Protein–RNA interactions for Protein: Q13114

TRAF3, TNF receptor-associated factor 3, humanhuman

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Length 568 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAF3Q13114 UBQLN4-201ENST00000368309 3576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
TRAF3Q13114 MIR149-201ENST00000384879 89 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
TRAF3Q13114 CCR12P-201ENST00000446203 998 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
TRAF3Q13114 KHDRBS1-204ENST00000492989 1215 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
TRAF3Q13114 AP006621.4-201ENST00000527021 532 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
TRAF3Q13114 TPSB2-201ENST00000606293 1165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
TRAF3Q13114 CD177-202ENST00000607855 536 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
TRAF3Q13114 AL513523.10-201ENST00000623024 1186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
TRAF3Q13114 FGF13-208ENST00000626909 1039 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
TRAF3Q13114 HEXIM2-201ENST00000307275 1528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
TRAF3Q13114 PNKP-224ENST00000631020 1545 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
TRAF3Q13114 PHGDH-209ENST00000641074 1780 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
TRAF3Q13114 SKIDA1-202ENST00000449193 6598 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
TRAF3Q13114 SEMA6B-201ENST00000586582 3986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
TRAF3Q13114 ZNF133-211ENST00000538547 2245 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
TRAF3Q13114 SHISA3-201ENST00000319234 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
TRAF3Q13114 AL096828.2-201ENST00000567259 1965 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
TRAF3Q13114 NLE1-201ENST00000360831 1726 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
TRAF3Q13114 AC009102.3-201ENST00000623118 1491 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
TRAF3Q13114 SF1-203ENST00000377387 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
TRAF3Q13114 PLBD2-201ENST00000280800 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
TRAF3Q13114 CLASRP-203ENST00000391953 1941 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
TRAF3Q13114 ZNF846-205ENST00000588267 1943 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
TRAF3Q13114 KRT8P7-201ENST00000533003 1432 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
TRAF3Q13114 HSPA4-205ENST00000617074 2358 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
TRAF3Q13114 WSCD1-209ENST00000574232 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
TRAF3Q13114 VEGFA-206ENST00000372077 2834 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
TRAF3Q13114 STRA6-209ENST00000563965 2565 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
TRAF3Q13114 FAM110A-201ENST00000246100 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
TRAF3Q13114 CYP4F2-201ENST00000011989 2067 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
TRAF3Q13114 FERMT2-204ENST00000399304 2082 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
TRAF3Q13114 PDZD3-202ENST00000355547 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
TRAF3Q13114 MEN1-203ENST00000337652 3162 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
TRAF3Q13114 FSCN2-201ENST00000334850 1551 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
TRAF3Q13114 EDNRA-206ENST00000511804 1569 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
TRAF3Q13114 NPBWR1-201ENST00000331251 2687 ntAPPRIS P1 BASIC17.79■□□□□ 0.44
TRAF3Q13114 AC060780.1-201ENST00000635600 1782 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
TRAF3Q13114 AL512380.2-201ENST00000637901 1780 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
TRAF3Q13114 OGFOD2-212ENST00000538755 1949 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
TRAF3Q13114 TBC1D3I-202ENST00000618620 1900 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
TRAF3Q13114 RUNX1-207ENST00000437180 5967 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
TRAF3Q13114 USP18-201ENST00000215794 2129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
TRAF3Q13114 VCY1B-201ENST00000250823 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
TRAF3Q13114 VCY-201ENST00000250825 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
TRAF3Q13114 FUOM-201ENST00000278025 709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
TRAF3Q13114 ANKRD10-202ENST00000310847 1193 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
TRAF3Q13114 AL731557.1-201ENST00000425264 744 ntTSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
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TRAF3Q13114 AC134349.1-201ENST00000543969 385 ntTSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
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TRAF3Q13114 APP-203ENST00000354192 3167 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
TRAF3Q13114 PTP4A3-202ENST00000349124 2710 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
TRAF3Q13114 POLI-207ENST00000579434 2705 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
TRAF3Q13114 PDE9A-206ENST00000380328 1875 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
TRAF3Q13114 ELP5-214ENST00000574993 2209 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
TRAF3Q13114 PRSS35-201ENST00000369700 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
TRAF3Q13114 CACNA1A-214ENST00000614285 8410 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
TRAF3Q13114 KLF3-201ENST00000261438 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
TRAF3Q13114 ALDH3A1-206ENST00000457500 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
TRAF3Q13114 HTR7P1-202ENST00000624664 4411 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
TRAF3Q13114 SYNPO-201ENST00000307662 5374 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
TRAF3Q13114 DHRS2-201ENST00000250383 1705 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
TRAF3Q13114 ERCC2-205ENST00000485403 1538 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
TRAF3Q13114 MAFF-201ENST00000338483 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
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TRAF3Q13114 SLC23A3-207ENST00000455516 2048 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
TRAF3Q13114 RHOC-203ENST00000369632 1026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
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TRAF3Q13114 TAB2-209ENST00000637181 4230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
TRAF3Q13114 FCER2-201ENST00000346664 1596 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
TRAF3Q13114 NR4A1-203ENST00000394824 2639 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
TRAF3Q13114 FCER2-205ENST00000597921 1560 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
TRAF3Q13114 TP53BP2-201ENST00000343537 4651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
TRAF3Q13114 RENBP-202ENST00000393700 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
TRAF3Q13114 PLCL2-204ENST00000615277 4147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
TRAF3Q13114 ACADVL-205ENST00000543245 2227 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
TRAF3Q13114 ZNF131-206ENST00000505606 3209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
TRAF3Q13114 GAS7-210ENST00000579158 1528 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
TRAF3Q13114 ZIC1-201ENST00000282928 5241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
TRAF3Q13114 IL17RC-206ENST00000416074 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
TRAF3Q13114 KRT17P2-201ENST00000300992 1314 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
TRAF3Q13114 PEX16-202ENST00000378750 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
TRAF3Q13114 WFDC1-203ENST00000568638 1319 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
TRAF3Q13114 ST6GALNAC6-201ENST00000291839 2280 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
TRAF3Q13114 CD40-201ENST00000372276 1623 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
TRAF3Q13114 AC007743.1-203ENST00000447423 1623 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
TRAF3Q13114 MYO19-225ENST00000621344 1640 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
TRAF3Q13114 DAG1-220ENST00000539901 5665 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
TRAF3Q13114 CTSB-202ENST00000353047 3875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
TRAF3Q13114 MON1B-202ENST00000439557 1759 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
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