Protein–RNA interactions for Protein: Q0VF96

CGNL1, Cingulin-like protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,302 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CGNL1Q0VF96 NPEPL1-203ENST00000525817 1780 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
CGNL1Q0VF96 TRAM1L1-201ENST00000310754 2023 ntAPPRIS P1 BASIC24.74■■□□□ 1.55
CGNL1Q0VF96 PDLIM2-206ENST00000409141 1463 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
CGNL1Q0VF96 COQ9-210ENST00000567072 1482 ntTSL 3 BASIC24.74■■□□□ 1.55
CGNL1Q0VF96 COLEC12-201ENST00000400256 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
CGNL1Q0VF96 PLD3-205ENST00000409419 1966 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
CGNL1Q0VF96 PPTC7-201ENST00000354300 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
CGNL1Q0VF96 MEN1-205ENST00000377316 2868 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
CGNL1Q0VF96 UPP1-203ENST00000395564 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
CGNL1Q0VF96 IGFALS-202ENST00000415638 2136 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
CGNL1Q0VF96 SDCBP-204ENST00000447182 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
CGNL1Q0VF96 ADPGK-201ENST00000311669 2557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
CGNL1Q0VF96 ANKDD1B-204ENST00000601380 2569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
CGNL1Q0VF96 MAZ-212ENST00000568282 1593 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
CGNL1Q0VF96 AC069544.2-201ENST00000640019 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
CGNL1Q0VF96 RBAK-202ENST00000396912 6551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
CGNL1Q0VF96 LAMP1-201ENST00000332556 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
CGNL1Q0VF96 NOTCH2NL-204ENST00000579793 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
CGNL1Q0VF96 C6orf15-201ENST00000259870 1140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
CGNL1Q0VF96 S100A3-201ENST00000368712 579 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.73■■□□□ 1.55
CGNL1Q0VF96 MRPS15-201ENST00000373116 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
CGNL1Q0VF96 AC009154.2-201ENST00000621177 724 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
CGNL1Q0VF96 AL513523.2-201ENST00000633218 660 ntTSL 3 BASIC24.73■■□□□ 1.55
CGNL1Q0VF96 AC004408.2-201ENST00000623613 2777 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
CGNL1Q0VF96 THOP1-205ENST00000586677 1872 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
CGNL1Q0VF96 KRT8P10-201ENST00000450021 1447 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
CGNL1Q0VF96 IFIH1-202ENST00000421365 1617 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
CGNL1Q0VF96 GAS2L1P2-202ENST00000442849 2262 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
CGNL1Q0VF96 LRCH3-207ENST00000441090 2034 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
CGNL1Q0VF96 KLF16-201ENST00000250916 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
CGNL1Q0VF96 TOP1MT-218ENST00000523676 1982 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
CGNL1Q0VF96 NDOR1-203ENST00000427047 2315 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
CGNL1Q0VF96 GCGR-202ENST00000570996 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
CGNL1Q0VF96 UBE2K-201ENST00000261427 5245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
CGNL1Q0VF96 KLK12-201ENST00000250351 882 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
CGNL1Q0VF96 ANKRD37-201ENST00000335174 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
CGNL1Q0VF96 GNB1L-203ENST00000405009 1076 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
CGNL1Q0VF96 AC008610.1-201ENST00000504573 393 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
CGNL1Q0VF96 AC011840.4-201ENST00000578471 627 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
CGNL1Q0VF96 C19orf25-204ENST00000586564 1265 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.72■■□□□ 1.55
CGNL1Q0VF96 RTBDN-213ENST00000592204 1024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
CGNL1Q0VF96 HSP90B1-211ENST00000640977 1127 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
CGNL1Q0VF96 COX20-203ENST00000411948 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
CGNL1Q0VF96 FAM49B-214ENST00000519540 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
CGNL1Q0VF96 C6orf118-201ENST00000230301 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
CGNL1Q0VF96 EHBP1-209ENST00000431489 5076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
CGNL1Q0VF96 ABCB9-202ENST00000344275 2394 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
CGNL1Q0VF96 HIBADH-201ENST00000265395 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
CGNL1Q0VF96 NKX1-2-201ENST00000451024 3364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
CGNL1Q0VF96 PCDHB2-202ENST00000622947 2231 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
CGNL1Q0VF96 PCOLCE-AS1-201ENST00000442166 2537 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
CGNL1Q0VF96 GALNT8-202ENST00000433855 5977 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
CGNL1Q0VF96 ORAI2-204ENST00000473939 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
CGNL1Q0VF96 STX8-201ENST00000306357 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
CGNL1Q0VF96 MEAF6-205ENST00000448519 666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
CGNL1Q0VF96 CDV3-207ENST00000508481 661 ntTSL 3 BASIC24.71■■□□□ 1.55
CGNL1Q0VF96 CCDC61-201ENST00000536603 1282 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
CGNL1Q0VF96 ABR-204ENST00000543210 1049 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
CGNL1Q0VF96 AL512357.1-201ENST00000557687 518 ntTSL 4 BASIC24.71■■□□□ 1.55
CGNL1Q0VF96 ABR-217ENST00000572441 563 ntTSL 4 BASIC24.71■■□□□ 1.55
CGNL1Q0VF96 AC007220.1-201ENST00000572466 1055 ntTSL 3 BASIC24.71■■□□□ 1.55
CGNL1Q0VF96 AC022150.1-201ENST00000599222 640 ntTSL 3 BASIC24.71■■□□□ 1.55
CGNL1Q0VF96 MIMT1-202ENST00000599641 1290 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
CGNL1Q0VF96 IFNL4P1-201ENST00000607083 540 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
CGNL1Q0VF96 MAP3K21-203ENST00000366624 5809 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
CGNL1Q0VF96 RPL32-202ENST00000396953 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
CGNL1Q0VF96 TTYH3-201ENST00000258796 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
CGNL1Q0VF96 TWF1-201ENST00000395510 3045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
CGNL1Q0VF96 LARGE2-208ENST00000531526 2528 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
CGNL1Q0VF96 RETREG2-203ENST00000430297 4618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
CGNL1Q0VF96 DYNLL1-209ENST00000550845 1376 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
CGNL1Q0VF96 FBLN7-205ENST00000409903 1989 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
CGNL1Q0VF96 BEX4-201ENST00000372691 1066 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
CGNL1Q0VF96 SIGIRR-202ENST00000397632 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
CGNL1Q0VF96 LINC02247-201ENST00000417135 743 ntTSL 3 BASIC24.7■■□□□ 1.54
CGNL1Q0VF96 AKR7L-201ENST00000420396 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
CGNL1Q0VF96 RPP14-206ENST00000466547 805 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.7■■□□□ 1.54
CGNL1Q0VF96 AC068472.1-201ENST00000474589 881 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
CGNL1Q0VF96 LINC02199-203ENST00000510229 496 ntTSL 3 BASIC24.7■■□□□ 1.54
CGNL1Q0VF96 VASH1-204ENST00000554743 1096 ntTSL 3 BASIC24.7■■□□□ 1.54
CGNL1Q0VF96 SRSF1-209ENST00000585096 568 ntTSL 4 BASIC24.7■■□□□ 1.54
CGNL1Q0VF96 SLC1A6-210ENST00000600144 1735 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
CGNL1Q0VF96 P2RY6-212ENST00000618468 2431 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.7■■□□□ 1.54
CGNL1Q0VF96 ZBTB48-202ENST00000377674 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
CGNL1Q0VF96 WIZP1-201ENST00000531444 2299 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
CGNL1Q0VF96 MVK-201ENST00000228510 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
CGNL1Q0VF96 CD19-202ENST00000538922 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
CGNL1Q0VF96 ZCCHC17-205ENST00000615916 1652 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
CGNL1Q0VF96 NSUN5P1-202ENST00000421140 1535 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
CGNL1Q0VF96 NSUN5P2-203ENST00000457352 1529 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
CGNL1Q0VF96 CSF3-206ENST00000577675 1360 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
CGNL1Q0VF96 FYTTD1-205ENST00000424384 1758 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
CGNL1Q0VF96 GAS7-205ENST00000542249 1799 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
CGNL1Q0VF96 TMED3-201ENST00000299705 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
CGNL1Q0VF96 POLD4-205ENST00000529704 1486 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
CGNL1Q0VF96 IDUA-201ENST00000247933 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
CGNL1Q0VF96 TJP1-208ENST00000495972 2890 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
CGNL1Q0VF96 AK3-202ENST00000381809 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
CGNL1Q0VF96 CIDEB-202ENST00000336557 2409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
CGNL1Q0VF96 ZNF114-206ENST00000600687 1742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28 ms