Protein–RNA interactions for Protein: O75923

DYSF, Dysferlin, humanhuman

Predictions only

Length 2,080 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DYSFO75923 FA2H-201ENST00000219368 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
DYSFO75923 IL34-201ENST00000288098 1607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
DYSFO75923 ARHGEF2-204ENST00000368315 1645 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
DYSFO75923 LINC01126-201ENST00000623515 1646 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
DYSFO75923 MCOLN2-201ENST00000284027 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
DYSFO75923 NPEPL1-203ENST00000525817 1780 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
DYSFO75923 BRMS1L-201ENST00000216807 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
DYSFO75923 ZKSCAN7-205ENST00000426540 2791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
DYSFO75923 SHISA7-201ENST00000376325 6033 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
DYSFO75923 NEUROD2-201ENST00000302584 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
DYSFO75923 CTSD-212ENST00000637815 2003 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
DYSFO75923 NBL1-212ENST00000621723 2133 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
DYSFO75923 SNN-201ENST00000329565 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
DYSFO75923 TGFBR1-201ENST00000374990 5720 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
DYSFO75923 GTF3C5-202ENST00000372097 2406 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
DYSFO75923 CECR2-202ENST00000342247 6178 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
DYSFO75923 CRHR2-207ENST00000471646 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
DYSFO75923 NFIB-201ENST00000380921 1274 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
DYSFO75923 CXorf40A-202ENST00000393985 1148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
DYSFO75923 YWHAZ-204ENST00000395953 994 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
DYSFO75923 MOBP-204ENST00000420739 940 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
DYSFO75923 AP000347.1-209ENST00000437294 557 ntTSL 4 BASIC15.36■□□□□ 0.05
DYSFO75923 CALM1-205ENST00000553542 877 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
DYSFO75923 AC099518.3-201ENST00000564808 809 ntAPPRIS P5 TSL 4 BASIC15.36■□□□□ 0.05
DYSFO75923 GPALPP1-207ENST00000611650 899 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
DYSFO75923 RNF38-202ENST00000350199 5104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
DYSFO75923 BCL11A-209ENST00000489516 1508 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
DYSFO75923 KDM4B-202ENST00000381759 3058 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
DYSFO75923 GTF2IP1-210ENST00000622829 3605 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
DYSFO75923 THOP1-205ENST00000586677 1872 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
DYSFO75923 GTF2IRD2-207ENST00000625377 1910 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
DYSFO75923 BSG-201ENST00000333511 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
DYSFO75923 KDM2A-202ENST00000398645 6511 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
DYSFO75923 KCNQ2-213ENST00000626839 9213 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
DYSFO75923 NEU4-203ENST00000404257 2352 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
DYSFO75923 CHRAC1-201ENST00000220913 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
DYSFO75923 UMOD-201ENST00000302509 2477 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
DYSFO75923 B3GNT2-201ENST00000301998 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
DYSFO75923 SH3BP1-201ENST00000357436 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
DYSFO75923 HTATSF1-204ENST00000535601 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
DYSFO75923 PDLIM4-201ENST00000253754 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
DYSFO75923 HIST1H2AI-201ENST00000358739 503 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
DYSFO75923 GNG5-202ENST00000370645 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
DYSFO75923 GUCA1A-202ENST00000372958 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
DYSFO75923 IFNLR1-205ENST00000374421 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
DYSFO75923 PLCXD1-202ENST00000381663 1863 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
DYSFO75923 VKORC1-205ENST00000394975 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
DYSFO75923 RNF216P1-205ENST00000406089 807 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
DYSFO75923 PRKRA-203ENST00000432031 1344 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
DYSFO75923 CCNG1-208ENST00000510664 994 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
DYSFO75923 AC020763.4-201ENST00000623414 4170 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
DYSFO75923 AC016734.2-201ENST00000624325 1377 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
DYSFO75923 SLC22A17-204ENST00000397267 2455 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
DYSFO75923 FAM206A-201ENST00000322940 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
DYSFO75923 IAH1-202ENST00000470914 2137 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
DYSFO75923 ADCK5-201ENST00000308860 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
DYSFO75923 SAMD14-203ENST00000503131 1938 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
DYSFO75923 LRRC27-201ENST00000344079 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
DYSFO75923 FOXP4-202ENST00000373057 3300 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
DYSFO75923 DHRS4L2-201ENST00000335125 1370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
DYSFO75923 CHRNB4-202ENST00000412074 1355 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
DYSFO75923 AC104581.1-202ENST00000635932 2618 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
DYSFO75923 BCL2L10-201ENST00000260442 1249 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
DYSFO75923 DMKN-215ENST00000451297 1111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
DYSFO75923 AP003733.1-201ENST00000491725 852 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
DYSFO75923 TPSP2-201ENST00000561760 610 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
DYSFO75923 BCL2L12-210ENST00000611631 1259 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
DYSFO75923 HTRA3-201ENST00000307358 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
DYSFO75923 AHRR-204ENST00000506456 2350 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
DYSFO75923 ZCWPW1-201ENST00000360951 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
DYSFO75923 ESAM-201ENST00000278927 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
DYSFO75923 DOC2A-208ENST00000564944 1782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
DYSFO75923 TMEM128-201ENST00000254742 1737 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
DYSFO75923 TMEM179-201ENST00000341595 2513 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
DYSFO75923 RGS20-203ENST00000344277 1667 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
DYSFO75923 CBX1-202ENST00000393408 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
DYSFO75923 CAMK2B-203ENST00000347193 1577 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
DYSFO75923 RELL2-202ENST00000444782 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
DYSFO75923 AGPAT2-205ENST00000538402 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
DYSFO75923 TRAPPC5-204ENST00000596148 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
DYSFO75923 HOXC11-201ENST00000243082 2039 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
DYSFO75923 HCLS1-201ENST00000314583 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
DYSFO75923 BLOC1S3-201ENST00000433642 2601 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
DYSFO75923 TADA3-202ENST00000343450 2554 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
DYSFO75923 HMGA1-201ENST00000311487 1920 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
DYSFO75923 PTX4-202ENST00000440447 1117 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
DYSFO75923 PDCD6-207ENST00000509581 1156 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
DYSFO75923 SLC9A3R2-208ENST00000566198 1199 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
DYSFO75923 AC111152.3-201ENST00000569699 673 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
DYSFO75923 AC124016.1-202ENST00000609575 619 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
DYSFO75923 Metazoa_SRP.104-201ENST00000622099 280 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
DYSFO75923 ASAH1-251ENST00000637561 929 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
DYSFO75923 NF2-203ENST00000353887 1845 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
DYSFO75923 HEBP2-204ENST00000607197 10014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
DYSFO75923 RGS3-202ENST00000342620 1714 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
DYSFO75923 AK1-203ENST00000373176 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
DYSFO75923 PPP2R2C-206ENST00000507294 1667 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
DYSFO75923 PSMD11-202ENST00000457654 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
DYSFO75923 NPNT-203ENST00000427316 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
DYSFO75923 AP003774.1-201ENST00000316124 2340 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.5 ms