Protein–RNA interactions for Protein: P22455

FGFR4, Fibroblast growth factor receptor 4, humanhuman

Predictions only

Length 802 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FGFR4P22455 AC008393.1-201ENST00000499601 1454 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
FGFR4P22455 RPL3-201ENST00000216146 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
FGFR4P22455 KRT15-203ENST00000393976 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
FGFR4P22455 ZNF385B-204ENST00000410066 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
FGFR4P22455 UBE2E1-202ENST00000346855 1398 ntTSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
FGFR4P22455 CHIC2-201ENST00000263921 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
FGFR4P22455 BAALC-202ENST00000306391 243 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
FGFR4P22455 BAALC-204ENST00000330955 222 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
FGFR4P22455 ROMO1-205ENST00000397416 288 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
FGFR4P22455 AP001625.2-201ENST00000442605 575 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
FGFR4P22455 PRAP1-202ENST00000463201 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
FGFR4P22455 CUTA-210ENST00000488034 769 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
FGFR4P22455 UNC93B7-201ENST00000509439 705 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
FGFR4P22455 SDHD-206ENST00000528182 754 ntTSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
FGFR4P22455 ISCU-208ENST00000539593 1071 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
FGFR4P22455 CIB2-208ENST00000560618 804 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
FGFR4P22455 ZNF549-203ENST00000594943 556 ntTSL 4 BASIC20.13■□□□□ 0.81
FGFR4P22455 IGHV3-41-201ENST00000613121 348 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
FGFR4P22455 CYP1B1-AS1-214ENST00000620177 554 ntTSL 4 BASIC20.13■□□□□ 0.81
FGFR4P22455 UPF1-201ENST00000262803 5348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
FGFR4P22455 HOXC10-201ENST00000303460 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
FGFR4P22455 PLA2G7-201ENST00000274793 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
FGFR4P22455 AC007613.1-201ENST00000572811 2597 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
FGFR4P22455 ADAMTS8-201ENST00000257359 4010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
FGFR4P22455 WDR34-201ENST00000372715 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
FGFR4P22455 LTBP4-201ENST00000204005 5032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
FGFR4P22455 TYMS-203ENST00000323274 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
FGFR4P22455 FAM110A-201ENST00000246100 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
FGFR4P22455 PTN-201ENST00000348225 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
FGFR4P22455 NADK-201ENST00000341426 3235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
FGFR4P22455 SEPT8-216ENST00000620483 4335 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
FGFR4P22455 C6orf136-203ENST00000376473 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
FGFR4P22455 CORO6-212ENST00000584969 1416 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
FGFR4P22455 CCDC50-202ENST00000392456 2454 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
FGFR4P22455 STXBP2-201ENST00000221283 1876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
FGFR4P22455 LURAP1-201ENST00000371980 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
FGFR4P22455 SUFU-201ENST00000369899 1839 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
FGFR4P22455 GGT1-204ENST00000401885 968 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
FGFR4P22455 HDAC11-204ENST00000404040 967 ntTSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
FGFR4P22455 AC113382.1-201ENST00000500267 1253 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
FGFR4P22455 PNN-202ENST00000553331 656 ntTSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
FGFR4P22455 SMN2-213ENST00000614240 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
FGFR4P22455 SCAMP4-213ENST00000621748 1172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
FGFR4P22455 SLC25A47-201ENST00000361529 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
FGFR4P22455 IRGC-201ENST00000244314 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
FGFR4P22455 LRRC23-209ENST00000443597 1628 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
FGFR4P22455 REEP2-201ENST00000254901 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
FGFR4P22455 KLHL23-201ENST00000272797 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
FGFR4P22455 TRIM61-201ENST00000329314 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
FGFR4P22455 ACD-202ENST00000393919 1974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
FGFR4P22455 KRT81-201ENST00000327741 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
FGFR4P22455 ENDOV-225ENST00000522751 1475 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
FGFR4P22455 CHPF-203ENST00000535926 2634 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
FGFR4P22455 RBFADN-201ENST00000562391 1350 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
FGFR4P22455 LARGE2-201ENST00000325468 2522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
FGFR4P22455 TINAGL1-202ENST00000457433 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
FGFR4P22455 ABI3-202ENST00000419580 1718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
FGFR4P22455 PGR-201ENST00000263463 2496 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
FGFR4P22455 PFN1-201ENST00000225655 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
FGFR4P22455 SLX1A-202ENST00000345535 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
FGFR4P22455 SLX1B-202ENST00000351581 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
FGFR4P22455 CDC26-201ENST00000374206 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
FGFR4P22455 RPUSD3-201ENST00000383820 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
FGFR4P22455 MEF2B-202ENST00000409447 1297 ntTSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
FGFR4P22455 LINC01315-202ENST00000424852 1142 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
FGFR4P22455 DRAXINP1-201ENST00000437611 948 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
FGFR4P22455 ENO1-AS1-201ENST00000442636 456 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
FGFR4P22455 BRICD5-203ENST00000566018 555 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
FGFR4P22455 ZNF524-203ENST00000591046 1260 ntAPPRIS P1 BASIC20.11■□□□□ 0.81
FGFR4P22455 WDR88-203ENST00000592765 651 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
FGFR4P22455 UAP1-204ENST00000367926 2294 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
FGFR4P22455 ACHE-205ENST00000419336 1906 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
FGFR4P22455 LINC01700-201ENST00000433952 1598 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
FGFR4P22455 OSM-201ENST00000215781 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
FGFR4P22455 SAAL1-201ENST00000300013 1518 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
FGFR4P22455 ACAP3-202ENST00000354700 3896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
FGFR4P22455 GDPD1-201ENST00000284116 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
FGFR4P22455 ST3GAL3-201ENST00000262915 2470 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
FGFR4P22455 TRIM13-206ENST00000457662 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
FGFR4P22455 SMARCC2-201ENST00000267064 4076 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
FGFR4P22455 ADAP1-205ENST00000449296 2093 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
FGFR4P22455 APBB1-207ENST00000529519 1442 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
FGFR4P22455 SCARF1-202ENST00000348987 2619 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
FGFR4P22455 HOXC6-202ENST00000394331 2943 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
FGFR4P22455 HIPK1-207ENST00000369561 3777 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
FGFR4P22455 CTBP2-214ENST00000531469 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
FGFR4P22455 COBL-210ENST00000632460 1941 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
FGFR4P22455 SLBP-201ENST00000318386 1635 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
FGFR4P22455 GDF10-201ENST00000580279 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
FGFR4P22455 CARHSP1-201ENST00000311052 746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
FGFR4P22455 AP000593.1-201ENST00000393668 712 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
FGFR4P22455 UBE2I-203ENST00000397514 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
FGFR4P22455 AC105202.1-201ENST00000517833 995 ntTSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
FGFR4P22455 ZFPM1-205ENST00000569086 563 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
FGFR4P22455 KISS1R-203ENST00000606939 964 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
FGFR4P22455 AL732292.2-201ENST00000609649 430 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
FGFR4P22455 H2BFWT-202ENST00000611083 528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
FGFR4P22455 NBL1-212ENST00000621723 2133 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
FGFR4P22455 CEACAM3-208ENST00000630848 1110 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
FGFR4P22455 ARSA-203ENST00000395619 1824 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.4 ms