Protein–RNA interactions for Protein: P25788

PSMA3, Proteasome subunit alpha type-3, humanhuman

Predictions only

Length 255 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSMA3P25788 FAM50A-202ENST00000393600 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
PSMA3P25788 PRDX5-201ENST00000265462 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
PSMA3P25788 GUCA2B-201ENST00000372581 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
PSMA3P25788 PRICKLE4-202ENST00000394260 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
PSMA3P25788 PRICKLE4-203ENST00000394263 1155 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
PSMA3P25788 YPEL3-201ENST00000398838 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
PSMA3P25788 HOXD12-201ENST00000404162 841 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
PSMA3P25788 AC134772.1-201ENST00000438872 885 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
PSMA3P25788 RASA4DP-201ENST00000460726 1199 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
PSMA3P25788 AC034232.1-201ENST00000506026 1064 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
PSMA3P25788 PPOX-219ENST00000544598 813 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
PSMA3P25788 FAM181A-203ENST00000556222 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
PSMA3P25788 GSTZ1-218ENST00000557053 580 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
PSMA3P25788 AC090970.2-201ENST00000561318 865 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
PSMA3P25788 C17orf62-221ENST00000581196 668 ntTSL 4 BASIC18.23■□□□□ 0.51
PSMA3P25788 CALM3-208ENST00000596362 1203 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
PSMA3P25788 AC140113.3-201ENST00000605663 199 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
PSMA3P25788 PRLHR-202ENST00000636925 1275 ntAPPRIS P1 BASIC18.23■□□□□ 0.51
PSMA3P25788 TMEM214-203ENST00000404032 2830 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
PSMA3P25788 NPFFR2-201ENST00000308744 1922 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
PSMA3P25788 OGFOD2-212ENST00000538755 1949 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
PSMA3P25788 TDRKH-207ENST00000458431 2768 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
PSMA3P25788 TYMS-201ENST00000323224 1327 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
PSMA3P25788 FKBP3-202ENST00000396062 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
PSMA3P25788 AL096828.2-201ENST00000567259 1965 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
PSMA3P25788 BEGAIN-202ENST00000443071 2744 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
PSMA3P25788 AL445433.2-201ENST00000425113 2544 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
PSMA3P25788 AC090206.1-201ENST00000615734 1678 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
PSMA3P25788 JAG1-201ENST00000254958 6048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
PSMA3P25788 SIDT2-217ENST00000532062 2143 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
PSMA3P25788 PJA1-202ENST00000374571 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
PSMA3P25788 SPACA1-201ENST00000237201 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
PSMA3P25788 PBK-203ENST00000522944 1499 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
PSMA3P25788 KRT89P-201ENST00000620027 1478 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
PSMA3P25788 CAPN10-203ENST00000352879 862 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
PSMA3P25788 ANKRD20A18P-201ENST00000359341 492 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
PSMA3P25788 ST8SIA1-202ENST00000381424 1036 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
PSMA3P25788 ATP5G1P1-201ENST00000448724 379 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
PSMA3P25788 FIS1-207ENST00000474120 915 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
PSMA3P25788 AP003396.1-201ENST00000501918 507 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
PSMA3P25788 RBM42-202ENST00000586618 771 ntTSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
PSMA3P25788 AC139887.4-201ENST00000607877 719 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
PSMA3P25788 AC006011.2-201ENST00000621313 1158 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
PSMA3P25788 AC079602.3-201ENST00000623931 403 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
PSMA3P25788 ISOC2-201ENST00000085068 1122 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
PSMA3P25788 ITGA6-201ENST00000264107 5618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
PSMA3P25788 IRF3-203ENST00000377139 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
PSMA3P25788 CCDC88C-203ENST00000389856 1641 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
PSMA3P25788 SPAG9-202ENST00000357122 4761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
PSMA3P25788 LZTS2-202ENST00000370223 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
PSMA3P25788 LYSMD4-210ENST00000545021 2431 ntTSL 4 BASIC18.22■□□□□ 0.51
PSMA3P25788 GBGT1-203ENST00000372040 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
PSMA3P25788 RAB11FIP2-202ENST00000369199 6119 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
PSMA3P25788 GPATCH3-201ENST00000361720 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
PSMA3P25788 BAIAP2L2-202ENST00000381669 2146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
PSMA3P25788 AC107464.1-203ENST00000468356 2120 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
PSMA3P25788 ANKRD10-201ENST00000267339 2495 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
PSMA3P25788 B4GALT4-202ENST00000393765 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
PSMA3P25788 A4GALT-201ENST00000249005 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
PSMA3P25788 N4BP3-201ENST00000274605 6080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
PSMA3P25788 PDE3B-201ENST00000282096 6076 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
PSMA3P25788 FBXL15-201ENST00000224862 2362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
PSMA3P25788 EDA-203ENST00000374552 5278 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
PSMA3P25788 OSTM1-201ENST00000193322 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
PSMA3P25788 SH2D2A-201ENST00000368198 1599 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
PSMA3P25788 POLR1D-220ENST00000637071 1943 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
PSMA3P25788 BAZ1A-203ENST00000382422 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
PSMA3P25788 GGT3P-201ENST00000412448 2340 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
PSMA3P25788 CRKL-201ENST00000354336 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
PSMA3P25788 METRN-204ENST00000568223 3325 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
PSMA3P25788 FIBCD1-201ENST00000372337 1868 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
PSMA3P25788 CCDC63-202ENST00000545036 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
PSMA3P25788 ASPM-201ENST00000294732 6132 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
PSMA3P25788 MRPL52-201ENST00000311892 1042 ntTSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
PSMA3P25788 HLA-F-217ENST00000334668 1283 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
PSMA3P25788 GLRX2-201ENST00000367439 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
PSMA3P25788 DUSP15-203ENST00000375966 1077 ntTSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
PSMA3P25788 GPC5-201ENST00000377067 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
PSMA3P25788 UBE2I-203ENST00000397514 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
PSMA3P25788 DUSP15-204ENST00000398083 1212 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
PSMA3P25788 HLA-F-220ENST00000434407 884 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
PSMA3P25788 ST6GALNAC4P1-201ENST00000435385 499 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
PSMA3P25788 PDCD6-206ENST00000507528 1088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
PSMA3P25788 AC008687.5-201ENST00000593746 558 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
PSMA3P25788 FMR1-AS1_2.1-201ENST00000613724 127 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
PSMA3P25788 CADM1-222ENST00000616271 1246 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
PSMA3P25788 SMN1-211ENST00000625245 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
PSMA3P25788 SMN2-215ENST00000628696 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
PSMA3P25788 FLJ13224-201ENST00000313737 1514 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
PSMA3P25788 SLC23A3-207ENST00000455516 2048 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
PSMA3P25788 FGFBP3-201ENST00000311575 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
PSMA3P25788 EPHX4-201ENST00000370383 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
PSMA3P25788 NECTIN3-206ENST00000485303 3664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
PSMA3P25788 SRP9-203ENST00000366839 1596 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
PSMA3P25788 LY6E-203ENST00000517503 1335 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
PSMA3P25788 SHISA3-201ENST00000319234 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.5
PSMA3P25788 FCMR-201ENST00000367091 1950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.5
PSMA3P25788 APBB1-215ENST00000608394 2128 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
PSMA3P25788 APBB1-222ENST00000610474 2147 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
PSMA3P25788 TPRA1-204ENST00000450633 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.1 ms