Protein–RNA interactions for Protein: P52798

EFNA4, Ephrin-A4, humanhuman

Predictions only

Length 201 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EFNA4P52798 MEPCE-202ENST00000414441 2261 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
EFNA4P52798 SLC3A2-206ENST00000535296 2084 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
EFNA4P52798 TRIM7-205ENST00000422067 1954 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
EFNA4P52798 AC013268.5-201ENST00000454928 1959 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
EFNA4P52798 RMND5B-201ENST00000313386 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
EFNA4P52798 MTERF2-202ENST00000392830 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
EFNA4P52798 JKAMP-201ENST00000261247 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
EFNA4P52798 MROH1-202ENST00000423230 1712 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
EFNA4P52798 CA9-201ENST00000378357 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
EFNA4P52798 NAF1-202ENST00000422287 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
EFNA4P52798 MAIP1-202ENST00000392290 1386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
EFNA4P52798 SDR39U1-206ENST00000553930 1325 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
EFNA4P52798 HBQ1-201ENST00000199708 536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
EFNA4P52798 RNASEH2A-201ENST00000221486 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
EFNA4P52798 MIR202HG-201ENST00000300167 384 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
EFNA4P52798 VAMP5-201ENST00000306384 689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
EFNA4P52798 SSSCA1-201ENST00000309328 698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
EFNA4P52798 CCS-201ENST00000310190 942 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
EFNA4P52798 Metazoa_SRP.28-201ENST00000366402 260 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
EFNA4P52798 RPP38-203ENST00000378202 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
EFNA4P52798 CLDN7-202ENST00000397317 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
EFNA4P52798 THAP5-204ENST00000438865 868 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
EFNA4P52798 CT47A11-201ENST00000457020 1294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
EFNA4P52798 AC079776.4-201ENST00000511039 504 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
EFNA4P52798 PENK-208ENST00000523051 772 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
EFNA4P52798 AF238378.1-201ENST00000526806 358 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
EFNA4P52798 IRF8-202ENST00000562492 946 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
EFNA4P52798 AC087289.1-201ENST00000586808 890 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
EFNA4P52798 ERCC2-203ENST00000391944 2334 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
EFNA4P52798 ANKRD13D-201ENST00000308440 2219 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
EFNA4P52798 KLF13-201ENST00000307145 6825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
EFNA4P52798 HOXC10-201ENST00000303460 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
EFNA4P52798 TMEM237-213ENST00000621467 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
EFNA4P52798 NARF-204ENST00000390006 1766 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
EFNA4P52798 ZSWIM5-201ENST00000359600 5819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
EFNA4P52798 MAZ-212ENST00000568282 1593 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
EFNA4P52798 FOXC1-201ENST00000380874 3926 ntAPPRIS P1 BASIC15.28■□□□□ 0.04
EFNA4P52798 IDH3G-201ENST00000217901 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
EFNA4P52798 BTBD11-201ENST00000280758 5767 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
EFNA4P52798 DENND1A-203ENST00000373624 5010 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
EFNA4P52798 KANSL1L-203ENST00000418791 3562 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
EFNA4P52798 TNPO2-203ENST00000450764 4993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
EFNA4P52798 IDS-202ENST00000370441 1399 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
EFNA4P52798 SIGLEC14-201ENST00000360844 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
EFNA4P52798 USP25-204ENST00000400183 5341 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
EFNA4P52798 BBC3-201ENST00000300880 1347 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
EFNA4P52798 USP48-201ENST00000308271 4595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
EFNA4P52798 TRIM58-201ENST00000366481 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
EFNA4P52798 AL049795.1-201ENST00000373604 642 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
EFNA4P52798 RAB24-204ENST00000393611 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
EFNA4P52798 TMEM213-202ENST00000413208 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
EFNA4P52798 DANCR-204ENST00000444958 709 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
EFNA4P52798 ZNF655-218ENST00000454654 571 ntTSL 4 BASIC15.28■□□□□ 0.04
EFNA4P52798 HOXB-AS2-201ENST00000464382 845 ntTSL 4 BASIC15.28■□□□□ 0.04
EFNA4P52798 SMAD3-210ENST00000559092 584 ntTSL 4 BASIC15.28■□□□□ 0.04
EFNA4P52798 TYROBP-205ENST00000585901 620 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
EFNA4P52798 HNF4A-208ENST00000609795 1192 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
EFNA4P52798 CDCA4-201ENST00000336219 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
EFNA4P52798 SEPT8-216ENST00000620483 4335 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
EFNA4P52798 CRLF3-201ENST00000324238 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
EFNA4P52798 EVL-202ENST00000402714 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
EFNA4P52798 SLC31A2-201ENST00000259392 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
EFNA4P52798 SLC22A18-203ENST00000380574 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
EFNA4P52798 METTL21A-208ENST00000448007 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
EFNA4P52798 MMD2-201ENST00000401401 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
EFNA4P52798 CLDN6-202ENST00000396925 1739 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
EFNA4P52798 MRGPRF-201ENST00000309099 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
EFNA4P52798 CYGB-201ENST00000293230 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
EFNA4P52798 IFIH1-202ENST00000421365 1617 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
EFNA4P52798 LAYN-203ENST00000436913 2590 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
EFNA4P52798 GLB1-202ENST00000307377 2018 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
EFNA4P52798 OGFOD2-207ENST00000536150 1956 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
EFNA4P52798 CRTC1-203ENST00000594658 2384 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
EFNA4P52798 SLC25A20-201ENST00000319017 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
EFNA4P52798 LURAP1-201ENST00000371980 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
EFNA4P52798 TM2D3-201ENST00000333202 1381 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
EFNA4P52798 FAM3A-201ENST00000322269 1815 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
EFNA4P52798 WDR88-202ENST00000361680 1835 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
EFNA4P52798 UBE2I-207ENST00000406620 1842 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
EFNA4P52798 OARD1-202ENST00000424266 1337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
EFNA4P52798 NDUFB9-201ENST00000276689 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
EFNA4P52798 HINT1-201ENST00000304043 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
EFNA4P52798 RWDD3-202ENST00000370202 1235 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
EFNA4P52798 C1QC-201ENST00000374637 1089 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
EFNA4P52798 SERF1B-202ENST00000380751 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
EFNA4P52798 MRPL3P1-201ENST00000400109 1033 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
EFNA4P52798 AL022342.1-201ENST00000400363 863 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
EFNA4P52798 PACRGL-218ENST00000507634 1142 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
EFNA4P52798 AC009533.2-201ENST00000543664 586 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
EFNA4P52798 AL162171.1-201ENST00000556328 718 ntTSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
EFNA4P52798 AC016876.1-204ENST00000573187 679 ntTSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
EFNA4P52798 AC020934.1-201ENST00000588469 739 ntTSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
EFNA4P52798 AC138430.1-201ENST00000586064 5409 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.03
EFNA4P52798 NECTIN3-206ENST00000485303 3664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
EFNA4P52798 SEMA3D-202ENST00000444867 1605 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
EFNA4P52798 ALKBH5-203ENST00000541285 1605 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
EFNA4P52798 FAM46B-201ENST00000289166 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
EFNA4P52798 PCGF6-201ENST00000337211 1950 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
EFNA4P52798 STYXL1-208ENST00000451157 1570 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
EFNA4P52798 GOLGA3-203ENST00000456883 5496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.2 ms