Protein–RNA interactions for Protein: Q13258

PTGDR, Prostaglandin D2 receptor, humanhuman

Predictions only

Length 359 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTGDRQ13258 PRSS23-201ENST00000280258 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
PTGDRQ13258 AL133373.2-201ENST00000623187 2828 ntBASIC20.74■□□□□ 0.91
PTGDRQ13258 RELL2-201ENST00000297164 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
PTGDRQ13258 TADA3-201ENST00000301964 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
PTGDRQ13258 FGFR3-202ENST00000340107 4293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
PTGDRQ13258 FKBP3-202ENST00000396062 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
PTGDRQ13258 VMAC-201ENST00000339485 2254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
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PTGDRQ13258 TRABD-201ENST00000303434 2329 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
PTGDRQ13258 NRBP1-203ENST00000379852 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
PTGDRQ13258 HMGA1-205ENST00000447654 2159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
PTGDRQ13258 GNAZ-203ENST00000615612 3333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
PTGDRQ13258 FIBCD1-201ENST00000372337 1868 ntTSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
PTGDRQ13258 MID1IP1-202ENST00000378474 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
PTGDRQ13258 MECP2-205ENST00000453960 1729 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
PTGDRQ13258 GTPBP2-202ENST00000307126 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
PTGDRQ13258 CABIN1-202ENST00000337989 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
PTGDRQ13258 NPFFR2-201ENST00000308744 1922 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
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PTGDRQ13258 ENTPD6-202ENST00000360031 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
PTGDRQ13258 LCE4A-202ENST00000368777 672 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.73■□□□□ 0.91
PTGDRQ13258 AC131097.3-201ENST00000413820 1228 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
PTGDRQ13258 UQCR11-201ENST00000585671 753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
PTGDRQ13258 C16orf74-206ENST00000602766 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.73■□□□□ 0.91
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PTGDRQ13258 PBK-203ENST00000522944 1499 ntTSL 2 BASIC20.73■□□□□ 0.91
PTGDRQ13258 KMT2E-207ENST00000476671 2523 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
PTGDRQ13258 SKOR1-204ENST00000554240 3597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
PTGDRQ13258 PGP-201ENST00000333503 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
PTGDRQ13258 AC118553.2-202ENST00000638792 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
PTGDRQ13258 SLC23A3-203ENST00000409878 2010 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.73■□□□□ 0.91
PTGDRQ13258 MST1R-214ENST00000613534 2025 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
PTGDRQ13258 ACADVL-205ENST00000543245 2227 ntTSL 2 BASIC20.73■□□□□ 0.91
PTGDRQ13258 MAEA-201ENST00000264750 2058 ntTSL 2 BASIC20.73■□□□□ 0.91
PTGDRQ13258 IL17RC-201ENST00000295981 2621 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.73■□□□□ 0.91
PTGDRQ13258 STK11-201ENST00000326873 2611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
PTGDRQ13258 BMS1P4-202ENST00000584747 1716 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
PTGDRQ13258 TRPV4-208ENST00000544971 2295 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
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PTGDRQ13258 PTGES-201ENST00000340607 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
PTGDRQ13258 LPAR2-201ENST00000407877 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
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PTGDRQ13258 SHISA3-201ENST00000319234 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
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PTGDRQ13258 ASCC2-202ENST00000397771 2823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
PTGDRQ13258 FGF8-201ENST00000320185 799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
PTGDRQ13258 AC008105.2-201ENST00000420431 579 ntTSL 4 BASIC20.72■□□□□ 0.91
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PTGDRQ13258 ARSA-201ENST00000216124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
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PTGDRQ13258 TP53BP2-201ENST00000343537 4651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
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PTGDRQ13258 URI1-202ENST00000392271 3444 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
PTGDRQ13258 DENND1A-203ENST00000373624 5010 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.71■□□□□ 0.91
PTGDRQ13258 SENP6-202ENST00000370010 4644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
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PTGDRQ13258 CDKN2AIPNL-202ENST00000458198 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
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PTGDRQ13258 AC006011.2-201ENST00000621313 1158 ntBASIC20.71■□□□□ 0.91
PTGDRQ13258 NUMBL-207ENST00000598779 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
PTGDRQ13258 MEN1-203ENST00000337652 3162 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.71■□□□□ 0.91
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PTGDRQ13258 ADRA1A-201ENST00000276393 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
PTGDRQ13258 CSK-201ENST00000220003 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
PTGDRQ13258 SRP9-203ENST00000366839 1596 ntTSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
PTGDRQ13258 SLC9A6-201ENST00000370695 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
PTGDRQ13258 GPS1-201ENST00000306823 1842 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
PTGDRQ13258 CDH23-212ENST00000616684 4814 ntTSL 5 BASIC20.71■□□□□ 0.91
PTGDRQ13258 SCARF1-202ENST00000348987 2619 ntTSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
PTGDRQ13258 PTPRJ-202ENST00000440289 3158 ntTSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
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