Protein–RNA interactions for Protein: Q13956

PDE6H, Retinal cone rhodopsin-sensitive cGMP 3',5'-cyclic phosphodiesterase subunit gamma, humanhuman

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Length 83 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDE6HQ13956 MRI1-201ENST00000040663 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
PDE6HQ13956 MFSD11-220ENST00000621483 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
PDE6HQ13956 PCGF3-201ENST00000362003 5685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
PDE6HQ13956 MARVELD3-202ENST00000299952 2214 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.92□□□□□ -0.18
PDE6HQ13956 ZZZ3-201ENST00000370798 2468 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
PDE6HQ13956 CCM2-207ENST00000475551 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.92□□□□□ -0.18
PDE6HQ13956 DLK2-203ENST00000372488 1590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
PDE6HQ13956 IRF7-202ENST00000348655 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
PDE6HQ13956 SCARB1-208ENST00000544327 1812 ntTSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
PDE6HQ13956 FFAR2-201ENST00000246549 2051 ntAPPRIS P1 BASIC13.92□□□□□ -0.18
PDE6HQ13956 VEGFA-206ENST00000372077 2834 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
PDE6HQ13956 HOXB1-202ENST00000577092 1414 ntBASIC13.92□□□□□ -0.18
PDE6HQ13956 ZNF746-202ENST00000458143 3797 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.92□□□□□ -0.18
PDE6HQ13956 CRTC1-201ENST00000321949 2501 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
PDE6HQ13956 FST-202ENST00000396947 2538 ntTSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
PDE6HQ13956 JMY-201ENST00000396137 9042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
PDE6HQ13956 NEIL1-221ENST00000569035 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
PDE6HQ13956 CBL-204ENST00000634840 4813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
PDE6HQ13956 IMMP2L-202ENST00000405709 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
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PDE6HQ13956 C12orf42-205ENST00000548048 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
PDE6HQ13956 TACSTD2-201ENST00000371225 2351 ntAPPRIS P1 BASIC13.92□□□□□ -0.18
PDE6HQ13956 PTPN6-204ENST00000456013 2389 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
PDE6HQ13956 CTSA-204ENST00000372484 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
PDE6HQ13956 AP000697.1-201ENST00000430607 339 ntTSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
PDE6HQ13956 AC003982.1-201ENST00000477404 484 ntTSL 2 BASIC13.92□□□□□ -0.18
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PDE6HQ13956 AC097662.2-201ENST00000641359 267 ntAPPRIS P1 BASIC13.92□□□□□ -0.18
PDE6HQ13956 AC093010.1-201ENST00000473625 1624 ntBASIC13.92□□□□□ -0.18
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PDE6HQ13956 RAB17-201ENST00000264601 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
PDE6HQ13956 THUMPD2-204ENST00000505747 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
PDE6HQ13956 DHRS4L2-201ENST00000335125 1370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
PDE6HQ13956 PRMT1-201ENST00000391851 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
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PDE6HQ13956 AC091153.3-201ENST00000497885 472 ntTSL 2 BASIC13.91□□□□□ -0.18
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PDE6HQ13956 BPGM-203ENST00000418040 1870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
PDE6HQ13956 TUBGCP3-202ENST00000375669 2723 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
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PDE6HQ13956 HCK-210ENST00000629881 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.91□□□□□ -0.18
PDE6HQ13956 C18orf8-201ENST00000269221 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
PDE6HQ13956 DHRS4-201ENST00000313250 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
PDE6HQ13956 CYP2D6-201ENST00000359033 1433 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
PDE6HQ13956 CEP83-AS1-201ENST00000623122 2482 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
PDE6HQ13956 SIGLEC6-203ENST00000359982 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
PDE6HQ13956 RABL6-201ENST00000311502 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
PDE6HQ13956 ATP6AP2-214ENST00000636287 1904 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
PDE6HQ13956 NFATC1-206ENST00000542384 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
PDE6HQ13956 SKOR1-204ENST00000554240 3597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
PDE6HQ13956 DHX33-202ENST00000433302 2225 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
PDE6HQ13956 PPRC1-201ENST00000278070 5330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
PDE6HQ13956 TOR3A-203ENST00000367627 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
PDE6HQ13956 TRIM8-201ENST00000302424 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
PDE6HQ13956 NRG2-205ENST00000361474 3020 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
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