Protein–RNA interactions for Protein: P13224

GP1BB, Platelet glycoprotein Ib beta chain, humanhuman

Predictions only

Length 206 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GP1BBP13224 PTN-201ENST00000348225 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
GP1BBP13224 EDN3-204ENST00000371028 2397 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
GP1BBP13224 VPS37A-201ENST00000324849 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
GP1BBP13224 LEMD2-201ENST00000293760 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
GP1BBP13224 LRCH2-202ENST00000538422 4868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
GP1BBP13224 UBE3A-201ENST00000232165 5051 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
GP1BBP13224 C12orf42-205ENST00000548048 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
GP1BBP13224 CDKN2C-201ENST00000262662 2904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
GP1BBP13224 ADAP2-201ENST00000330889 2934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
GP1BBP13224 OTUD1-201ENST00000376495 2933 ntAPPRIS P1 BASIC17.03■□□□□ 0.32
GP1BBP13224 SRRM3-204ENST00000611745 3612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
GP1BBP13224 HEBP2-201ENST00000367697 844 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
GP1BBP13224 TNNT3-206ENST00000381579 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
GP1BBP13224 AL645929.1-201ENST00000420084 975 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
GP1BBP13224 MMP24-AS1-201ENST00000424358 867 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
GP1BBP13224 MMP24-AS1-209ENST00000456790 712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
GP1BBP13224 AMACR-208ENST00000512079 858 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
GP1BBP13224 RPL27-206ENST00000589913 697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
GP1BBP13224 IGFLR1-209ENST00000592537 1195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
GP1BBP13224 AL732292.2-201ENST00000609649 430 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
GP1BBP13224 AL513523.2-201ENST00000633218 660 ntTSL 3 BASIC17.03■□□□□ 0.32
GP1BBP13224 KLC1-217ENST00000554280 2426 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
GP1BBP13224 MRPL3-202ENST00000425847 1457 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
GP1BBP13224 SETMAR-206ENST00000430981 1671 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
GP1BBP13224 AL109659.2-201ENST00000606809 1674 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
GP1BBP13224 DHRS4-201ENST00000313250 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
GP1BBP13224 KCNQ2-213ENST00000626839 9213 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
GP1BBP13224 GTPBP3-222ENST00000600625 2493 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
GP1BBP13224 FAM213A-206ENST00000615554 2213 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
GP1BBP13224 DDX42-216ENST00000583590 4148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
GP1BBP13224 PRODH-215ENST00000610940 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
GP1BBP13224 TCERG1L-201ENST00000368642 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
GP1BBP13224 NPEPL1-203ENST00000525817 1780 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
GP1BBP13224 HIBADH-201ENST00000265395 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
GP1BBP13224 LDHD-202ENST00000450168 1966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
GP1BBP13224 TMPRSS5-205ENST00000538955 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
GP1BBP13224 DIP2A-203ENST00000435722 2760 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
GP1BBP13224 CLN3-204ENST00000357857 1720 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
GP1BBP13224 NOP14-202ENST00000398071 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
GP1BBP13224 PLIN5-201ENST00000381848 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
GP1BBP13224 GPAT2P1-201ENST00000444924 1672 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
GP1BBP13224 SYS1-202ENST00000372727 813 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.02■□□□□ 0.32
GP1BBP13224 PMEPA1-204ENST00000395814 800 ntTSL 3 BASIC17.02■□□□□ 0.32
GP1BBP13224 GGT1-204ENST00000401885 968 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
GP1BBP13224 AL445685.1-201ENST00000425802 762 ntTSL 3 BASIC17.02■□□□□ 0.32
GP1BBP13224 LBX1-AS1-203ENST00000454527 740 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
GP1BBP13224 AL161669.1-201ENST00000559843 386 ntTSL 3 BASIC17.02■□□□□ 0.32
GP1BBP13224 PPP1R1B-208ENST00000580825 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
GP1BBP13224 ZNF524-203ENST00000591046 1260 ntAPPRIS P1 BASIC17.02■□□□□ 0.32
GP1BBP13224 CALM3-211ENST00000598871 561 ntTSL 4 BASIC17.02■□□□□ 0.32
GP1BBP13224 CENPS-CORT-205ENST00000602787 571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.02■□□□□ 0.32
GP1BBP13224 AF228730.7-201ENST00000641842 219 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
GP1BBP13224 OXSR1-201ENST00000311806 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
GP1BBP13224 FAM189B-204ENST00000368368 2609 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
GP1BBP13224 ZSWIM4-201ENST00000254323 4339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.31
GP1BBP13224 AL357033.4-201ENST00000617703 1807 ntBASIC17.02■□□□□ 0.31
GP1BBP13224 CFC1-203ENST00000621673 1444 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.31
GP1BBP13224 NOTCH2NL-204ENST00000579793 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.31
GP1BBP13224 DNAJC8-201ENST00000263697 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
GP1BBP13224 FARSA-202ENST00000423140 1720 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
GP1BBP13224 RGS3-231ENST00000613049 1726 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
GP1BBP13224 NECTIN3-206ENST00000485303 3664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
GP1BBP13224 PPP2R5A-201ENST00000261461 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
GP1BBP13224 TMEM79-203ENST00000405535 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
GP1BBP13224 COPS7A-204ENST00000534947 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
GP1BBP13224 SLC38A10-201ENST00000288439 2708 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
GP1BBP13224 CERS5-203ENST00000422340 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
GP1BBP13224 DISP3-202ENST00000304391 1495 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
GP1BBP13224 EDA-203ENST00000374552 5278 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
GP1BBP13224 RUBCN-206ENST00000449205 1603 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
GP1BBP13224 RPL36-201ENST00000347512 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
GP1BBP13224 AC064807.1-202ENST00000423716 936 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
GP1BBP13224 AC004975.2-201ENST00000442017 565 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
GP1BBP13224 NME4-212ENST00000621774 904 ntTSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
GP1BBP13224 RNF187-203ENST00000639044 708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
GP1BBP13224 HCN2-201ENST00000251287 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
GP1BBP13224 ALDH5A1-202ENST00000357578 5248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
GP1BBP13224 ENTPD6-201ENST00000354989 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
GP1BBP13224 ENTPD8-202ENST00000371506 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
GP1BBP13224 IL17RC-215ENST00000455057 2244 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
GP1BBP13224 PRR36-202ENST00000618550 4456 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
GP1BBP13224 DOLPP1-203ENST00000406974 2037 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
GP1BBP13224 SMN2-202ENST00000380742 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
GP1BBP13224 PSMD3-201ENST00000264639 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
GP1BBP13224 WT1-205ENST00000452863 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
GP1BBP13224 MAPK8IP3-201ENST00000250894 5661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
GP1BBP13224 MEN1-205ENST00000377316 2868 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
GP1BBP13224 NUDT17-201ENST00000334513 1473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
GP1BBP13224 ZNF655-202ENST00000320583 1601 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
GP1BBP13224 MTERF2-202ENST00000392830 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
GP1BBP13224 SIGLEC10-204ENST00000436984 1776 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
GP1BBP13224 CCNA1-202ENST00000440264 1758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
GP1BBP13224 DIO3OS-212ENST00000557661 1937 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
GP1BBP13224 AHRR-204ENST00000506456 2350 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
GP1BBP13224 ADCY3-201ENST00000260600 5050 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
GP1BBP13224 CERCAM-202ENST00000372842 5201 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
GP1BBP13224 CHST11-205ENST00000549260 5696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
GP1BBP13224 OSM-201ENST00000215781 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
GP1BBP13224 SAYSD1-201ENST00000229903 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
GP1BBP13224 BUD23-201ENST00000265758 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.7 ms