Protein–RNA interactions for Protein: Q13702

RAPSN, 43 kDa receptor-associated protein of the synapse, humanhuman

Predictions only

Length 412 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAPSNQ13702 GAS7-205ENST00000542249 1799 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
RAPSNQ13702 CCDC106-201ENST00000308964 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
RAPSNQ13702 TMEM106C-202ENST00000429772 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
RAPSNQ13702 SKIDA1-202ENST00000449193 6598 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC17.64■□□□□ 0.41
RAPSNQ13702 PRKCB-202ENST00000321728 2689 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
RAPSNQ13702 CD70-201ENST00000245903 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
RAPSNQ13702 SOWAHC-201ENST00000356454 4657 ntAPPRIS P1 BASIC17.64■□□□□ 0.41
RAPSNQ13702 BUB3-202ENST00000368859 667 ntTSL 3 BASIC17.64■□□□□ 0.41
RAPSNQ13702 MALL-203ENST00000427178 1070 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
RAPSNQ13702 CR769775.1-204ENST00000439760 747 ntTSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
RAPSNQ13702 ARPIN-202ENST00000460685 2145 ntTSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
RAPSNQ13702 SNX5-210ENST00000481323 562 ntTSL 3 BASIC17.64■□□□□ 0.41
RAPSNQ13702 EEF1D-243ENST00000532400 419 ntTSL 3 BASIC17.64■□□□□ 0.41
RAPSNQ13702 NT5C-210ENST00000582160 860 ntTSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
RAPSNQ13702 JOSD2-204ENST00000598418 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
RAPSNQ13702 AC022154.1-201ENST00000600303 766 ntTSL 3 BASIC17.64■□□□□ 0.41
RAPSNQ13702 mascRNA-menRNA.2-201ENST00000616984 58 ntBASIC17.64■□□□□ 0.41
RAPSNQ13702 ZAR1L-202ENST00000533490 1564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
RAPSNQ13702 CD276-201ENST00000318424 2738 ntTSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
RAPSNQ13702 ATRIP-202ENST00000346691 2509 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
RAPSNQ13702 ARPC4-201ENST00000397261 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
RAPSNQ13702 SAYSD1-201ENST00000229903 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
RAPSNQ13702 ALG9-214ENST00000614444 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
RAPSNQ13702 APH1A-202ENST00000360244 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
RAPSNQ13702 NFKBIZ-201ENST00000326151 2058 ntTSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
RAPSNQ13702 SPON2-203ENST00000431380 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
RAPSNQ13702 IRX1P1-201ENST00000438849 1838 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
RAPSNQ13702 ZNF394-201ENST00000337673 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
RAPSNQ13702 CRHR2-207ENST00000471646 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
RAPSNQ13702 ACAA1-201ENST00000301810 1540 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
RAPSNQ13702 SAMD11-216ENST00000620200 1874 ntTSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
RAPSNQ13702 SLC39A3-202ENST00000455372 2940 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
RAPSNQ13702 QPRT-202ENST00000395384 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
RAPSNQ13702 GGNBP2-210ENST00000611219 2315 ntTSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
RAPSNQ13702 PLCL2-204ENST00000615277 4147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
RAPSNQ13702 JPT1-203ENST00000409753 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
RAPSNQ13702 UPK3B-201ENST00000257632 1296 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
RAPSNQ13702 BUD23-201ENST00000265758 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
RAPSNQ13702 MED30-201ENST00000297347 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
RAPSNQ13702 PYDC1-201ENST00000302964 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
RAPSNQ13702 AANAT-202ENST00000392492 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
RAPSNQ13702 AC074183.1-201ENST00000439105 782 ntTSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
RAPSNQ13702 CHCHD3-203ENST00000448878 1038 ntTSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
RAPSNQ13702 APBB3-216ENST00000511201 1014 ntTSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
RAPSNQ13702 PRSS44-201ENST00000515154 1146 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
RAPSNQ13702 TMEM218-206ENST00000527766 812 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.63■□□□□ 0.41
RAPSNQ13702 AC022509.3-202ENST00000545819 566 ntTSL 3 BASIC17.63■□□□□ 0.41
RAPSNQ13702 RNF187-203ENST00000639044 708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
RAPSNQ13702 ARHGAP22-203ENST00000374172 2380 ntTSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
RAPSNQ13702 ZNF200-202ENST00000396870 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
RAPSNQ13702 KTI12-201ENST00000371614 1714 ntAPPRIS P1 BASIC17.63■□□□□ 0.41
RAPSNQ13702 SIM2-201ENST00000290399 4442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
RAPSNQ13702 ATP2A2-201ENST00000308664 4453 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
RAPSNQ13702 PDE9A-213ENST00000398236 1776 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
RAPSNQ13702 EGFR-202ENST00000342916 2239 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
RAPSNQ13702 NF2-203ENST00000353887 1845 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
RAPSNQ13702 HEBP2-204ENST00000607197 10014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
RAPSNQ13702 CCDC157-203ENST00000405659 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
RAPSNQ13702 EHMT1-203ENST00000460843 5137 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
RAPSNQ13702 PSTPIP1-203ENST00000558012 1896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
RAPSNQ13702 PLA2G2F-201ENST00000375102 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
RAPSNQ13702 SCARB1-203ENST00000415380 2731 ntTSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
RAPSNQ13702 HAUS4-217ENST00000555367 1454 ntTSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
RAPSNQ13702 ATXN7L2-202ENST00000369870 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
RAPSNQ13702 SH3BP2-202ENST00000435136 2318 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
RAPSNQ13702 FAM53A-207ENST00000489363 2776 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
RAPSNQ13702 UBE2E1-201ENST00000306627 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
RAPSNQ13702 MTA1-201ENST00000331320 2876 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
RAPSNQ13702 BIRC8-201ENST00000426466 2026 ntAPPRIS P1 BASIC17.62■□□□□ 0.41
RAPSNQ13702 GAL3ST1-206ENST00000406955 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
RAPSNQ13702 PTGIR-201ENST00000291294 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
RAPSNQ13702 BRMS1L-201ENST00000216807 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
RAPSNQ13702 CACNA1A-201ENST00000360228 8627 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
RAPSNQ13702 ZNF131-206ENST00000505606 3209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
RAPSNQ13702 CERS4-201ENST00000251363 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
RAPSNQ13702 AP5S1-202ENST00000379567 1791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
RAPSNQ13702 CAPS-201ENST00000452990 1789 ntTSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
RAPSNQ13702 SMIM19-202ENST00000416469 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
RAPSNQ13702 CATIP-AS1-202ENST00000441749 480 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
RAPSNQ13702 AC112907.2-201ENST00000448639 330 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
RAPSNQ13702 TNFSF13-208ENST00000483039 959 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
RAPSNQ13702 VENTXP5-201ENST00000523979 775 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
RAPSNQ13702 MRPL46-202ENST00000558531 1002 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
RAPSNQ13702 GCSHP2-201ENST00000560971 527 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
RAPSNQ13702 AC138207.7-201ENST00000584499 668 ntTSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
RAPSNQ13702 AC064834.1-201ENST00000606986 503 ntTSL 3 BASIC17.62■□□□□ 0.41
RAPSNQ13702 AL807752.6-202ENST00000622933 765 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC17.62■□□□□ 0.41
RAPSNQ13702 UBE2O-201ENST00000319380 5436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
RAPSNQ13702 HTR7P1-202ENST00000624664 4411 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
RAPSNQ13702 QPCTL-202ENST00000366382 1814 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
RAPSNQ13702 ARSA-203ENST00000395619 1824 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
RAPSNQ13702 ART1-201ENST00000250693 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
RAPSNQ13702 OR13J1-201ENST00000377981 1339 ntAPPRIS P1 BASIC17.62■□□□□ 0.41
RAPSNQ13702 AC005332.1-201ENST00000577698 1310 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
RAPSNQ13702 NKD2-201ENST00000274150 1940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
RAPSNQ13702 HMBS-221ENST00000544387 1351 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
RAPSNQ13702 ZBTB16-201ENST00000335953 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
RAPSNQ13702 FAM124A-202ENST00000322475 4761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
RAPSNQ13702 HOXD10-201ENST00000249501 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
RAPSNQ13702 MXRA8-209ENST00000477278 2728 ntTSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.6 ms