Protein–RNA interactions for Protein: P23510

TNFSF4, Tumor necrosis factor ligand superfamily member 4, humanhuman

Predictions only

Length 183 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNFSF4P23510 TTC3-203ENST00000399010 2115 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
TNFSF4P23510 SEC61A2-201ENST00000298428 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
TNFSF4P23510 LURAP1-201ENST00000371980 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
TNFSF4P23510 ATPIF1-202ENST00000465645 1855 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
TNFSF4P23510 ASL-204ENST00000395331 1538 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
TNFSF4P23510 CROCCP3-202ENST00000420820 1947 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
TNFSF4P23510 GUCA1A-205ENST00000541991 1921 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
TNFSF4P23510 CASD1-201ENST00000297273 3942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
TNFSF4P23510 BRPF1-203ENST00000424362 4712 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
TNFSF4P23510 ARMC10P1-201ENST00000313754 855 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
TNFSF4P23510 COMTD1-201ENST00000372538 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
TNFSF4P23510 DDRGK1-202ENST00000380201 1128 ntTSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
TNFSF4P23510 KRTAP5-10-201ENST00000398531 1176 ntAPPRIS P1 BASIC15.65■□□□□ 0.1
TNFSF4P23510 AC112907.2-201ENST00000448639 330 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
TNFSF4P23510 DGUOK-AS1-203ENST00000453103 601 ntTSL 3 BASIC15.65■□□□□ 0.1
TNFSF4P23510 SCARB1-201ENST00000261693 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
TNFSF4P23510 EDC3-214ENST00000568176 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
TNFSF4P23510 GPR75-201ENST00000394705 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
TNFSF4P23510 FAM46A-201ENST00000320172 5609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
TNFSF4P23510 ZGPAT-202ENST00000355969 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
TNFSF4P23510 AP001351.1-201ENST00000501397 1865 ntTSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
TNFSF4P23510 GSTM4-201ENST00000326729 1321 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
TNFSF4P23510 SNX17-201ENST00000233575 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
TNFSF4P23510 TNXA-203ENST00000507684 2038 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
TNFSF4P23510 DRD5-201ENST00000304374 2330 ntAPPRIS P1 BASIC15.65■□□□□ 0.1
TNFSF4P23510 WRB-201ENST00000333781 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
TNFSF4P23510 CENPT-215ENST00000564817 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
TNFSF4P23510 PGR-201ENST00000263463 2496 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
TNFSF4P23510 PLCB3-204ENST00000540288 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.1
TNFSF4P23510 PRRT1-201ENST00000211413 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
TNFSF4P23510 AMMECR1-201ENST00000262844 5504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
TNFSF4P23510 WNK2-201ENST00000297954 7138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
TNFSF4P23510 ACSS3-201ENST00000261206 2666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
TNFSF4P23510 C1QTNF1-209ENST00000581774 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
TNFSF4P23510 DDX59-201ENST00000331314 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
TNFSF4P23510 FPGS-203ENST00000373247 2279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
TNFSF4P23510 CDK17-203ENST00000543119 2442 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
TNFSF4P23510 ANKDD1B-204ENST00000601380 2569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
TNFSF4P23510 PODN-203ENST00000395871 2744 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
TNFSF4P23510 MAP4K4-205ENST00000350878 7640 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
TNFSF4P23510 CDKN2C-201ENST00000262662 2904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
TNFSF4P23510 ABCD1-202ENST00000370129 1016 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
TNFSF4P23510 DAP-202ENST00000432074 1048 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
TNFSF4P23510 HELT-202ENST00000505610 846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
TNFSF4P23510 AF250324.1-201ENST00000506276 703 ntTSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
TNFSF4P23510 ATP6V0C-203ENST00000565223 668 ntTSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
TNFSF4P23510 ATP6V0C-204ENST00000568562 477 ntTSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
TNFSF4P23510 AL772307.1-201ENST00000639363 1066 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
TNFSF4P23510 KBTBD2-201ENST00000304056 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
TNFSF4P23510 ARHGAP26-202ENST00000378004 9200 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
TNFSF4P23510 SPAG16-209ENST00000447990 1330 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
TNFSF4P23510 ZFP3-201ENST00000318833 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
TNFSF4P23510 ZNF598-204ENST00000563630 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
TNFSF4P23510 ACSL4-201ENST00000340800 5333 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
TNFSF4P23510 TCAIM-203ENST00000396078 2178 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
TNFSF4P23510 RNF113B-201ENST00000267291 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
TNFSF4P23510 ZNF394-203ENST00000426306 2017 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
TNFSF4P23510 SORBS3-221ENST00000523965 2028 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
TNFSF4P23510 CCDC63-202ENST00000545036 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
TNFSF4P23510 CDK5R1-201ENST00000313401 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
TNFSF4P23510 SLC27A4-202ENST00000372870 1557 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
TNFSF4P23510 AC020661.1-201ENST00000503052 1584 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
TNFSF4P23510 ARHGAP9-202ENST00000393797 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
TNFSF4P23510 HOXC10-201ENST00000303460 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
TNFSF4P23510 LINC01311-201ENST00000565162 1445 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
TNFSF4P23510 GAMT-202ENST00000447102 1769 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
TNFSF4P23510 COPE-201ENST00000262812 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
TNFSF4P23510 C20orf196-201ENST00000303142 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
TNFSF4P23510 PLK5-201ENST00000334770 2106 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
TNFSF4P23510 GYG2P1-201ENST00000357871 623 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
TNFSF4P23510 FAM19A3-201ENST00000361886 1056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
TNFSF4P23510 ROMO1-205ENST00000397416 288 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
TNFSF4P23510 SPDYE15P-201ENST00000424157 909 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
TNFSF4P23510 ISOC2-202ENST00000425675 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
TNFSF4P23510 PVRIG2P-201ENST00000435460 978 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
TNFSF4P23510 SLC9A3R2-208ENST00000566198 1199 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
TNFSF4P23510 AC015961.2-201ENST00000589281 701 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
TNFSF4P23510 ELAVL1-202ENST00000593807 856 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
TNFSF4P23510 AL136038.4-201ENST00000603606 1261 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
TNFSF4P23510 CADM1-222ENST00000616271 1246 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
TNFSF4P23510 mascRNA-menRNA.2-201ENST00000616984 58 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
TNFSF4P23510 TMEM53-202ENST00000372237 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
TNFSF4P23510 MMP9-201ENST00000372330 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
TNFSF4P23510 AC098818.2-201ENST00000564925 2320 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
TNFSF4P23510 LUC7L-201ENST00000293872 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
TNFSF4P23510 PBK-203ENST00000522944 1499 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
TNFSF4P23510 CCDC27-201ENST00000294600 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
TNFSF4P23510 ENOPH1-201ENST00000273920 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
TNFSF4P23510 FKBP3-201ENST00000216330 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
TNFSF4P23510 SMPD4-202ENST00000409031 4896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
TNFSF4P23510 GCDH-216ENST00000591470 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
TNFSF4P23510 COBL-201ENST00000265136 5291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
TNFSF4P23510 ERCC2-205ENST00000485403 1538 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
TNFSF4P23510 CACNA1A-238ENST00000637276 7135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
TNFSF4P23510 SYT17-207ENST00000568115 1721 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
TNFSF4P23510 SERPINH1-215ENST00000533603 2299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
TNFSF4P23510 PTPN12-201ENST00000248594 3406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
TNFSF4P23510 HLA-G-205ENST00000428701 1578 ntAPPRIS P2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
TNFSF4P23510 EIF2AK4-201ENST00000263791 5499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
TNFSF4P23510 KCNIP4-205ENST00000382152 1767 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.7 ms