Protein–RNA interactions for Protein: O94888

UBXN7, UBX domain-containing protein 7, humanhuman

Predictions only

Length 489 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBXN7O94888 KANSL1L-203ENST00000418791 3562 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
UBXN7O94888 KRT18P1-202ENST00000452408 1331 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
UBXN7O94888 CCDC74A-206ENST00000467992 1347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
UBXN7O94888 ASB6-202ENST00000277459 2180 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
UBXN7O94888 CYTH1-209ENST00000589296 2159 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
UBXN7O94888 GRAMD2B-219ENST00000544396 2822 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
UBXN7O94888 OTUD1-201ENST00000376495 2933 ntAPPRIS P1 BASIC17.73■□□□□ 0.43
UBXN7O94888 TLE4-205ENST00000376544 4871 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
UBXN7O94888 COL16A1-203ENST00000373672 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
UBXN7O94888 LTBP3-217ENST00000530785 2461 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
UBXN7O94888 RPH3A-203ENST00000543106 2581 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
UBXN7O94888 TLCD1-201ENST00000292090 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
UBXN7O94888 SWI5-201ENST00000320188 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
UBXN7O94888 LRRC27-203ENST00000368613 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
UBXN7O94888 SFTPD-201ENST00000372292 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
UBXN7O94888 IGHGP-201ENST00000390555 1178 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
UBXN7O94888 KRTAP5-11-201ENST00000398530 1021 ntAPPRIS P2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
UBXN7O94888 DECR2-202ENST00000424398 1012 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
UBXN7O94888 SDR39U1-202ENST00000538105 1041 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
UBXN7O94888 KRT126P-201ENST00000549467 1181 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
UBXN7O94888 AL133352.1-203ENST00000557395 1234 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
UBXN7O94888 MIR3180-1-201ENST00000580374 94 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
UBXN7O94888 MIR3180-3-201ENST00000584616 94 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
UBXN7O94888 TK1-205ENST00000590862 642 ntTSL 3 BASIC17.73■□□□□ 0.43
UBXN7O94888 VPS72-207ENST00000640458 689 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
UBXN7O94888 UBE2E1-202ENST00000346855 1398 ntTSL 3 BASIC17.73■□□□□ 0.43
UBXN7O94888 TSHZ3-201ENST00000240587 5176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
UBXN7O94888 SLC27A3-204ENST00000368661 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
UBXN7O94888 CBX1-202ENST00000393408 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
UBXN7O94888 TRIM13-206ENST00000457662 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
UBXN7O94888 AC009102.3-201ENST00000623118 1491 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
UBXN7O94888 ZNF213-201ENST00000396878 3313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
UBXN7O94888 CACNA1B-203ENST00000371355 9647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
UBXN7O94888 FAM72C-202ENST00000584486 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
UBXN7O94888 GBX2-203ENST00000551105 1307 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
UBXN7O94888 RPL3-201ENST00000216146 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
UBXN7O94888 FAM110A-201ENST00000246100 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
UBXN7O94888 P2RY6-201ENST00000349767 1700 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
UBXN7O94888 AL138781.2-201ENST00000617896 1843 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
UBXN7O94888 RGMB-AS1-201ENST00000498871 1903 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
UBXN7O94888 TDRKH-203ENST00000368824 2824 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
UBXN7O94888 ARHGAP9-202ENST00000393797 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
UBXN7O94888 SENP6-202ENST00000370010 4644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
UBXN7O94888 STXBP2-201ENST00000221283 1876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
UBXN7O94888 FDXR-217ENST00000582944 1766 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
UBXN7O94888 ANXA3-201ENST00000264908 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
UBXN7O94888 TLNRD1-201ENST00000267984 4845 ntAPPRIS P1 BASIC17.72■□□□□ 0.43
UBXN7O94888 HPCA-201ENST00000373467 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
UBXN7O94888 KRT89P-201ENST00000620027 1478 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
UBXN7O94888 GLYCTK-201ENST00000305690 1371 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
UBXN7O94888 RABAC1-201ENST00000222008 821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
UBXN7O94888 BOLA2B-201ENST00000305321 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
UBXN7O94888 BOLA2-201ENST00000330978 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
UBXN7O94888 CDC26-201ENST00000374206 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
UBXN7O94888 ICAM4-202ENST00000380770 1211 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
UBXN7O94888 CXCL12-204ENST00000395793 665 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
UBXN7O94888 LINC01770-202ENST00000430109 510 ntTSL 3 BASIC17.72■□□□□ 0.43
UBXN7O94888 TFF3-204ENST00000518498 1109 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
UBXN7O94888 PPOX-214ENST00000535223 664 ntTSL 3 BASIC17.72■□□□□ 0.43
UBXN7O94888 AC079385.1-201ENST00000551505 570 ntTSL 4 BASIC17.72■□□□□ 0.43
UBXN7O94888 ANKRD34C-AS1-203ENST00000559225 528 ntTSL 4 BASIC17.72■□□□□ 0.43
UBXN7O94888 ANKRD29-202ENST00000585908 846 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
UBXN7O94888 IL11-204ENST00000590625 1028 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
UBXN7O94888 RABAC1-208ENST00000601078 728 ntTSL 3 BASIC17.72■□□□□ 0.43
UBXN7O94888 MIB2-231ENST00000518681 3116 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
UBXN7O94888 TMEM250-201ENST00000418388 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
UBXN7O94888 ADPGK-201ENST00000311669 2557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
UBXN7O94888 TBC1D19-201ENST00000264866 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
UBXN7O94888 SHBG-201ENST00000340624 1311 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
UBXN7O94888 RFXANK-205ENST00000456252 1325 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
UBXN7O94888 CTSH-201ENST00000220166 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
UBXN7O94888 TRABD-203ENST00000395827 2172 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
UBXN7O94888 RNF144A-201ENST00000320892 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
UBXN7O94888 MTERF2-202ENST00000392830 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
UBXN7O94888 CTBP2-214ENST00000531469 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
UBXN7O94888 SCRIB-201ENST00000320476 5143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
UBXN7O94888 HEXDC-203ENST00000577944 1820 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
UBXN7O94888 GHDC-212ENST00000593209 1827 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
UBXN7O94888 TNNC1-201ENST00000232975 714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
UBXN7O94888 ELANE-201ENST00000263621 920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
UBXN7O94888 LENG8-AS1-201ENST00000416022 582 ntTSL 3 BASIC17.71■□□□□ 0.43
UBXN7O94888 SSR4P1-202ENST00000429427 967 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
UBXN7O94888 DUSP5P1-201ENST00000441325 1139 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
UBXN7O94888 AC073111.4-202ENST00000486297 585 ntTSL 4 BASIC17.71■□□□□ 0.43
UBXN7O94888 MRPL2-208ENST00000489623 570 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
UBXN7O94888 MIR3652-201ENST00000579335 131 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
UBXN7O94888 AC090616.6-201ENST00000582640 721 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
UBXN7O94888 CHMP2A-208ENST00000601220 885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
UBXN7O94888 MOXD1-203ENST00000392401 2191 ntTSL 4 BASIC17.71■□□□□ 0.43
UBXN7O94888 SHC3-202ENST00000375835 9768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
UBXN7O94888 CDCA7L-203ENST00000406877 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
UBXN7O94888 WNT8A-204ENST00000506684 1543 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
UBXN7O94888 PDP1-208ENST00000520728 2554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
UBXN7O94888 SIDT2-217ENST00000532062 2143 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.42
UBXN7O94888 TCTN1-223ENST00000550703 2149 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.42
UBXN7O94888 PRSS33-201ENST00000293851 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
UBXN7O94888 NFATC1-217ENST00000591814 4819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
UBXN7O94888 HOXC10-201ENST00000303460 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
UBXN7O94888 TMEM222-201ENST00000374076 1599 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
UBXN7O94888 ZNF213-202ENST00000416391 2996 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.8 ms