Protein–RNA interactions for Protein: P35227

PCGF2, Polycomb group RING finger protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 344 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCGF2P35227 VHL-202ENST00000345392 2696 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
PCGF2P35227 KRT8P7-201ENST00000533003 1432 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
PCGF2P35227 SEMA6C-209ENST00000613223 1950 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
PCGF2P35227 FST-202ENST00000396947 2538 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
PCGF2P35227 JPH2-201ENST00000342272 1923 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
PCGF2P35227 CEP83-AS1-201ENST00000623122 2482 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
PCGF2P35227 TRAPPC2L-201ENST00000301021 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
PCGF2P35227 PRSS53-201ENST00000280606 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
PCGF2P35227 CLPB-212ENST00000543042 2133 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
PCGF2P35227 AC007743.1-203ENST00000447423 1623 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
PCGF2P35227 TDRP-201ENST00000324079 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
PCGF2P35227 TUBA3C-201ENST00000400113 1551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
PCGF2P35227 C1orf159-204ENST00000379339 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
PCGF2P35227 SP100-208ENST00000427101 1922 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
PCGF2P35227 CMTM3-214ENST00000567572 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
PCGF2P35227 AC012317.2-201ENST00000623305 2251 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
PCGF2P35227 CCNC-207ENST00000518714 1426 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
PCGF2P35227 SIRPAP1-201ENST00000448467 1770 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
PCGF2P35227 ACTN3-203ENST00000513398 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
PCGF2P35227 FAM53A-207ENST00000489363 2776 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
PCGF2P35227 MFHAS1-201ENST00000276282 6414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
PCGF2P35227 KRT18P23-201ENST00000435622 1283 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
PCGF2P35227 NDUFS3-212ENST00000534208 583 ntTSL 4 BASIC17.05■□□□□ 0.32
PCGF2P35227 AC117500.4-201ENST00000542797 617 ntTSL 3 BASIC17.05■□□□□ 0.32
PCGF2P35227 TGIF1-222ENST00000577543 729 ntTSL 3 BASIC17.05■□□□□ 0.32
PCGF2P35227 CD177-202ENST00000607855 536 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
PCGF2P35227 CAMK4-210ENST00000512453 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
PCGF2P35227 SMG5-201ENST00000361813 4559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
PCGF2P35227 GATA2-202ENST00000430265 2525 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
PCGF2P35227 NME9-203ENST00000383180 2133 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
PCGF2P35227 PODN-203ENST00000395871 2744 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
PCGF2P35227 OTOP2-202ENST00000580223 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
PCGF2P35227 CAPN1-201ENST00000279247 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
PCGF2P35227 CD40-202ENST00000372285 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
PCGF2P35227 FBXW11-202ENST00000296933 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
PCGF2P35227 SLCO6A1-202ENST00000389019 2340 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
PCGF2P35227 GRAP2-202ENST00000407075 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
PCGF2P35227 TMEM191C-214ENST00000621561 1337 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
PCGF2P35227 EXO5-202ENST00000358527 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
PCGF2P35227 ETNK2-203ENST00000367202 2434 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
PCGF2P35227 NPM3-201ENST00000370110 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
PCGF2P35227 UBB-203ENST00000395839 1012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
PCGF2P35227 IL15RA-208ENST00000397251 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
PCGF2P35227 CRYGFP-201ENST00000418459 633 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
PCGF2P35227 TSPY20P-201ENST00000450910 630 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
PCGF2P35227 FAM131A-208ENST00000453072 1038 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
PCGF2P35227 GRAMD1B-209ENST00000533341 707 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
PCGF2P35227 SIVA1-207ENST00000556195 674 ntTSL 3 BASIC17.04■□□□□ 0.32
PCGF2P35227 METTL23-208ENST00000588822 1049 ntTSL 3 BASIC17.04■□□□□ 0.32
PCGF2P35227 AC008649.1-201ENST00000589557 516 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
PCGF2P35227 AC008763.3-201ENST00000597959 777 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.04■□□□□ 0.32
PCGF2P35227 FFAR2-201ENST00000246549 2051 ntAPPRIS P1 BASIC17.04■□□□□ 0.32
PCGF2P35227 BPGM-202ENST00000393132 2051 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
PCGF2P35227 SDCBP-202ENST00000413219 2086 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
PCGF2P35227 CEP78-204ENST00000415759 2623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
PCGF2P35227 WDR59-202ENST00000536050 1752 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
PCGF2P35227 TBC1D4-204ENST00000431480 6347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
PCGF2P35227 HLA-DQB1-204ENST00000399084 1734 ntAPPRIS P1 BASIC17.04■□□□□ 0.32
PCGF2P35227 SLC35F3-201ENST00000366617 2762 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
PCGF2P35227 INVS-203ENST00000374921 1654 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
PCGF2P35227 POLR3D-201ENST00000306433 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
PCGF2P35227 ZNF133-212ENST00000622607 2660 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC17.04■□□□□ 0.32
PCGF2P35227 PARP16-202ENST00000444347 2352 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
PCGF2P35227 GPR135-201ENST00000395116 4578 ntAPPRIS P1 BASIC17.03■□□□□ 0.32
PCGF2P35227 FBXL7-202ENST00000504595 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
PCGF2P35227 GNAZ-203ENST00000615612 3333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
PCGF2P35227 ANXA6-201ENST00000354546 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
PCGF2P35227 MAPKAPK3-208ENST00000621469 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
PCGF2P35227 ZNF517-201ENST00000359971 2335 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.03■□□□□ 0.32
PCGF2P35227 FBXL17-201ENST00000359660 4510 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
PCGF2P35227 ZDHHC23-201ENST00000330212 3778 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
PCGF2P35227 LRCH3-201ENST00000334859 2258 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
PCGF2P35227 ITGA6-201ENST00000264107 5618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
PCGF2P35227 APEH-202ENST00000438011 2249 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
PCGF2P35227 CDC25B-202ENST00000340833 1978 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
PCGF2P35227 PLD3-205ENST00000409419 1966 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
PCGF2P35227 HCK-210ENST00000629881 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
PCGF2P35227 TPPP3-201ENST00000290942 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
PCGF2P35227 LYPD1-201ENST00000345008 1033 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
PCGF2P35227 TPPP3-202ENST00000393957 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
PCGF2P35227 AC091564.5-201ENST00000526456 820 ntTSL 4 BASIC17.03■□□□□ 0.32
PCGF2P35227 FOXN3-AS1-201ENST00000555562 1077 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
PCGF2P35227 TCEA1-208ENST00000521604 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
PCGF2P35227 CCNI2-201ENST00000378731 2355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
PCGF2P35227 ENC1-201ENST00000302351 5520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
PCGF2P35227 FAM182B-201ENST00000376403 1681 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
PCGF2P35227 GYPC-202ENST00000356887 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
PCGF2P35227 WWP1-202ENST00000517970 4686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
PCGF2P35227 ACSS2-201ENST00000253382 2925 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
PCGF2P35227 ZDHHC2-201ENST00000262096 6377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
PCGF2P35227 HTR7P1-202ENST00000624664 4411 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
PCGF2P35227 SLC1A5-205ENST00000594991 2031 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
PCGF2P35227 SLC25A3-211ENST00000548847 1369 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
PCGF2P35227 EDNRA-206ENST00000511804 1569 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
PCGF2P35227 BPIFB4-201ENST00000375483 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
PCGF2P35227 FAM58A-204ENST00000576892 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
PCGF2P35227 RAD23A-201ENST00000316856 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
PCGF2P35227 CPAMD8-203ENST00000443236 5992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
PCGF2P35227 SDHA-213ENST00000510361 2148 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
PCGF2P35227 TAF15-211ENST00000604841 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.1 ms