Protein–RNA interactions for Protein: O43395

PRPF3, U4/U6 small nuclear ribonucleoprotein Prp3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 683 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRPF3O43395 RBM7-201ENST00000375490 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
PRPF3O43395 ELP5-204ENST00000396628 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
PRPF3O43395 KLHL29-203ENST00000486442 5287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
PRPF3O43395 VIM-201ENST00000224237 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
PRPF3O43395 ZNF419-207ENST00000442920 1857 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
PRPF3O43395 GBX2-203ENST00000551105 1307 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
PRPF3O43395 KMT5B-206ENST00000405515 2869 ntTSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
PRPF3O43395 KIF1BP-204ENST00000626493 2337 ntTSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
PRPF3O43395 LPAR2-201ENST00000407877 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
PRPF3O43395 BMP1-202ENST00000306385 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
PRPF3O43395 CLASRP-201ENST00000221455 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
PRPF3O43395 EWSR1-207ENST00000406548 2207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
PRPF3O43395 STAC3-201ENST00000332782 1656 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
PRPF3O43395 ST3GAL3-201ENST00000262915 2470 ntTSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
PRPF3O43395 SLC39A5-201ENST00000266980 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
PRPF3O43395 CAMK2B-203ENST00000347193 1577 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
PRPF3O43395 SLC27A4-202ENST00000372870 1557 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
PRPF3O43395 BMP2K-208ENST00000628286 3848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
PRPF3O43395 PTPA-201ENST00000337738 2845 ntTSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
PRPF3O43395 CDK13-207ENST00000613626 3099 ntTSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
PRPF3O43395 OXT-201ENST00000217386 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
PRPF3O43395 IGLL1-201ENST00000249053 716 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
PRPF3O43395 DDRGK1-202ENST00000380201 1128 ntTSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
PRPF3O43395 LEF1-AS1-201ENST00000436413 1045 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
PRPF3O43395 AC005091.1-201ENST00000441955 1190 ntTSL 3 BASIC21.02■□□□□ 0.96
PRPF3O43395 MIR3936HG-202ENST00000457998 733 ntTSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
PRPF3O43395 AC064853.5-201ENST00000641976 258 ntAPPRIS P1 BASIC21.02■□□□□ 0.96
PRPF3O43395 DSCR9-201ENST00000454482 1644 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
PRPF3O43395 RPH3A-203ENST00000543106 2581 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
PRPF3O43395 AL590648.2-201ENST00000427949 2225 ntTSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
PRPF3O43395 FOXI3-201ENST00000428390 2804 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.02■□□□□ 0.96
PRPF3O43395 TMEM206-201ENST00000261455 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
PRPF3O43395 SNAPC3-207ENST00000610884 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
PRPF3O43395 ERI1-203ENST00000519292 2107 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
PRPF3O43395 TCP11-228ENST00000611141 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
PRPF3O43395 RPL3-201ENST00000216146 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
PRPF3O43395 NEU4-203ENST00000404257 2352 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
PRPF3O43395 LINC00167-201ENST00000530583 1419 ntBASIC21.02■□□□□ 0.96
PRPF3O43395 RAB4A-201ENST00000366690 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
PRPF3O43395 ACSL6-205ENST00000379246 2622 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
PRPF3O43395 C19orf48-202ENST00000391812 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.95
PRPF3O43395 PMAIP1-202ENST00000316660 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
PRPF3O43395 MFSD2A-203ENST00000420632 1914 ntTSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.95
PRPF3O43395 ZACN-201ENST00000334586 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
PRPF3O43395 RAPH1-201ENST00000308091 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
PRPF3O43395 PNMA6E-201ENST00000445091 2192 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.95
PRPF3O43395 SH2D2A-201ENST00000368198 1599 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
PRPF3O43395 SEPT2-208ENST00000407971 3267 ntTSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.95
PRPF3O43395 ATP11C-203ENST00000370557 6924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
PRPF3O43395 PJA1-202ENST00000374571 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
PRPF3O43395 DNLZ-202ENST00000371739 2934 ntTSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
PRPF3O43395 KRT6A-201ENST00000330722 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
PRPF3O43395 JKAMP-201ENST00000261247 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
PRPF3O43395 MVK-201ENST00000228510 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
PRPF3O43395 FNBP1-201ENST00000355681 1977 ntTSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
PRPF3O43395 TAPT1-201ENST00000405303 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
PRPF3O43395 CRELD2-201ENST00000328268 1357 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
PRPF3O43395 ATP1B1-201ENST00000367815 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
PRPF3O43395 ACTN4-202ENST00000390009 2102 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
PRPF3O43395 LONRF1-208ENST00000533751 3043 ntTSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
PRPF3O43395 MARK2-201ENST00000350490 2903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
PRPF3O43395 RPA2-201ENST00000313433 1237 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
PRPF3O43395 DAP-202ENST00000432074 1048 ntTSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
PRPF3O43395 HOXD8-203ENST00000450510 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
PRPF3O43395 AC116353.4-201ENST00000507279 576 ntTSL 4 BASIC21.01■□□□□ 0.95
PRPF3O43395 TMEM218-206ENST00000527766 812 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.01■□□□□ 0.95
PRPF3O43395 AL136038.3-201ENST00000561909 1096 ntBASIC21.01■□□□□ 0.95
PRPF3O43395 CLDN7-204ENST00000571881 735 ntTSL 3 BASIC21.01■□□□□ 0.95
PRPF3O43395 ADORA2A-214ENST00000611543 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
PRPF3O43395 DCST1-204ENST00000423025 2199 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
PRPF3O43395 DBN1-201ENST00000292385 3072 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
PRPF3O43395 AC132938.6-201ENST00000623828 1655 ntBASIC21.01■□□□□ 0.95
PRPF3O43395 POMC-204ENST00000405623 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
PRPF3O43395 IL15-201ENST00000296545 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
PRPF3O43395 SYT3-206ENST00000600079 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
PRPF3O43395 PPP2R2C-209ENST00000515571 1832 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
PRPF3O43395 SHISA3-201ENST00000319234 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
PRPF3O43395 SMIM24-201ENST00000215531 1329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
PRPF3O43395 NTMT1-203ENST00000372483 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
PRPF3O43395 AGFG2-201ENST00000300176 4796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
PRPF3O43395 IDUA-210ENST00000514224 2130 ntTSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
PRPF3O43395 MID1IP1-201ENST00000336949 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
PRPF3O43395 TRIM13-206ENST00000457662 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
PRPF3O43395 RAPGEF5-203ENST00000405243 2800 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
PRPF3O43395 AC005865.2-201ENST00000505276 2303 ntTSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
PRPF3O43395 LSM11-201ENST00000286307 6584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
PRPF3O43395 FMR1-206ENST00000370477 3437 ntTSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
PRPF3O43395 C20orf196-201ENST00000303142 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
PRPF3O43395 AC004540.1-201ENST00000439120 891 ntTSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
PRPF3O43395 AP003733.1-201ENST00000491725 852 ntBASIC21■□□□□ 0.95
PRPF3O43395 LCN10-205ENST00000497771 723 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
PRPF3O43395 AP005717.1-202ENST00000523563 419 ntTSL 3 BASIC21■□□□□ 0.95
PRPF3O43395 MRPL52-215ENST00000556840 398 ntTSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
PRPF3O43395 CLN6-204ENST00000564752 900 ntTSL 3 BASIC21■□□□□ 0.95
PRPF3O43395 LIMD2-211ENST00000583211 1298 ntTSL 3 BASIC21■□□□□ 0.95
PRPF3O43395 WDR6-223ENST00000627177 207 ntTSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
PRPF3O43395 CLN6-214ENST00000636314 442 ntTSL 3 BASIC21■□□□□ 0.95
PRPF3O43395 LINC00311-201ENST00000366314 1566 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
PRPF3O43395 CRYL1-202ENST00000382812 1581 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
PRPF3O43395 BMS1P4-202ENST00000584747 1716 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.9 ms