Protein–RNA interactions for Protein: P63261

ACTG1, Actin, cytoplasmic 2, humanhuman

Predictions only

Length 375 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACTG1P63261 FBXO32-202ENST00000443022 1227 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ACTG1P63261 AC035140.1-201ENST00000507957 493 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
ACTG1P63261 ZNF706-204ENST00000518336 501 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16■□□□□ 0.15
ACTG1P63261 SLC52A2-205ENST00000526752 710 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
ACTG1P63261 AC006942.1-201ENST00000600669 520 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
ACTG1P63261 AL121829.2-201ENST00000620908 328 ntBASIC16■□□□□ 0.15
ACTG1P63261 GLDC-219ENST00000640208 420 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
ACTG1P63261 FAM234A-203ENST00000399932 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ACTG1P63261 SLC22A4-201ENST00000200652 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ACTG1P63261 PTN-201ENST00000348225 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ACTG1P63261 PLEKHG4-205ENST00000450733 4480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ACTG1P63261 P2RY6-202ENST00000393590 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ACTG1P63261 WDR25-202ENST00000402312 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
ACTG1P63261 AC139713.2-201ENST00000641328 2723 ntBASIC16■□□□□ 0.15
ACTG1P63261 SCRIB-203ENST00000377533 5108 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ACTG1P63261 NARFL-201ENST00000251588 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ACTG1P63261 ADAMTS16-203ENST00000511368 2682 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ACTG1P63261 CDH22-203ENST00000537909 3902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
ACTG1P63261 CDK11A-203ENST00000357760 2446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ACTG1P63261 CDK11A-204ENST00000358779 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ACTG1P63261 CDK11A-206ENST00000378638 2429 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
ACTG1P63261 CDK11A-208ENST00000404249 2449 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ACTG1P63261 KHNYN-206ENST00000556842 2443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
ACTG1P63261 FAM46A-201ENST00000320172 5609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ACTG1P63261 KCTD20-202ENST00000373731 5619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ACTG1P63261 KRT18P22-201ENST00000402024 1347 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
ACTG1P63261 GOLGA2P10-204ENST00000618004 1349 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ACTG1P63261 TIMP4-201ENST00000287814 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ACTG1P63261 OGG1-201ENST00000302003 1655 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ACTG1P63261 POLR1D-203ENST00000399697 2036 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ACTG1P63261 PTPN6-204ENST00000456013 2389 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ACTG1P63261 UCHL5-206ENST00000367455 5327 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ACTG1P63261 FAM208B-201ENST00000328090 8626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ACTG1P63261 FAM129C-202ENST00000335393 2508 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ACTG1P63261 PNMA6E-201ENST00000445091 2192 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
ACTG1P63261 MRGPRG-201ENST00000332314 870 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
ACTG1P63261 NCF1B-202ENST00000432102 930 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
ACTG1P63261 HES2-206ENST00000489730 730 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
ACTG1P63261 AC093752.1-201ENST00000511950 605 ntTSL 4 BASIC15.99■□□□□ 0.15
ACTG1P63261 EXOSC4-202ENST00000525936 606 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
ACTG1P63261 AC003005.1-201ENST00000601674 582 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
ACTG1P63261 SMIM20-205ENST00000614775 1190 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
ACTG1P63261 ST20-MTHFS-203ENST00000615374 679 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
ACTG1P63261 Six3os1_6.1-201ENST00000620790 196 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
ACTG1P63261 ENC1-207ENST00000618628 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
ACTG1P63261 CSAD-209ENST00000453446 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ACTG1P63261 DMRTA2-201ENST00000404795 3137 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
ACTG1P63261 MAP3K6-201ENST00000357582 4136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ACTG1P63261 CCDC92-201ENST00000238156 2787 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ACTG1P63261 HAUS4-204ENST00000490506 1447 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ACTG1P63261 ALAS2-203ENST00000396198 1936 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
ACTG1P63261 C9orf66-201ENST00000382387 2918 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
ACTG1P63261 CEP120-201ENST00000306467 4900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
ACTG1P63261 PIP4K2C-202ENST00000422156 1558 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
ACTG1P63261 TMEM45B-201ENST00000281441 2234 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
ACTG1P63261 MTHFD2L-203ENST00000395759 2354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
ACTG1P63261 THOP1-205ENST00000586677 1872 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
ACTG1P63261 C14orf180-202ENST00000410013 2009 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ACTG1P63261 IGFBP7-AS1-201ENST00000499667 1389 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ACTG1P63261 TH-202ENST00000333684 1535 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ACTG1P63261 TMEM175-220ENST00000515740 1514 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
ACTG1P63261 TMPRSS5-209ENST00000544634 1524 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
ACTG1P63261 LRCH1-201ENST00000311191 4710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ACTG1P63261 WNK2-201ENST00000297954 7138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ACTG1P63261 DTX2-206ENST00000430490 2623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
ACTG1P63261 KLHDC4-203ENST00000347925 1821 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
ACTG1P63261 MBD1-208ENST00000398493 1845 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
ACTG1P63261 CELF2-217ENST00000638035 1849 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
ACTG1P63261 POC1A-202ENST00000394970 1999 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
ACTG1P63261 ETNK2-203ENST00000367202 2434 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
ACTG1P63261 OLFM1-201ENST00000252854 2591 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
ACTG1P63261 IL6R-208ENST00000622330 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
ACTG1P63261 CDK10-202ENST00000353379 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
ACTG1P63261 EFCAB14-201ENST00000371933 5767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
ACTG1P63261 NOL4-211ENST00000589544 2221 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
ACTG1P63261 PPP3CA-203ENST00000394854 4685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
ACTG1P63261 GPC2-201ENST00000292377 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
ACTG1P63261 ERO1A-201ENST00000395686 5285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
ACTG1P63261 BIK-201ENST00000216115 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
ACTG1P63261 C18orf8-201ENST00000269221 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
ACTG1P63261 LMNA-207ENST00000368301 2461 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
ACTG1P63261 RAMP1-204ENST00000409726 734 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
ACTG1P63261 AL954642.1-201ENST00000428088 538 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
ACTG1P63261 UNC5B-AS1-201ENST00000447119 647 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
ACTG1P63261 BABAM1-202ENST00000447614 930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
ACTG1P63261 LINC00511-201ENST00000453722 1716 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
ACTG1P63261 AC098829.1-201ENST00000502344 630 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
ACTG1P63261 LEF1-AS1-203ENST00000507799 459 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
ACTG1P63261 NUDT16P1-203ENST00000513809 620 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
ACTG1P63261 CDKN3-209ENST00000556102 938 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
ACTG1P63261 MRPL4-204ENST00000588502 827 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
ACTG1P63261 ZNF114-206ENST00000600687 1742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
ACTG1P63261 CCDC28A-203ENST00000617445 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
ACTG1P63261 ARHGAP11A-201ENST00000361627 5898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
ACTG1P63261 NTRK2-206ENST00000376213 5560 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
ACTG1P63261 MOAP1-201ENST00000298894 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
ACTG1P63261 ERICH1-201ENST00000262109 1813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
ACTG1P63261 HEIH-201ENST00000623091 1652 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
ACTG1P63261 ZCWPW1-202ENST00000398027 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
ACTG1P63261 SUPT4H1-202ENST00000577396 1643 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.9 ms