Protein–RNA interactions for Protein: P43121

MCAM, Cell surface glycoprotein MUC18, humanhuman

Predictions only

Length 646 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MCAMP43121 ALDOC-201ENST00000226253 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
MCAMP43121 AP5S1-201ENST00000246041 1960 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.01■■□□□ 1.11
MCAMP43121 OBSL1-214ENST00000603926 5520 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
MCAMP43121 CARHSP1-219ENST00000618335 2972 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.01■■□□□ 1.11
MCAMP43121 TNFRSF8-202ENST00000413146 2363 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
MCAMP43121 C6orf15-201ENST00000259870 1140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
MCAMP43121 RPUSD3-201ENST00000383820 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
MCAMP43121 BIRC7-203ENST00000395306 593 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
MCAMP43121 BET1L-206ENST00000486280 665 ntTSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
MCAMP43121 PDCD6-207ENST00000509581 1156 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
MCAMP43121 CCDC61-201ENST00000536603 1282 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
MCAMP43121 RNPS1-224ENST00000569598 918 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
MCAMP43121 C19orf25-204ENST00000586564 1265 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
MCAMP43121 AC104971.2-201ENST00000588144 1209 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
MCAMP43121 ATRIP-201ENST00000320211 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
MCAMP43121 LIN28B-AS1-203ENST00000636682 1797 ntTSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
MCAMP43121 APBB1-215ENST00000608394 2128 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
MCAMP43121 APBB1-222ENST00000610474 2147 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
MCAMP43121 FAM189B-204ENST00000368368 2609 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
MCAMP43121 ZNF394-203ENST00000426306 2017 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
MCAMP43121 PLCXD1-202ENST00000381663 1863 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
MCAMP43121 RNF38-202ENST00000350199 5104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
MCAMP43121 KDM4B-202ENST00000381759 3058 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
MCAMP43121 DYNLL1-209ENST00000550845 1376 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
MCAMP43121 CDC42BPB-201ENST00000361246 6758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
MCAMP43121 EZH2-201ENST00000320356 2639 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
MCAMP43121 TBC1D3I-202ENST00000618620 1900 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
MCAMP43121 SERPINA4-201ENST00000298841 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
MCAMP43121 NT5E-202ENST00000369646 974 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
MCAMP43121 GNB1L-203ENST00000405009 1076 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
MCAMP43121 MRPS24-203ENST00000418740 743 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
MCAMP43121 AKR7L-201ENST00000420396 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
MCAMP43121 AC246785.2-201ENST00000432512 513 ntBASIC22■■□□□ 1.11
MCAMP43121 AC104819.1-201ENST00000504587 486 ntBASIC22■■□□□ 1.11
MCAMP43121 AL133352.1-203ENST00000557395 1234 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
MCAMP43121 TBCB-205ENST00000585746 875 ntTSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
MCAMP43121 Z69720.1-201ENST00000601483 472 ntBASIC22■■□□□ 1.11
MCAMP43121 AL513523.2-201ENST00000633218 660 ntTSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
MCAMP43121 ANKRD20A8P-203ENST00000641373 517 ntBASIC22■■□□□ 1.11
MCAMP43121 ACVR1B-201ENST00000257963 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
MCAMP43121 ASIC3-202ENST00000349064 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
MCAMP43121 ZNF692-204ENST00000451251 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
MCAMP43121 ADAMTS9-202ENST00000459780 2871 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
MCAMP43121 POLD3-203ENST00000527458 2122 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
MCAMP43121 UPP1-203ENST00000395564 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
MCAMP43121 DHRS12-201ENST00000218981 1970 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
MCAMP43121 PSAP-205ENST00000610929 1969 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
MCAMP43121 COPS7A-204ENST00000534947 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
MCAMP43121 ADAP1-205ENST00000449296 2093 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
MCAMP43121 KRTAP5-6-201ENST00000382160 561 ntAPPRIS P1 BASIC21.99■■□□□ 1.11
MCAMP43121 RPL36-202ENST00000394580 556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
MCAMP43121 UNC93B7-201ENST00000509439 705 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
MCAMP43121 FOSL1P1-201ENST00000511041 816 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
MCAMP43121 REPIN1-217ENST00000518514 478 ntTSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
MCAMP43121 AL732292.2-201ENST00000609649 430 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
MCAMP43121 SPINK2-205ENST00000616980 677 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
MCAMP43121 AC009154.2-201ENST00000621177 724 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
MCAMP43121 KRT81-201ENST00000327741 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
MCAMP43121 SDC1-203ENST00000403076 1523 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
MCAMP43121 FCMR-201ENST00000367091 1950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
MCAMP43121 TM9SF1-206ENST00000528669 2425 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
MCAMP43121 LRP8-204ENST00000371454 3322 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
MCAMP43121 DLGAP4-206ENST00000475894 3110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
MCAMP43121 SNAPC3-207ENST00000610884 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
MCAMP43121 AK1-203ENST00000373176 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
MCAMP43121 DLGAP4-201ENST00000339266 5016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
MCAMP43121 NAA50-209ENST00000497525 1385 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
MCAMP43121 VGLL4-210ENST00000426568 1428 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
MCAMP43121 TCERG1L-201ENST00000368642 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
MCAMP43121 ASCC1-205ENST00000394919 2683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
MCAMP43121 TMED3-201ENST00000299705 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
MCAMP43121 POLD4-205ENST00000529704 1486 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
MCAMP43121 ANKS3-202ENST00000446014 2265 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
MCAMP43121 PRR5-201ENST00000006251 1767 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
MCAMP43121 NSUN5P1-202ENST00000421140 1535 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
MCAMP43121 NSUN5P2-203ENST00000457352 1529 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
MCAMP43121 ANKRD37-201ENST00000335174 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
MCAMP43121 KIRREL3-AS3-201ENST00000404882 831 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
MCAMP43121 SBDSP1-202ENST00000423945 618 ntTSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
MCAMP43121 SNHG7-203ENST00000436596 509 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
MCAMP43121 CDV3-207ENST00000508481 661 ntTSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
MCAMP43121 ABR-204ENST00000543210 1049 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
MCAMP43121 ABR-217ENST00000572441 563 ntTSL 4 BASIC21.98■■□□□ 1.11
MCAMP43121 AC011840.4-201ENST00000578471 627 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
MCAMP43121 AC005336.2-201ENST00000593183 939 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
MCAMP43121 BAIAP2-204ENST00000428708 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
MCAMP43121 IRF7-207ENST00000525445 1588 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
MCAMP43121 LINC00937-205ENST00000538304 2157 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
MCAMP43121 RMND5B-201ENST00000313386 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
MCAMP43121 TMEM235-202ENST00000421688 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
MCAMP43121 PTTG1IP-204ENST00000445724 2497 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
MCAMP43121 KRT6C-201ENST00000252250 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
MCAMP43121 KRT6B-201ENST00000252252 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
MCAMP43121 RBFA-202ENST00000306735 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
MCAMP43121 FASTK-202ENST00000353841 1402 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
MCAMP43121 GRM5-202ENST00000305447 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
MCAMP43121 AC087500.1-202ENST00000571689 1715 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
MCAMP43121 RTN4-201ENST00000317610 2333 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
MCAMP43121 ZIC4-212ENST00000484399 1774 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
MCAMP43121 CHRAC1-201ENST00000220913 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.7 ms