Protein–RNA interactions for Protein: P19474

TRIM21, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM21, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 475 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM21P19474 NTRK1-203ENST00000392302 2609 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
TRIM21P19474 AC008764.6-201ENST00000595909 2069 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
TRIM21P19474 KLHL31-201ENST00000370905 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
TRIM21P19474 COPS7A-210ENST00000539735 1832 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
TRIM21P19474 TAP1-201ENST00000354258 2959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
TRIM21P19474 TIMM17B-201ENST00000376582 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
TRIM21P19474 CRAT-202ENST00000393384 973 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
TRIM21P19474 CACYBP-202ENST00000405362 1059 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
TRIM21P19474 MRPL53-202ENST00000409710 386 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
TRIM21P19474 GPX4-207ENST00000589115 812 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
TRIM21P19474 VPS26B-202ENST00000525095 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
TRIM21P19474 GPSM2-201ENST00000264126 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
TRIM21P19474 TNFRSF19-202ENST00000382258 1625 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
TRIM21P19474 POC1B-GALNT4-201ENST00000547474 2207 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
TRIM21P19474 SLC8A3-202ENST00000356921 5250 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
TRIM21P19474 LINC01168-201ENST00000461291 5254 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
TRIM21P19474 PDLIM3-201ENST00000284767 2589 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
TRIM21P19474 IL17RC-206ENST00000416074 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
TRIM21P19474 AC087500.1-202ENST00000571689 1715 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
TRIM21P19474 KLHL33-202ENST00000636854 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
TRIM21P19474 ARSA-201ENST00000216124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
TRIM21P19474 MAEA-201ENST00000264750 2058 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
TRIM21P19474 PRSS35-201ENST00000369700 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
TRIM21P19474 NEURL1B-201ENST00000369800 6424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
TRIM21P19474 SNTB1-201ENST00000395601 5164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
TRIM21P19474 PCBP3-205ENST00000400310 2168 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
TRIM21P19474 ARHGEF18-201ENST00000319670 5212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
TRIM21P19474 UNC13A-206ENST00000552293 5314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
TRIM21P19474 ENSA-205ENST00000361532 792 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
TRIM21P19474 ERICH4-201ENST00000378187 946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
TRIM21P19474 AL954642.1-201ENST00000428088 538 ntTSL 3 BASIC20.18■□□□□ 0.82
TRIM21P19474 MUC1-211ENST00000438413 927 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
TRIM21P19474 YPEL3-207ENST00000566134 761 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
TRIM21P19474 ZNF134-203ENST00000600344 483 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
TRIM21P19474 FMR1-AS1_2.1-201ENST00000613724 127 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
TRIM21P19474 ST20-MTHFS-203ENST00000615374 679 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.18■□□□□ 0.82
TRIM21P19474 AC010653.2-201ENST00000623505 997 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
TRIM21P19474 AC008556.1-201ENST00000610908 2040 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
TRIM21P19474 AL109659.2-201ENST00000606809 1674 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
TRIM21P19474 FAM131A-202ENST00000340957 2421 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
TRIM21P19474 RNFT2-204ENST00000407967 2415 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
TRIM21P19474 ADGRB2-202ENST00000373658 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
TRIM21P19474 LMNA-207ENST00000368301 2461 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
TRIM21P19474 GTF2H4-201ENST00000259895 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
TRIM21P19474 SMPD4-202ENST00000409031 4896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
TRIM21P19474 PAK4-201ENST00000321944 2555 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
TRIM21P19474 MBD1-208ENST00000398493 1845 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
TRIM21P19474 FLYWCH1P1-201ENST00000460917 1874 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
TRIM21P19474 EEF1AKMT2-201ENST00000368836 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
TRIM21P19474 BTBD1-202ENST00000379403 1467 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
TRIM21P19474 HAUS4-217ENST00000555367 1454 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
TRIM21P19474 PANX1-202ENST00000436171 2750 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
TRIM21P19474 CIRBP-202ENST00000413636 1606 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
TRIM21P19474 GNE-201ENST00000377902 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
TRIM21P19474 PHOSPHO2-201ENST00000359744 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
TRIM21P19474 SNAPIN-201ENST00000368685 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
TRIM21P19474 ZCCHC24-201ENST00000372333 906 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
TRIM21P19474 RAB2A-211ENST00000531289 1058 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
TRIM21P19474 AC145285.6-201ENST00000604632 637 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
TRIM21P19474 YAP1-209ENST00000537274 5350 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
TRIM21P19474 TRIM8-201ENST00000302424 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
TRIM21P19474 MMP9-201ENST00000372330 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
TRIM21P19474 RAB43-201ENST00000315150 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
TRIM21P19474 CALM2-201ENST00000272298 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
TRIM21P19474 FBXO44-201ENST00000251546 1896 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
TRIM21P19474 TEFM-205ENST00000581216 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
TRIM21P19474 FAM69B-201ENST00000371691 2410 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
TRIM21P19474 TBXAS1-204ENST00000416849 2505 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
TRIM21P19474 AC027097.1-202ENST00000592201 1954 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
TRIM21P19474 ESPNP-201ENST00000270691 2015 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
TRIM21P19474 PTPA-206ENST00000358994 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
TRIM21P19474 SNED1-204ENST00000401884 4538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
TRIM21P19474 AC139491.1-201ENST00000512675 1516 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
TRIM21P19474 TLX1-201ENST00000370196 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
TRIM21P19474 FAM50B-201ENST00000380272 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
TRIM21P19474 TICAM1-202ENST00000621756 1650 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
TRIM21P19474 SAMD3-202ENST00000368134 2377 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
TRIM21P19474 DBN1-201ENST00000292385 3072 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
TRIM21P19474 SHANK1-201ENST00000293441 6643 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
TRIM21P19474 GSDMD-206ENST00000526406 2496 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
TRIM21P19474 RPS6KB1-204ENST00000443572 1913 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
TRIM21P19474 ACTN4-202ENST00000390009 2102 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
TRIM21P19474 TSPY1-201ENST00000423647 1171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
TRIM21P19474 CYB561D2-204ENST00000424512 1212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
TRIM21P19474 SIGLEC15-202ENST00000546268 1054 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
TRIM21P19474 AC090970.2-201ENST00000561318 865 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
TRIM21P19474 PRR29-205ENST00000579184 1052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
TRIM21P19474 AC008735.6-201ENST00000635964 1292 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
TRIM21P19474 TFEB-206ENST00000403298 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
TRIM21P19474 ZNF419-204ENST00000415379 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
TRIM21P19474 PRMT1-201ENST00000391851 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
TRIM21P19474 LINC00574-201ENST00000420557 2318 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
TRIM21P19474 CENPA-202ENST00000335756 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
TRIM21P19474 HSF2-201ENST00000368455 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
TRIM21P19474 C19orf57-208ENST00000591586 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
TRIM21P19474 RGS20-203ENST00000344277 1667 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
TRIM21P19474 CDH22-203ENST00000537909 3902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
TRIM21P19474 MRPL3-201ENST00000264995 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
TRIM21P19474 MSI2-203ENST00000416426 1714 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
TRIM21P19474 POLR1D-220ENST00000637071 1943 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.1 ms