Protein–RNA interactions for Protein: P20823

HNF1A, Hepatocyte nuclear factor 1-alpha, humanhuman

Predictions only

Length 631 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HNF1AP20823 PCDHA7-202ENST00000525929 5221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
HNF1AP20823 HCN1-201ENST00000303230 9885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
HNF1AP20823 CHPF-203ENST00000535926 2634 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
HNF1AP20823 KCNC4-203ENST00000413138 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
HNF1AP20823 ZNF575-201ENST00000314228 1298 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
HNF1AP20823 CDHR4-201ENST00000343366 1188 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
HNF1AP20823 DBNDD2-202ENST00000360981 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
HNF1AP20823 C7orf50-203ENST00000397100 1264 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
HNF1AP20823 AL161452.1-201ENST00000415062 1117 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
HNF1AP20823 HSD11B1L-205ENST00000422535 730 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
HNF1AP20823 TSPY21P-201ENST00000433481 731 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
HNF1AP20823 AL162457.2-201ENST00000447909 937 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
HNF1AP20823 LINC01128-207ENST00000449005 874 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
HNF1AP20823 AL512357.1-201ENST00000557687 518 ntTSL 4 BASIC15.43■□□□□ 0.06
HNF1AP20823 AC004771.4-201ENST00000576752 474 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
HNF1AP20823 AC008878.4-201ENST00000602083 293 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
HNF1AP20823 CALB2-202ENST00000349553 1373 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
HNF1AP20823 GMPPA-213ENST00000622191 1473 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
HNF1AP20823 ACBD4-215ENST00000592162 1684 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
HNF1AP20823 GRK6-201ENST00000355472 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
HNF1AP20823 RTCA-203ENST00000370128 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
HNF1AP20823 SORBS3-221ENST00000523965 2028 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
HNF1AP20823 HOXB8-201ENST00000239144 1823 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
HNF1AP20823 SLC8A3-202ENST00000356921 5250 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
HNF1AP20823 SBDS-201ENST00000246868 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
HNF1AP20823 ICA1-208ENST00000407906 1615 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
HNF1AP20823 RUVBL2-211ENST00000601968 1641 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
HNF1AP20823 C6orf89-203ENST00000373685 1400 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
HNF1AP20823 L2HGDH-202ENST00000267436 6414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
HNF1AP20823 SEL1L3-202ENST00000399878 4520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
HNF1AP20823 FBXL16-203ENST00000562563 2257 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
HNF1AP20823 ZNF582-207ENST00000619584 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
HNF1AP20823 TMC6-203ENST00000392467 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
HNF1AP20823 FOXI3-201ENST00000428390 2804 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
HNF1AP20823 NAPRT-202ENST00000426292 1654 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
HNF1AP20823 PRDX3-201ENST00000298510 1591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
HNF1AP20823 AC009237.14-201ENST00000609975 1594 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
HNF1AP20823 CD164L2-202ENST00000374027 1457 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
HNF1AP20823 MORF4L1-215ENST00000559345 1468 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
HNF1AP20823 NRXN1-209ENST00000405581 5078 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
HNF1AP20823 ADK-206ENST00000541550 2222 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
HNF1AP20823 FGD5-201ENST00000285046 5720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
HNF1AP20823 INSL3-201ENST00000317306 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
HNF1AP20823 MRPL20-201ENST00000344843 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
HNF1AP20823 FIBP-202ENST00000357519 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
HNF1AP20823 PPIH-202ENST00000372549 327 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
HNF1AP20823 TSPY8-203ENST00000383005 435 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
HNF1AP20823 CXCL12-204ENST00000395793 665 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
HNF1AP20823 EXOSC3-202ENST00000396521 768 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
HNF1AP20823 AL845331.1-201ENST00000424978 1190 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
HNF1AP20823 IL11-204ENST00000590625 1028 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
HNF1AP20823 AC008567.3-202ENST00000619671 859 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
HNF1AP20823 AL365255.1-201ENST00000637702 847 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
HNF1AP20823 HNRNPUL1-203ENST00000378215 2864 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
HNF1AP20823 AL691432.2-201ENST00000607222 2038 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
HNF1AP20823 ABCG4-206ENST00000622721 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
HNF1AP20823 FAM3A-215ENST00000447601 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
HNF1AP20823 CWH43-201ENST00000226432 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
HNF1AP20823 HCCS-201ENST00000321143 2277 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
HNF1AP20823 LONP1-215ENST00000593119 2918 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
HNF1AP20823 ASB6-202ENST00000277459 2180 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
HNF1AP20823 TDRP-201ENST00000324079 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
HNF1AP20823 CCDC106-201ENST00000308964 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
HNF1AP20823 GNA13-201ENST00000439174 4922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
HNF1AP20823 KLHDC4-227ENST00000622456 1422 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
HNF1AP20823 AMACR-205ENST00000426255 1316 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
HNF1AP20823 CCDC74A-206ENST00000467992 1347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
HNF1AP20823 CPSF3-201ENST00000238112 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
HNF1AP20823 FDXR-217ENST00000582944 1766 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
HNF1AP20823 PAQR4-202ENST00000318782 2793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
HNF1AP20823 PRELID3A-209ENST00000592149 2001 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
HNF1AP20823 CRAMP1-202ENST00000397412 7772 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
HNF1AP20823 PIEZO1-201ENST00000301015 8072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
HNF1AP20823 WASF1-202ENST00000359451 3075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
HNF1AP20823 RNF114-201ENST00000244061 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
HNF1AP20823 CSNK2A2-201ENST00000262506 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
HNF1AP20823 ELF3-201ENST00000359651 4994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
HNF1AP20823 PFN1-201ENST00000225655 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
HNF1AP20823 NDUFS7-201ENST00000233627 1039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
HNF1AP20823 MRPS15-201ENST00000373116 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
HNF1AP20823 CST3-202ENST00000398409 832 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
HNF1AP20823 SDR39U1-201ENST00000399395 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
HNF1AP20823 CT47A4-201ENST00000415858 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
HNF1AP20823 CT47A9-201ENST00000417256 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
HNF1AP20823 CT47A6-201ENST00000419194 1298 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
HNF1AP20823 CT47A10-201ENST00000430448 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
HNF1AP20823 AC246785.2-201ENST00000432512 513 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
HNF1AP20823 CT47A5-201ENST00000439466 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
HNF1AP20823 TSPY23P-201ENST00000440136 739 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
HNF1AP20823 CT47A3-201ENST00000441330 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
HNF1AP20823 LINC01063-201ENST00000441644 348 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
HNF1AP20823 KRT17P6-201ENST00000453795 1220 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
HNF1AP20823 CT47A8-201ENST00000457977 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
HNF1AP20823 CT47A2-201ENST00000458218 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
HNF1AP20823 LINC02237-202ENST00000521904 477 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
HNF1AP20823 KRT8P26-201ENST00000534154 1276 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
HNF1AP20823 TRMT112-203ENST00000535750 823 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
HNF1AP20823 RPS15A-205ENST00000565420 802 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
HNF1AP20823 AC024243.1-201ENST00000609234 778 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
HNF1AP20823 SPEG-225ENST00000617028 815 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45 ms