Protein–RNA interactions for Protein: P50461

CSRP3, Cysteine and glycine-rich protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 194 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSRP3P50461 P2RY6-202ENST00000393590 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CSRP3P50461 MTHFD2L-203ENST00000395759 2354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
CSRP3P50461 TLX1-201ENST00000370196 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CSRP3P50461 KDM1A-202ENST00000400181 3059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CSRP3P50461 AC099343.3-201ENST00000605834 2503 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
CSRP3P50461 PLD3-205ENST00000409419 1966 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
CSRP3P50461 RBFA-202ENST00000306735 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CSRP3P50461 SATB2-203ENST00000428695 2135 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CSRP3P50461 FXYD6-204ENST00000526014 2171 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CSRP3P50461 RABEP2-202ENST00000358201 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CSRP3P50461 NEURL4-203ENST00000570460 4890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
CSRP3P50461 ZNF589-203ENST00000427617 1677 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
CSRP3P50461 ZNF131-206ENST00000505606 3209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
CSRP3P50461 RPN2-201ENST00000237530 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CSRP3P50461 GOLGA2P7-201ENST00000316967 2525 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
CSRP3P50461 STAMBPL1-203ENST00000371926 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CSRP3P50461 GATA2-203ENST00000487848 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CSRP3P50461 CDHR1-201ENST00000332904 2694 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CSRP3P50461 MARK2-207ENST00000502399 2885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
CSRP3P50461 C9orf66-201ENST00000382387 2918 ntAPPRIS P1 BASIC18.12■□□□□ 0.49
CSRP3P50461 DCTN3-201ENST00000259632 808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CSRP3P50461 ISCA1-202ENST00000326094 1264 ntTSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
CSRP3P50461 MRPL54-201ENST00000330133 626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CSRP3P50461 LCE3C-201ENST00000333881 425 ntAPPRIS P1 BASIC18.12■□□□□ 0.49
CSRP3P50461 INSIG1-202ENST00000342407 1127 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
CSRP3P50461 AFG3L1P-203ENST00000418696 2965 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
CSRP3P50461 AL445685.1-201ENST00000425802 762 ntTSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
CSRP3P50461 AL445645.1-201ENST00000451318 1019 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
CSRP3P50461 TMEM185A-204ENST00000507237 903 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
CSRP3P50461 ANKRD34C-AS1-201ENST00000557790 594 ntTSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
CSRP3P50461 CYGB-204ENST00000589342 815 ntTSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
CSRP3P50461 T-201ENST00000296946 2436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
CSRP3P50461 UBAP1-203ENST00000379186 2524 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
CSRP3P50461 CCDC88C-203ENST00000389856 1641 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CSRP3P50461 TRIM8-201ENST00000302424 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CSRP3P50461 ARNT-212ENST00000515192 2892 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CSRP3P50461 TRAF4-201ENST00000262395 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CSRP3P50461 PTGES-201ENST00000340607 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CSRP3P50461 AL512380.2-201ENST00000637901 1780 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
CSRP3P50461 GOLGA6L2-204ENST00000567107 3030 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
CSRP3P50461 CFAP46-201ENST00000368585 1825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
CSRP3P50461 PDE9A-206ENST00000380328 1875 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CSRP3P50461 CHTOP-205ENST00000403433 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
CSRP3P50461 MFSD2A-203ENST00000420632 1914 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
CSRP3P50461 C18orf8-208ENST00000590868 2002 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
CSRP3P50461 CLPB-212ENST00000543042 2133 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
CSRP3P50461 CISD2-201ENST00000273986 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
CSRP3P50461 PARP16-202ENST00000444347 2352 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
CSRP3P50461 MCM9-201ENST00000316068 2442 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
CSRP3P50461 SNX8-201ENST00000222990 4727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
CSRP3P50461 BCL2L10-201ENST00000260442 1249 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
CSRP3P50461 MPG-203ENST00000397817 1039 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
CSRP3P50461 MVB12A-204ENST00000528515 686 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
CSRP3P50461 EGLN1P1-201ENST00000531623 762 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
CSRP3P50461 MNT-208ENST00000575394 606 ntTSL 4 BASIC18.11■□□□□ 0.49
CSRP3P50461 GRAMD4P8-201ENST00000605465 1115 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
CSRP3P50461 GAS7-210ENST00000579158 1528 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
CSRP3P50461 IRF3-203ENST00000377139 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
CSRP3P50461 RAD23A-201ENST00000316856 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
CSRP3P50461 CD40-202ENST00000372285 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
CSRP3P50461 WDR59-202ENST00000536050 1752 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
CSRP3P50461 SIGLEC6-203ENST00000359982 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
CSRP3P50461 AL024508.2-201ENST00000607749 1894 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
CSRP3P50461 BPIFB4-201ENST00000375483 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
CSRP3P50461 SAR1B-208ENST00000507419 2287 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
CSRP3P50461 PCDHA8-201ENST00000378123 2616 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
CSRP3P50461 PIGQ-203ENST00000321878 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
CSRP3P50461 FBRS-202ENST00000356166 5200 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
CSRP3P50461 DENND6A-201ENST00000311128 4655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
CSRP3P50461 B4GALT2-202ENST00000356836 2629 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
CSRP3P50461 HECTD2-203ENST00000371681 2175 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
CSRP3P50461 GABRB2-206ENST00000520240 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
CSRP3P50461 KRT18P55-202ENST00000578578 1546 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
CSRP3P50461 TMEM110-MUSTN1-202ENST00000504329 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
CSRP3P50461 BBC3-201ENST00000300880 1347 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
CSRP3P50461 WFDC1-203ENST00000568638 1319 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
CSRP3P50461 MRPL52-201ENST00000311892 1042 ntTSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
CSRP3P50461 AGTRAP-201ENST00000314340 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
CSRP3P50461 SLX1A-202ENST00000345535 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
CSRP3P50461 SLX1B-202ENST00000351581 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
CSRP3P50461 TNNT3-206ENST00000381579 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
CSRP3P50461 AC007952.1-201ENST00000399087 553 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
CSRP3P50461 AC007952.2-202ENST00000399093 556 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
CSRP3P50461 KRT18P23-201ENST00000435622 1283 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
CSRP3P50461 AC007563.2-201ENST00000447289 552 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
CSRP3P50461 LY6E-210ENST00000521182 1079 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
CSRP3P50461 SLC39A2-203ENST00000554422 1259 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
CSRP3P50461 BVES-AS1-203ENST00000580511 853 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
CSRP3P50461 AC093458.2-201ENST00000623150 629 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
CSRP3P50461 AC106017.2-202ENST00000628484 536 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
CSRP3P50461 CCDC157-203ENST00000405659 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
CSRP3P50461 ANKRD6-204ENST00000447838 2968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
CSRP3P50461 CDK11A-203ENST00000357760 2446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
CSRP3P50461 CDK11A-204ENST00000358779 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
CSRP3P50461 CDK11A-206ENST00000378638 2429 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
CSRP3P50461 CDK11A-208ENST00000404249 2449 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
CSRP3P50461 TACSTD2-201ENST00000371225 2351 ntAPPRIS P1 BASIC18.1■□□□□ 0.49
CSRP3P50461 KIFC3-201ENST00000379655 3427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
CSRP3P50461 GINM1-201ENST00000367419 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
CSRP3P50461 AC005498.3-201ENST00000596587 2045 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.7 ms