEQ14534 LTBP4-203ENST00000308370 4948 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
SQLEQ14534 CHTF8-203ENST00000448552 2903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
SQLEQ14534 ASB18-201ENST00000409749 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.42
SQLEQ14534 CACNA2D1-203ENST00000423588 1429 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.42
SQLEQ14534 LBX1-AS1-201ENST00000430651 2553 ntTSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
SQLEQ14534 ADGRG2-209ENST00000379876 4779 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
SQLEQ14534 AC010186.2-201ENST00000575094 2612 ntTSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
SQLEQ14534 ARHGAP22-205ENST00000417912 2352 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
SQLEQ14534 CDC25A-201ENST00000302506 3783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
SQLEQ14534 TRAPPC5-201ENST00000317378 790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
SQLEQ14534 MDK-201ENST00000359803 985 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
SQLEQ14534 AC133681.1-201ENST00000465482 601 ntBASIC17.64■□□□□ 0.41
SQLEQ14534 IAH1-215ENST00000497473 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
SQLEQ14534 TMEM263-203ENST00000547242 811 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
SQLEQ14534 CLN6-207ENST00000566347 981 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
SQLEQ14534 AC124016.1-201ENST00000609552 612 ntBASIC17.64■□□□□ 0.41
SQLEQ14534 AC008622.2-201ENST00000617006 1229 ntBASIC17.64■□□□□ 0.41
SQLEQ14534 RGS14-201ENST00000408923 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
SQLEQ14534 GRAP2-202ENST00000407075 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
SQLEQ14534 VEGFA-206ENST00000372077 2834 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
SQLEQ14534 CDH24-204ENST00000487137 3438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
SQLEQ14534 ENOPH1-202ENST00000505846 1689 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
SQLEQ14534 ACVRL1-202ENST00000419526 1356 ntTSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
SQLEQ14534 FGFR1-206ENST00000397091 5702 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
SQLEQ14534 CCDC144A-210ENST00000456009 2306 ntTSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
SQLEQ14534 LOXL3-205ENST00000409986 2005 ntTSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
SQLEQ14534 NIFK-201ENST00000285814 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
SQLEQ14534 BPGM-202ENST00000393132 2051 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
SQLEQ14534 ZNF264-202ENST00000536056 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
SQLEQ14534 SIGLEC6-203ENST00000359982 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
SQLEQ14534 GLIS1-202ENST00000628545 2807 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
SQLEQ14534 PRPF19-201ENST00000227524 2157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
SQLEQ14534 CDK11B-201ENST00000340677 2534 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
SQLEQ14534 KRT18P55-202ENST00000578578 1546 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
SQLEQ14534 BRI3BP-201ENST00000341446 6648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
SQLEQ14534 DOC2B-203ENST00000613549 6048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
SQLEQ14534 GSEC-202ENST00000629441 1572 ntTSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
SQLEQ14534 AMIGO2-202ENST00000429635 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
SQLEQ14534 BCR-201ENST00000305877 7082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
SQLEQ14534 KBTBD11-201ENST00000320248 6710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
SQLEQ14534 NT5C1A-201ENST00000235628 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
SQLEQ14534 CMTM8-201ENST00000307526 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
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SQLEQ14534 ELP6-205ENST00000439305 880 ntTSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
SQLEQ14534 MCCD1P1-208ENST00000445732 328 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
SQLEQ14534 NREP-209ENST00000455559 698 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.63■□□□□ 0.41
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SQLEQ14534 AC009052.1-201ENST00000567090 298 ntTSL 3 BASIC17.63■□□□□ 0.41
SQLEQ14534 AC110285.5-201ENST00000611501 352 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
SQLEQ14534 DENND5B-201ENST00000354285 3132 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
SQLEQ14534 BBS5-202ENST00000392663 3107 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
SQLEQ14534 NADSYN1-201ENST00000319023 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
SQLEQ14534 EVPL-202ENST00000586740 6223 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
SQLEQ14534 CACNA2D2-201ENST00000266039 5476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
SQLEQ14534 NR2E1-202ENST00000368986 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
SQLEQ14534 STXBP3-201ENST00000370008 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
SQLEQ14534 ETV7-202ENST00000340181 1719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
SQLEQ14534 PHF20L1-201ENST00000220847 3297 ntTSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
SQLEQ14534 HARS-201ENST00000307633 1780 ntTSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
SQLEQ14534 CBFB-202ENST00000412916 2971 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
SQLEQ14534 KRT16P1-201ENST00000399124 1418 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
SQLEQ14534 DMPK-201ENST00000291270 2787 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
SQLEQ14534 ATP6AP2-214ENST00000636287 1904 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
SQLEQ14534 MAP4K4-202ENST00000324219 7526 ntTSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
SQLEQ14534 GGNBP2-212ENST00000613102 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
SQLEQ14534 EGFL7-204ENST00000406555 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
SQLEQ14534 SLC25A39-202ENST00000377095 1565 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
SQLEQ14534 GAB3-203ENST00000424127 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
SQLEQ14534 SQSTM1-202ENST00000389805 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
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