Protein–RNA interactions for Protein: Q13733

ATP1A4, Sodium/potassium-transporting ATPase subunit alpha-4, humanhuman

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Length 1,029 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP1A4Q13733 OGFOD2-201ENST00000228922 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
ATP1A4Q13733 RBM7-201ENST00000375490 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
ATP1A4Q13733 RBFOX1-215ENST00000553186 2196 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
ATP1A4Q13733 BLACE-201ENST00000378120 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
ATP1A4Q13733 FOXE1-201ENST00000375123 3462 ntAPPRIS P1 BASIC17.73■□□□□ 0.43
ATP1A4Q13733 ART1-201ENST00000250693 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
ATP1A4Q13733 OR13J1-201ENST00000377981 1339 ntAPPRIS P1 BASIC17.72■□□□□ 0.43
ATP1A4Q13733 PEX16-202ENST00000378750 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
ATP1A4Q13733 CYB561-205ENST00000542042 1302 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
ATP1A4Q13733 AL390860.1-201ENST00000449298 1541 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
ATP1A4Q13733 TBC1D3P2-202ENST00000577902 1649 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
ATP1A4Q13733 E2F2-201ENST00000361729 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
ATP1A4Q13733 FAM187A-202ENST00000412523 1748 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
ATP1A4Q13733 DHRS3-204ENST00000616661 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
ATP1A4Q13733 GCOM1-202ENST00000380569 1846 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
ATP1A4Q13733 ZNF821-221ENST00000611294 1833 ntTSL 3 BASIC17.72■□□□□ 0.43
ATP1A4Q13733 GBGT1-208ENST00000540636 1934 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
ATP1A4Q13733 RNF139-201ENST00000303545 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
ATP1A4Q13733 TOR3A-203ENST00000367627 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
ATP1A4Q13733 PCDHGC5-202ENST00000610789 2763 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
ATP1A4Q13733 ARFRP1-213ENST00000619493 2456 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.72■□□□□ 0.43
ATP1A4Q13733 IRF7-203ENST00000397566 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
ATP1A4Q13733 PLIN2-201ENST00000276914 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
ATP1A4Q13733 AC073107.1-201ENST00000633579 1962 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
ATP1A4Q13733 MRPL2-202ENST00000388752 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
ATP1A4Q13733 C1orf210-202ENST00000523677 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
ATP1A4Q13733 AVL9-209ENST00000640103 1367 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
ATP1A4Q13733 AC115618.1-201ENST00000376775 549 ntTSL 3 BASIC17.72■□□□□ 0.43
ATP1A4Q13733 YPEL3-201ENST00000398838 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
ATP1A4Q13733 MALL-203ENST00000427178 1070 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
ATP1A4Q13733 TSPY23P-201ENST00000440136 739 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
ATP1A4Q13733 FOSL1-203ENST00000531493 1200 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
ATP1A4Q13733 RAB6A-207ENST00000541588 758 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
ATP1A4Q13733 C17orf49-208ENST00000552402 760 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
ATP1A4Q13733 CENPS-CORT-205ENST00000602787 571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.72■□□□□ 0.43
ATP1A4Q13733 AC005906.2-206ENST00000638180 1029 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
ATP1A4Q13733 DENND5B-201ENST00000354285 3132 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
ATP1A4Q13733 MEPCE-201ENST00000310512 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
ATP1A4Q13733 SPAG6-203ENST00000376624 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
ATP1A4Q13733 TRMT6-202ENST00000453074 2239 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
ATP1A4Q13733 COL4A3BP-203ENST00000380494 5651 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
ATP1A4Q13733 LINC01356-201ENST00000401018 1819 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
ATP1A4Q13733 BMP2K-208ENST00000628286 3848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
ATP1A4Q13733 ETV4-204ENST00000545089 1628 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
ATP1A4Q13733 GHDC-202ENST00000414034 2496 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
ATP1A4Q13733 PRORSD1P-202ENST00000563365 2154 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
ATP1A4Q13733 AL139384.1-201ENST00000612143 3047 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
ATP1A4Q13733 ATF5-201ENST00000423777 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
ATP1A4Q13733 FAM219B-204ENST00000563119 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
ATP1A4Q13733 ARL5A-201ENST00000295087 5326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
ATP1A4Q13733 CMPK2-201ENST00000256722 2884 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
ATP1A4Q13733 SEMA3B-209ENST00000456560 2221 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
ATP1A4Q13733 CD177-203ENST00000618265 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
ATP1A4Q13733 DLK1-202ENST00000341267 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
ATP1A4Q13733 ARID3A-201ENST00000263620 5941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
ATP1A4Q13733 CARD9-201ENST00000371732 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
ATP1A4Q13733 AATF-208ENST00000619387 2141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
ATP1A4Q13733 IER3-202ENST00000376377 1350 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
ATP1A4Q13733 NOMO1-208ENST00000620755 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
ATP1A4Q13733 MMEL1-201ENST00000378412 2849 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
ATP1A4Q13733 TMEM171-201ENST00000287773 1247 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
ATP1A4Q13733 GPX4-201ENST00000354171 919 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
ATP1A4Q13733 SCO2-202ENST00000395693 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
ATP1A4Q13733 COPS8-203ENST00000409334 794 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
ATP1A4Q13733 SNX5-210ENST00000481323 562 ntTSL 3 BASIC17.71■□□□□ 0.43
ATP1A4Q13733 AF186192.2-201ENST00000524514 423 ntTSL 3 BASIC17.71■□□□□ 0.43
ATP1A4Q13733 GRP-204ENST00000529320 824 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
ATP1A4Q13733 SMIM20-205ENST00000614775 1190 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
ATP1A4Q13733 RFC2-213ENST00000621097 1635 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
ATP1A4Q13733 CEP85L-205ENST00000419517 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
ATP1A4Q13733 PLAUR-203ENST00000340093 1548 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
ATP1A4Q13733 CXADR-201ENST00000284878 6254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
ATP1A4Q13733 RNF112-201ENST00000461366 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
ATP1A4Q13733 ESYT2-206ENST00000613624 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
ATP1A4Q13733 SAMD11-212ENST00000617307 2314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
ATP1A4Q13733 EDA-204ENST00000374553 5272 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
ATP1A4Q13733 ZNF211-203ENST00000299871 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.71■□□□□ 0.43
ATP1A4Q13733 PRDM5-201ENST00000264808 5330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
ATP1A4Q13733 CAMKV-205ENST00000467248 1688 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.42
ATP1A4Q13733 SDHAP1-207ENST00000440850 2000 ntBASIC17.71■□□□□ 0.42
ATP1A4Q13733 FOXD4L6-201ENST00000622588 2034 ntAPPRIS P1 BASIC17.71■□□□□ 0.42
ATP1A4Q13733 PGRMC2-207ENST00000520121 3785 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
ATP1A4Q13733 MAPK11-201ENST00000330651 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
ATP1A4Q13733 TCIRG1-201ENST00000265686 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
ATP1A4Q13733 CYP2D7-203ENST00000433992 1740 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
ATP1A4Q13733 CYP2D7-207ENST00000612115 1734 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
ATP1A4Q13733 MMD2-201ENST00000401401 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
ATP1A4Q13733 RARRES1-201ENST00000237696 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
ATP1A4Q13733 PHKA2-201ENST00000379942 5559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
ATP1A4Q13733 TNFRSF19-202ENST00000382258 1625 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
ATP1A4Q13733 QRICH1-201ENST00000357496 3083 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
ATP1A4Q13733 MPG-201ENST00000219431 1193 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC17.7■□□□□ 0.42
ATP1A4Q13733 TREX2-203ENST00000338525 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
ATP1A4Q13733 COMTD1-201ENST00000372538 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
ATP1A4Q13733 MADCAM1-203ENST00000382683 603 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
ATP1A4Q13733 KRTAP5-10-201ENST00000398531 1176 ntAPPRIS P1 BASIC17.7■□□□□ 0.42
ATP1A4Q13733 AP006621.4-201ENST00000527021 532 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
ATP1A4Q13733 EEF1D-243ENST00000532400 419 ntTSL 3 BASIC17.7■□□□□ 0.42
ATP1A4Q13733 AP000777.3-201ENST00000538705 491 ntTSL 3 BASIC17.7■□□□□ 0.42
ATP1A4Q13733 MTHFS-202ENST00000559722 948 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.4 ms