Protein–RNA interactions for Protein: P54707

ATP12A, Potassium-transporting ATPase alpha chain 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,039 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP12AP54707 MROH1-202ENST00000423230 1712 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
ATP12AP54707 CYP2D7-201ENST00000358097 1655 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
ATP12AP54707 ENDOV-225ENST00000522751 1475 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
ATP12AP54707 KRT8P7-201ENST00000533003 1432 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
ATP12AP54707 CORO6-212ENST00000584969 1416 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
ATP12AP54707 TSPY1-201ENST00000423647 1171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
ATP12AP54707 KCTD7-202ENST00000443322 1160 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
ATP12AP54707 AL929554.1-201ENST00000568665 460 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
ATP12AP54707 FER1L4-210ENST00000615531 5998 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
ATP12AP54707 GNA13-201ENST00000439174 4922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
ATP12AP54707 TRA2A-211ENST00000538367 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
ATP12AP54707 HCLS1-201ENST00000314583 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
ATP12AP54707 CKMT1A-202ENST00000413453 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
ATP12AP54707 GPT-202ENST00000394955 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
ATP12AP54707 C6orf118-201ENST00000230301 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
ATP12AP54707 PCED1A-201ENST00000356872 1706 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
ATP12AP54707 RSPO4-201ENST00000217260 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
ATP12AP54707 DNAJC28-201ENST00000314399 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
ATP12AP54707 OGFOD2-205ENST00000454694 1488 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
ATP12AP54707 HOXB1-202ENST00000577092 1414 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
ATP12AP54707 SH3BP4-202ENST00000392011 5194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
ATP12AP54707 CAMK2D-201ENST00000296402 5820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
ATP12AP54707 MPC2-201ENST00000271373 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
ATP12AP54707 ILF2-202ENST00000368681 726 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
ATP12AP54707 LINC01534-202ENST00000433232 554 ntTSL 3 BASIC17.07■□□□□ 0.32
ATP12AP54707 REPIN1-210ENST00000482680 1029 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
ATP12AP54707 EBLN3P-205ENST00000629870 958 ntTSL 3 BASIC17.07■□□□□ 0.32
ATP12AP54707 SALRNA1-201ENST00000555871 2086 ntTSL 4 BASIC17.07■□□□□ 0.32
ATP12AP54707 BMPER-201ENST00000297161 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
ATP12AP54707 IVNS1ABP-202ENST00000367498 4199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
ATP12AP54707 ZNF281-201ENST00000294740 4891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
ATP12AP54707 MAP3K6-201ENST00000357582 4136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
ATP12AP54707 P2RX2-208ENST00000542301 1881 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
ATP12AP54707 CPT2-207ENST00000636867 2643 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
ATP12AP54707 RAP1GAP-204ENST00000374761 3318 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
ATP12AP54707 SLC9A6-208ENST00000636206 4711 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
ATP12AP54707 CHRAC1-201ENST00000220913 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
ATP12AP54707 AL139099.2-201ENST00000555043 2469 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
ATP12AP54707 MAFG-202ENST00000392366 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
ATP12AP54707 PDE9A-209ENST00000398227 1606 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
ATP12AP54707 PCDHA1-202ENST00000394633 2204 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
ATP12AP54707 SNHG10-201ENST00000500370 1531 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
ATP12AP54707 AGAP2-AS1-201ENST00000542466 1500 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
ATP12AP54707 PCDH7-206ENST00000543491 4457 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
ATP12AP54707 RBM7-201ENST00000375490 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
ATP12AP54707 HCK-202ENST00000375852 2082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
ATP12AP54707 RASSF7-205ENST00000454668 1450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
ATP12AP54707 NR4A1-203ENST00000394824 2639 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
ATP12AP54707 HOXC11-201ENST00000243082 2039 ntTSL 3 BASIC17.06■□□□□ 0.32
ATP12AP54707 FAM49B-214ENST00000519540 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
ATP12AP54707 SYT8-202ENST00000381968 1424 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
ATP12AP54707 KRT8P50-201ENST00000562022 1438 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
ATP12AP54707 NDN-201ENST00000331837 1931 ntAPPRIS P1 BASIC17.06■□□□□ 0.32
ATP12AP54707 DYNLL1-209ENST00000550845 1376 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
ATP12AP54707 TBC1D20-201ENST00000354200 4466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
ATP12AP54707 EDC3-214ENST00000568176 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
ATP12AP54707 AL133373.2-201ENST00000623187 2828 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
ATP12AP54707 HSCB-201ENST00000216027 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
ATP12AP54707 MPG-201ENST00000219431 1193 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC17.06■□□□□ 0.32
ATP12AP54707 UQCRQ-201ENST00000378665 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
ATP12AP54707 KRTAP5-3-201ENST00000399685 899 ntAPPRIS P1 BASIC17.06■□□□□ 0.32
ATP12AP54707 SDR39U1-202ENST00000538105 1041 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
ATP12AP54707 AC015712.4-203ENST00000559673 630 ntTSL 3 BASIC17.06■□□□□ 0.32
ATP12AP54707 AL512604.3-201ENST00000569583 964 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
ATP12AP54707 AC027796.4-201ENST00000575741 874 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
ATP12AP54707 ATP5D-207ENST00000591660 637 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.06■□□□□ 0.32
ATP12AP54707 FP565260.3-205ENST00000620481 816 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
ATP12AP54707 EFTUD1P1-204ENST00000560401 1798 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
ATP12AP54707 SYTL1-208ENST00000543823 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
ATP12AP54707 OSMR-202ENST00000502536 1740 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
ATP12AP54707 XYLT2-203ENST00000507602 2107 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
ATP12AP54707 SEMA6B-201ENST00000586582 3986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
ATP12AP54707 PPP1R7-207ENST00000407025 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
ATP12AP54707 PTPA-201ENST00000337738 2845 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
ATP12AP54707 ADAMTS16-201ENST00000274181 4979 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
ATP12AP54707 AP005717.1-201ENST00000500705 1899 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
ATP12AP54707 CDCP1-201ENST00000296129 6006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
ATP12AP54707 CARHSP1-219ENST00000618335 2972 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.05■□□□□ 0.32
ATP12AP54707 DMRT3-201ENST00000190165 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
ATP12AP54707 KCNIP4-205ENST00000382152 1767 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
ATP12AP54707 PPHLN1-213ENST00000549190 1777 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
ATP12AP54707 LINC01568-207ENST00000641790 1380 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
ATP12AP54707 PTTG1IP-204ENST00000445724 2497 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
ATP12AP54707 OR13J1-201ENST00000377981 1339 ntAPPRIS P1 BASIC17.05■□□□□ 0.32
ATP12AP54707 SCARB2-223ENST00000640640 4608 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
ATP12AP54707 CTSD-212ENST00000637815 2003 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
ATP12AP54707 FUOM-201ENST00000278025 709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
ATP12AP54707 CHCHD6-201ENST00000290913 1006 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
ATP12AP54707 NME1-202ENST00000336097 986 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
ATP12AP54707 NME1-203ENST00000393196 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
ATP12AP54707 HMGA1P5-201ENST00000412453 271 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
ATP12AP54707 LTB-210ENST00000429299 897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
ATP12AP54707 KRT18P23-201ENST00000435622 1283 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
ATP12AP54707 ECEL1P2-202ENST00000465689 757 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
ATP12AP54707 AC005606.2-201ENST00000564438 614 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
ATP12AP54707 C17orf62-230ENST00000583617 866 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
ATP12AP54707 RGP1-201ENST00000378078 7018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
ATP12AP54707 ACTG1-201ENST00000331925 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
ATP12AP54707 AP003774.1-201ENST00000316124 2340 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
ATP12AP54707 TAP1-201ENST00000354258 2959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.7 ms