Protein–RNA interactions for Protein: Q00444

HOXC5, Homeobox protein Hox-C5, humanhuman

Predictions only

Length 222 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXC5Q00444 ADCY3-201ENST00000260600 5050 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
HOXC5Q00444 KCTD20-210ENST00000536244 5345 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
HOXC5Q00444 CHRNA4-201ENST00000370263 5577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
HOXC5Q00444 CIRBP-202ENST00000413636 1606 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
HOXC5Q00444 PEPD-203ENST00000436370 1638 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
HOXC5Q00444 POR-209ENST00000439269 1858 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
HOXC5Q00444 SIGIRR-220ENST00000531205 1649 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
HOXC5Q00444 KLHL33-202ENST00000636854 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
HOXC5Q00444 CDC25A-201ENST00000302506 3783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
HOXC5Q00444 SMG5-201ENST00000361813 4559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
HOXC5Q00444 NCAN-201ENST00000252575 6387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
HOXC5Q00444 TMIGD2-201ENST00000301272 1262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
HOXC5Q00444 COX5A-201ENST00000322347 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
HOXC5Q00444 RHOC-203ENST00000369632 1026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.93■□□□□ 0.3
HOXC5Q00444 OOEP-AS1-201ENST00000445350 463 ntTSL 3 BASIC16.93■□□□□ 0.3
HOXC5Q00444 TMEM185A-204ENST00000507237 903 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
HOXC5Q00444 C12orf65-202ENST00000366329 1901 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
HOXC5Q00444 TBC1D3I-202ENST00000618620 1900 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
HOXC5Q00444 STRA6-209ENST00000563965 2565 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
HOXC5Q00444 AC127496.1-202ENST00000573602 2091 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
HOXC5Q00444 PRDM5-201ENST00000264808 5330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
HOXC5Q00444 ZBTB4-201ENST00000311403 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
HOXC5Q00444 TP73-AS1-203ENST00000423764 2875 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
HOXC5Q00444 MRPS7-204ENST00000579761 1717 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
HOXC5Q00444 ACSS2-201ENST00000253382 2925 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
HOXC5Q00444 SLCO4A1-202ENST00000370507 2665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
HOXC5Q00444 WBP2-219ENST00000626827 1867 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
HOXC5Q00444 TMPRSS12-201ENST00000398458 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
HOXC5Q00444 ENDOV-225ENST00000522751 1475 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
HOXC5Q00444 ATRIP-203ENST00000357105 2403 ntTSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
HOXC5Q00444 RNF166-203ENST00000541206 2419 ntTSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
HOXC5Q00444 GLCCI1-201ENST00000223145 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
HOXC5Q00444 KIFC3-203ENST00000445690 3379 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
HOXC5Q00444 TFEB-206ENST00000403298 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
HOXC5Q00444 ESYT2-206ENST00000613624 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
HOXC5Q00444 SUFU-201ENST00000369899 1839 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
HOXC5Q00444 MBD1-208ENST00000398493 1845 ntTSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
HOXC5Q00444 HDAC11-203ENST00000402271 1018 ntTSL 3 BASIC16.92■□□□□ 0.3
HOXC5Q00444 AC012618.3-203ENST00000426044 917 ntTSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
HOXC5Q00444 BX322234.1-201ENST00000444188 980 ntTSL 3 BASIC16.92■□□□□ 0.3
HOXC5Q00444 FITM1-202ENST00000559294 800 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
HOXC5Q00444 AL353719.1-201ENST00000566847 864 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
HOXC5Q00444 ARHGDIA-207ENST00000580685 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
HOXC5Q00444 UBALD1-209ENST00000591897 1275 ntTSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
HOXC5Q00444 C16orf74-202ENST00000602583 1237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
HOXC5Q00444 FFAR4-203ENST00000604414 1142 ntTSL 3 BASIC16.92■□□□□ 0.3
HOXC5Q00444 ANKRD54-211ENST00000609454 825 ntTSL 3 BASIC16.92■□□□□ 0.3
HOXC5Q00444 SYT8-202ENST00000381968 1424 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
HOXC5Q00444 ASCL5-202ENST00000458416 1420 ntAPPRIS P1 BASIC16.92■□□□□ 0.3
HOXC5Q00444 TUBA3C-201ENST00000400113 1551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
HOXC5Q00444 CD19-206ENST00000567541 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
HOXC5Q00444 CCT7-215ENST00000539919 2031 ntTSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
HOXC5Q00444 HGFAC-201ENST00000382774 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
HOXC5Q00444 GSDMD-206ENST00000526406 2496 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
HOXC5Q00444 ATXN7-210ENST00000487717 3683 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
HOXC5Q00444 FAM50B-201ENST00000380272 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
HOXC5Q00444 EIF5-201ENST00000216554 5945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
HOXC5Q00444 ZNF133-211ENST00000538547 2245 ntTSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
HOXC5Q00444 SIRT1-201ENST00000212015 4094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
HOXC5Q00444 ZNF500-202ENST00000545009 2440 ntTSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
HOXC5Q00444 SPATS2L-218ENST00000451764 2250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
HOXC5Q00444 TPD52L1-202ENST00000368388 2147 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
HOXC5Q00444 GRB7-202ENST00000394204 1667 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
HOXC5Q00444 RENBP-202ENST00000393700 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
HOXC5Q00444 ANKRD6-201ENST00000339746 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
HOXC5Q00444 ANKIB1-201ENST00000265742 6081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
HOXC5Q00444 IRAK3-202ENST00000457197 1853 ntTSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
HOXC5Q00444 HDAC10-201ENST00000216271 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
HOXC5Q00444 SLC22A4-201ENST00000200652 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
HOXC5Q00444 INGX-201ENST00000359239 846 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
HOXC5Q00444 TSTD1-202ENST00000368023 574 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
HOXC5Q00444 SLC25A1P2-201ENST00000430693 912 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
HOXC5Q00444 AL139246.2-201ENST00000456687 1297 ntTSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
HOXC5Q00444 KCNIP3-205ENST00000468529 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
HOXC5Q00444 CR769767.2-201ENST00000622735 460 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
HOXC5Q00444 AP006294.2-201ENST00000641667 209 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
HOXC5Q00444 MCOLN1-201ENST00000264079 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
HOXC5Q00444 AC008764.6-201ENST00000595909 2069 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
HOXC5Q00444 ATRN-201ENST00000262919 8633 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
HOXC5Q00444 POLR1D-220ENST00000637071 1943 ntTSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
HOXC5Q00444 FBXL17-201ENST00000359660 4510 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
HOXC5Q00444 HOTAIR-201ENST00000424518 2421 ntTSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
HOXC5Q00444 CNOT6-202ENST00000393356 6303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
HOXC5Q00444 SLBP-201ENST00000318386 1635 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.91■□□□□ 0.3
HOXC5Q00444 RELA-226ENST00000612991 2266 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
HOXC5Q00444 SIDT2-217ENST00000532062 2143 ntTSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
HOXC5Q00444 GPS1-201ENST00000306823 1842 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
HOXC5Q00444 SMC4-201ENST00000344722 5356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
HOXC5Q00444 ARHGEF19-201ENST00000270747 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
HOXC5Q00444 COL16A1-203ENST00000373672 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
HOXC5Q00444 POLI-207ENST00000579434 2705 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
HOXC5Q00444 PHF20L1-209ENST00000395386 6237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
HOXC5Q00444 FIBIN-201ENST00000318627 1938 ntAPPRIS P1 BASIC16.9■□□□□ 0.3
HOXC5Q00444 UROS-202ENST00000368778 1556 ntTSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
HOXC5Q00444 C19orf57-208ENST00000591586 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
HOXC5Q00444 GIT1-203ENST00000394869 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
HOXC5Q00444 AC060780.1-201ENST00000635600 1782 ntTSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
HOXC5Q00444 AL512380.2-201ENST00000637901 1780 ntTSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
HOXC5Q00444 KRT8P9-201ENST00000558927 1449 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
HOXC5Q00444 AC092338.2-201ENST00000568827 1415 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.5 ms