Protein–RNA interactions for Protein: P53396

ACLY, ATP-citrate synthase, humanhuman

Predictions only

Length 1,101 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACLYP53396 NR1H2-201ENST00000253727 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
ACLYP53396 TOP1MT-218ENST00000523676 1982 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
ACLYP53396 MON1A-202ENST00000417270 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
ACLYP53396 PEPD-203ENST00000436370 1638 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
ACLYP53396 OPRK1-202ENST00000520287 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
ACLYP53396 CNNM4-201ENST00000377075 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
ACLYP53396 CTBP2-202ENST00000334808 2130 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
ACLYP53396 LCE1B-201ENST00000360090 1139 ntAPPRIS P1 BASIC20.1■□□□□ 0.81
ACLYP53396 DPM3-203ENST00000368400 409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
ACLYP53396 YBX2P1-201ENST00000394192 760 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
ACLYP53396 RAB42-202ENST00000465518 857 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
ACLYP53396 CRTC1-204ENST00000601916 1834 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
ACLYP53396 KCNJ12-202ENST00000583088 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
ACLYP53396 P2RY6-204ENST00000393592 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
ACLYP53396 VEGFA-206ENST00000372077 2834 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
ACLYP53396 AQP5-201ENST00000293599 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
ACLYP53396 COL15A1-201ENST00000375001 5496 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
ACLYP53396 TOR1B-201ENST00000259339 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
ACLYP53396 MYEOV-202ENST00000441339 1996 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
ACLYP53396 SLC17A7-201ENST00000221485 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
ACLYP53396 CHMP6-201ENST00000325167 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
ACLYP53396 OSM-201ENST00000215781 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
ACLYP53396 ATF5-201ENST00000423777 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
ACLYP53396 ISCU-205ENST00000535729 1330 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
ACLYP53396 PEX6-201ENST00000244546 2696 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
ACLYP53396 FIS1-203ENST00000442303 631 ntTSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
ACLYP53396 AC112482.1-201ENST00000492080 688 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
ACLYP53396 NKAPP1-205ENST00000585790 367 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
ACLYP53396 AP001160.2-201ENST00000596071 487 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
ACLYP53396 MTDHP4-201ENST00000600287 670 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
ACLYP53396 ATOH8-201ENST00000306279 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
ACLYP53396 PRELID3B-201ENST00000355937 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
ACLYP53396 HABP4-201ENST00000375249 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
ACLYP53396 BTG3-202ENST00000348354 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
ACLYP53396 APOA4-201ENST00000357780 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
ACLYP53396 PTGIR-201ENST00000291294 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
ACLYP53396 PTN-201ENST00000348225 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
ACLYP53396 SCRT1-201ENST00000569446 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
ACLYP53396 ESR2-204ENST00000353772 2454 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
ACLYP53396 SPNS1-203ENST00000334536 2027 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
ACLYP53396 FOXP3-206ENST00000557224 1371 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
ACLYP53396 CNNM1-201ENST00000356713 5959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
ACLYP53396 AC063977.6-201ENST00000600074 1763 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
ACLYP53396 GLYCTK-202ENST00000436784 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
ACLYP53396 SAMD11-213ENST00000618181 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
ACLYP53396 AGTR1-209ENST00000497524 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
ACLYP53396 EML2-220ENST00000589876 2364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
ACLYP53396 AD000671.2-201ENST00000589807 1925 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
ACLYP53396 HSPA1A-202ENST00000608703 1909 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
ACLYP53396 KMT5B-203ENST00000401547 2666 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
ACLYP53396 AMDHD1-201ENST00000266736 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
ACLYP53396 IMPDH1-214ENST00000496200 2283 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
ACLYP53396 AC009133.6-201ENST00000609618 2252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
ACLYP53396 SOD2-201ENST00000337404 991 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
ACLYP53396 CENPM-204ENST00000402420 688 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
ACLYP53396 KRT18P65-201ENST00000439811 1286 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
ACLYP53396 AP000344.1-201ENST00000454268 641 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
ACLYP53396 AP000344.1-202ENST00000457193 586 ntTSL 4 BASIC20.08■□□□□ 0.81
ACLYP53396 AC105339.3-201ENST00000560043 636 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
ACLYP53396 AC040169.1-201ENST00000565382 521 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
ACLYP53396 BLOC1S6-214ENST00000567461 1052 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
ACLYP53396 NAA60-217ENST00000572942 1089 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
ACLYP53396 MIR3687-2-201ENST00000577708 61 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
ACLYP53396 ECSIT-207ENST00000588998 818 ntTSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.81
ACLYP53396 FUT6-212ENST00000592563 1095 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
ACLYP53396 HEXIM2-207ENST00000592695 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
ACLYP53396 AC005256.1-202ENST00000592934 415 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
ACLYP53396 MIR3687-1-201ENST00000614492 61 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
ACLYP53396 ADK-206ENST00000541550 2222 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.8
ACLYP53396 POLR2M-206ENST00000494490 1648 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
ACLYP53396 LEXM-201ENST00000358193 1777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
ACLYP53396 NSUN5P2-201ENST00000388955 1789 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
ACLYP53396 EBF1-202ENST00000380654 2345 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
ACLYP53396 SDCBP2-204ENST00000381812 1550 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
ACLYP53396 SNAI3-AS1-205ENST00000568633 2096 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
ACLYP53396 GJB3-202ENST00000373366 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
ACLYP53396 NUMBL-207ENST00000598779 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
ACLYP53396 AKIRIN2-201ENST00000257787 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
ACLYP53396 TYMS-203ENST00000323274 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
ACLYP53396 TCAIM-203ENST00000396078 2178 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
ACLYP53396 DPH6-AS1-201ENST00000501169 1477 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
ACLYP53396 ZNF768-202ENST00000562803 1999 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.07■□□□□ 0.8
ACLYP53396 PAQR9-201ENST00000340634 2452 ntAPPRIS P1 BASIC20.07■□□□□ 0.8
ACLYP53396 ELOF1-201ENST00000252445 1019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
ACLYP53396 CTNS-203ENST00000399306 803 ntTSL 3 BASIC20.07■□□□□ 0.8
ACLYP53396 PMS2P2-201ENST00000425039 1128 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
ACLYP53396 ZNF295-AS1-202ENST00000429739 783 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
ACLYP53396 HMGN1P19-201ENST00000436976 333 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
ACLYP53396 AC097532.1-201ENST00000440802 322 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
ACLYP53396 DHDH-204ENST00000523250 634 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
ACLYP53396 UNC93B6-202ENST00000528242 690 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
ACLYP53396 VASH1-204ENST00000554743 1096 ntTSL 3 BASIC20.07■□□□□ 0.8
ACLYP53396 AC107918.4-202ENST00000641623 219 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
ACLYP53396 MAST2-201ENST00000361297 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
ACLYP53396 TRIM61-201ENST00000329314 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
ACLYP53396 CAMK1D-201ENST00000378845 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
ACLYP53396 CD177-203ENST00000618265 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
ACLYP53396 LAMC3-202ENST00000361069 6133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
ACLYP53396 AC011840.1-202ENST00000436477 1351 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
ACLYP53396 TMEM106C-202ENST00000429772 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.9 ms